RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300260.7

C21orf59-202, Transcript of UPF0769 protein C21orf59, humanhuman

TSL 2

Gene C21orf59, Length 1,243 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf59-202ENST00000300260 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.28■■■■■ 4.52
C21orf59-202ENST00000300260 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.39■■■■□ 3.74
C21orf59-202ENST00000300260 ABCC9O60706 1549 aa37.56■■■■□ 3.6
C21orf59-202ENST00000300260 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.21■■■■□ 3.39
C21orf59-202ENST00000300260 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.14■■■■□ 3.38
C21orf59-202ENST00000300260 NACADO15069 1562 aa36.11■■■■□ 3.37
C21orf59-202ENST00000300260 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
C21orf59-202ENST00000300260 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.92■■■■□ 3.34
C21orf59-202ENST00000300260 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.8■■■■□ 3.32
C21orf59-202ENST00000300260 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.26■■■■□ 3.23
C21orf59-202ENST00000300260 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.15■■■■□ 3.22
C21orf59-202ENST00000300260 SCRIBQ14160 1630 aa35.08■■■■□ 3.21
C21orf59-202ENST00000300260 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.03■■■■□ 3.2
C21orf59-202ENST00000300260 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.66■■■■□ 3.14
C21orf59-202ENST00000300260 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.42■■■■□ 3.1
C21orf59-202ENST00000300260 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
C21orf59-202ENST00000300260 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.94■■■■□ 3.02
C21orf59-202ENST00000300260 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.74■■■□□ 2.99
C21orf59-202ENST00000300260 SMARCA4P51532 1647 aa33.54■■■□□ 2.96
C21orf59-202ENST00000300260 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
C21orf59-202ENST00000300260 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.37■■■□□ 2.93
C21orf59-202ENST00000300260 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.36■■■□□ 2.93
C21orf59-202ENST00000300260 NCAPD3P42695 1498 aa33.34■■■□□ 2.93
C21orf59-202ENST00000300260 SMARCA2P51531 1590 aa33.32■■■□□ 2.92
C21orf59-202ENST00000300260 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.21■■■□□ 2.91
C21orf59-202ENST00000300260 HMGXB3Q12766 1538 aa33.16■■■□□ 2.9
C21orf59-202ENST00000300260 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.11■■■□□ 2.89
C21orf59-202ENST00000300260 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.02■■■□□ 2.88
C21orf59-202ENST00000300260 WIZO95785 1651 aa32.99■■■□□ 2.87
C21orf59-202ENST00000300260 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
C21orf59-202ENST00000300260 NESP48681 1621 aa32.52■■■□□ 2.8
C21orf59-202ENST00000300260 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.43■■■□□ 2.78
C21orf59-202ENST00000300260 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.39■■■□□ 2.78
C21orf59-202ENST00000300260 ERCC6Q03468 1493 aa32.37■■■□□ 2.77
C21orf59-202ENST00000300260 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
C21orf59-202ENST00000300260 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.29■■■□□ 2.76
C21orf59-202ENST00000300260 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.25■■■□□ 2.75
C21orf59-202ENST00000300260 CFTRP13569 1480 aa32.2■■■□□ 2.75
C21orf59-202ENST00000300260 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.09■■■□□ 2.73
C21orf59-202ENST00000300260 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.01■■■□□ 2.71
C21orf59-202ENST00000300260 CUX2O14529 1486 aa31.97■■■□□ 2.71
C21orf59-202ENST00000300260 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.97■■■□□ 2.71
C21orf59-202ENST00000300260 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.96■■■□□ 2.71
C21orf59-202ENST00000300260 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.89■■■□□ 2.7
C21orf59-202ENST00000300260 PRDM2Q13029 1718 aa31.88■■■□□ 2.69
C21orf59-202ENST00000300260 WDR62O43379 1518 aa31.76■■■□□ 2.68
C21orf59-202ENST00000300260 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.68■■■□□ 2.66
C21orf59-202ENST00000300260 ABCC8Q09428 1581 aa31.51■■■□□ 2.63
C21orf59-202ENST00000300260 TOPBP1Q92547 1522 aa31.49■■■□□ 2.63
C21orf59-202ENST00000300260 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.45■■■□□ 2.63
C21orf59-202ENST00000300260 IFT140Q96RY7 1462 aa31.29■■■□□ 2.6
C21orf59-202ENST00000300260 CUX1P39880 1505 aa31.29■■■□□ 2.6
C21orf59-202ENST00000300260 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
C21orf59-202ENST00000300260 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.18■■■□□ 2.58
C21orf59-202ENST00000300260 SOGA1O94964 1423 aa31.14■■■□□ 2.58
C21orf59-202ENST00000300260 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.14■■■□□ 2.58
C21orf59-202ENST00000300260 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.57
C21orf59-202ENST00000300260 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
C21orf59-202ENST00000300260 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.12■■■□□ 2.57
C21orf59-202ENST00000300260 TOP2BQ02880 1626 aa31.03■■■□□ 2.56
C21orf59-202ENST00000300260 SYNJ1O43426 1573 aa31.03■■■□□ 2.56
C21orf59-202ENST00000300260 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.01■■■□□ 2.55
C21orf59-202ENST00000300260 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.99■■■□□ 2.557e-10■■■■□ 20.8
C21orf59-202ENST00000300260 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
C21orf59-202ENST00000300260 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
C21orf59-202ENST00000300260 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.94■■■□□ 2.54
C21orf59-202ENST00000300260 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.88■■■□□ 2.53
C21orf59-202ENST00000300260 WDR97A6NE52 1622 aa30.87■■■□□ 2.53
C21orf59-202ENST00000300260 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.76■■■□□ 2.52
C21orf59-202ENST00000300260 GRIN2BQ13224 1484 aa30.75■■■□□ 2.51
C21orf59-202ENST00000300260 OSCARQ8IYS5 282 aa30.72■■■□□ 2.51
C21orf59-202ENST00000300260 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.72■■■□□ 2.51
C21orf59-202ENST00000300260 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.7■■■□□ 2.5
C21orf59-202ENST00000300260 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.64■■■□□ 2.5
C21orf59-202ENST00000300260 FBLN2P98095 1184 aa30.64■■■□□ 2.5
C21orf59-202ENST00000300260 PBRM1Q86U86 1689 aa30.64■■■□□ 2.5
C21orf59-202ENST00000300260 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
C21orf59-202ENST00000300260 CHD1O14646 1710 aa30.56■■■□□ 2.48
C21orf59-202ENST00000300260 SYNJ2O15056 1496 aa30.53■■■□□ 2.48
C21orf59-202ENST00000300260 TRIM41Q8WV44 630 aa30.5■■■□□ 2.47
C21orf59-202ENST00000300260 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.5■■■□□ 2.47
C21orf59-202ENST00000300260 KIF27Q86VH2 1401 aa30.48■■■□□ 2.47
C21orf59-202ENST00000300260 ADAMTS12P58397 1594 aa30.42■■■□□ 2.46
C21orf59-202ENST00000300260 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.41■■■□□ 2.46
C21orf59-202ENST00000300260 IGF1RP08069 1367 aa30.37■■■□□ 2.45
C21orf59-202ENST00000300260 GRIN2AQ12879 1464 aa30.34■■■□□ 2.45
C21orf59-202ENST00000300260 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.26■■■□□ 2.43
C21orf59-202ENST00000300260 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.23■■■□□ 2.43
C21orf59-202ENST00000300260 CUL7Q14999 1698 aa30.22■■■□□ 2.43
C21orf59-202ENST00000300260 NUP160Q12769 1436 aa30.21■■■□□ 2.43
C21orf59-202ENST00000300260 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.19■■■□□ 2.42
C21orf59-202ENST00000300260 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.18■■■□□ 2.42
C21orf59-202ENST00000300260 CEP170Q5SW79 1584 aa30.18■■■□□ 2.42
C21orf59-202ENST00000300260 ARHGEF11O15085 1522 aa30.17■■■□□ 2.42
C21orf59-202ENST00000300260 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.15■■■□□ 2.42
C21orf59-202ENST00000300260 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.15■■■□□ 2.42
C21orf59-202ENST00000300260 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.15■■■□□ 2.42
C21orf59-202ENST00000300260 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30■■■□□ 2.39
C21orf59-202ENST00000300260 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.95■■■□□ 2.38
C21orf59-202ENST00000300260 EEA1Q15075 1411 aa29.95■■■□□ 2.38
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