RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425336.1

C21orf59-204, Transcript of UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

TSL 2

Gene C21orf59, Length 873 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59-204ENST00000425336 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.05■■■■□ 3.04
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C21orf59-204ENST00000425336 SCRIBQ14160 1630 aa28.02■■■□□ 2.08
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C21orf59-204ENST00000425336 SMARCA2P51531 1590 aa26.65■■□□□ 1.86
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C21orf59-204ENST00000425336 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
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C21orf59-204ENST00000425336 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.14■■□□□ 1.77
C21orf59-204ENST00000425336 CADPSQ9ULU8 1353 aa26■■□□□ 1.75
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C21orf59-204ENST00000425336 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.96■■□□□ 1.75
C21orf59-204ENST00000425336 WDR62O43379 1518 aa25.91■■□□□ 1.74
C21orf59-204ENST00000425336 TRIM41Q8WV44 630 aa25.86■■□□□ 1.73
C21orf59-204ENST00000425336 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.8■■□□□ 1.72
C21orf59-204ENST00000425336 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.74■■□□□ 1.71
C21orf59-204ENST00000425336 CFTRP13569 1480 aa25.65■■□□□ 1.7
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C21orf59-204ENST00000425336 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
C21orf59-204ENST00000425336 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
C21orf59-204ENST00000425336 OSCARQ8IYS5 282 aa25.51■■□□□ 1.67
C21orf59-204ENST00000425336 PRDM2Q13029 1718 aa25.49■■□□□ 1.67
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C21orf59-204ENST00000425336 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
C21orf59-204ENST00000425336 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
C21orf59-204ENST00000425336 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
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C21orf59-204ENST00000425336 IFT140Q96RY7 1462 aa25.28■■□□□ 1.64
C21orf59-204ENST00000425336 TOPBP1Q92547 1522 aa25.22■■□□□ 1.63
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C21orf59-204ENST00000425336 ARHGEF11O15085 1522 aa25.16■■□□□ 1.62
C21orf59-204ENST00000425336 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.12■■□□□ 1.61
C21orf59-204ENST00000425336 ABCC8Q09428 1581 aa25.11■■□□□ 1.61
C21orf59-204ENST00000425336 CHD1O14646 1710 aa25.08■■□□□ 1.61
C21orf59-204ENST00000425336 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
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C21orf59-204ENST00000425336 FBLN2P98095 1184 aa24.92■■□□□ 1.58
C21orf59-204ENST00000425336 ARAP1Q96P48 1450 aa24.89■■□□□ 1.57
C21orf59-204ENST00000425336 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.88■■□□□ 1.57
C21orf59-204ENST00000425336 SOGA1O94964 1423 aa24.81■■□□□ 1.56
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C21orf59-204ENST00000425336 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.77■■□□□ 1.56
C21orf59-204ENST00000425336 WDR97A6NE52 1622 aa24.73■■□□□ 1.55
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C21orf59-204ENST00000425336 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
C21orf59-204ENST00000425336 GRIN2BQ13224 1484 aa24.64■■□□□ 1.53
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C21orf59-204ENST00000425336 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.52■■□□□ 1.52
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C21orf59-204ENST00000425336 GRIN2AQ12879 1464 aa24.33■■□□□ 1.49
C21orf59-204ENST00000425336 ADAMTS12P58397 1594 aa24.31■■□□□ 1.48
C21orf59-204ENST00000425336 CEP170Q5SW79 1584 aa24.29■■□□□ 1.48
C21orf59-204ENST00000425336 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
C21orf59-204ENST00000425336 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
C21orf59-204ENST00000425336 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.24■■□□□ 1.47
C21orf59-204ENST00000425336 NUP160Q12769 1436 aa24.24■■□□□ 1.47
C21orf59-204ENST00000425336 TOP2BQ02880 1626 aa24.22■■□□□ 1.47
C21orf59-204ENST00000425336 SHROOM2Q13796 1616 aa24.2■■□□□ 1.46
C21orf59-204ENST00000425336 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.18■■□□□ 1.46
C21orf59-204ENST00000425336 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.13■■□□□ 1.45
C21orf59-204ENST00000425336 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.1■■□□□ 1.45
C21orf59-204ENST00000425336 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
C21orf59-204ENST00000425336 JPH4Q96JJ6 628 aa23.98■■□□□ 1.43
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