Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RBM4-208ENST00000510173 782 ntTSL 315.09■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 RBM4-205ENST00000409406 2321 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.272e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 RBM4-210ENST00000528039 764 ntTSL 311.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.061e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 21e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 CAMKK2-205ENST00000392474 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 CAMKK2-216ENST00000545538 3797 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 FXR1-209ENST00000472339 2130 ntTSL 515.79■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -03e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 FXR1-220ENST00000491062 1768 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.323e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 FXR1-211ENST00000475315 2341 ntTSL 212.33□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 FXR1-201ENST00000305586 3277 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.453e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 FXR1-207ENST00000468861 1989 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.473e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 FXR1-203ENST00000445140 2651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 GTPBP2-207ENST00000459959 721 ntTSL 27.93□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.893e-7■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 37.6
UTP3Q9NQZ2 PPP6R1-206ENST00000591323 848 ntTSL 316.86■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 37.5
UTP3Q9NQZ2 C3orf35-204ENST00000425932 1528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 37.5
UTP3Q9NQZ2 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.762e-6■■■■■ 37.5
UTP3Q9NQZ2 EPB41-208ENST00000460378 5212 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 37.5
UTP3Q9NQZ2 FASN-211ENST00000637026 100 ntTSL 510.79□□□□□ -0.687e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-223ENST00000523270 575 ntTSL 421.96■■□□□ 1.112e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-215ENST00000521174 485 ntTSL 520.09■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-205ENST00000518028 516 ntTSL 418.57■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-211ENST00000519430 562 ntTSL 418.57■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-213ENST00000520472 912 ntTSL 518.57■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.542e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-221ENST00000522458 623 ntTSL 417.27■□□□□ 0.362e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-208ENST00000519211 620 ntTSL 316.99■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.312e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-206ENST00000518775 920 ntTSL 516.44■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-203ENST00000517568 692 ntTSL 416.37■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-207ENST00000518782 550 ntTSL 416.37■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-222ENST00000522644 1027 ntTSL 515.38■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-209ENST00000519394 500 ntTSL 315.14■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-219ENST00000521729 1068 ntTSL 215.14■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 CNOT8-212ENST00000519903 648 ntTSL 414.27□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-212ENST00000496594 2103 ntTSL 524.1■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 ZNHIT6-201ENST00000370574 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.243e-6■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 ZNHIT6-202ENST00000431532 6080 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 DIAPH1-213ENST00000523100 1180 ntTSL 525.47■■□□□ 1.672e-7■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 AARS-203ENST00000565361 839 ntTSL 512.67□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 37.4
UTP3Q9NQZ2 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.227e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.037e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPDL-202ENST00000349655 1402 ntTSL 1 (best)18.45■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPDL-205ENST00000514511 1143 ntTSL 217.45■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 IMMT-207ENST00000449247 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 IMMT-202ENST00000409051 2515 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAM117A-202ENST00000503573 776 ntTSL 511.96□□□□□ -0.492e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.065e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.163e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.163e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 VASP-208ENST00000589627 696 ntTSL 325.07■■□□□ 1.62e-13■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PABPC4-207ENST00000451091 898 ntTSL 324.86■■□□□ 1.572e-10■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.562e-13■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RNASEH2A-203ENST00000590279 696 ntTSL 324.44■■□□□ 1.53e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 VASP-211ENST00000592139 424 ntTSL 324.1■■□□□ 1.452e-13■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 LEPROT-202ENST00000475108 492 ntTSL 322.95■■□□□ 1.263e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.253e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FERMT3-204ENST00000540957 588 ntTSL 522.82■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-206ENST00000525717 1257 ntTSL 322.44■■□□□ 1.182e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RBM42-207ENST00000592526 1012 ntTSL 222.07■■□□□ 1.122e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 VASP-210ENST00000590603 388 ntTSL 221.82■■□□□ 1.082e-13■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RNASEH2A-202ENST00000590121 859 ntTSL 221.64■■□□□ 1.053e-7■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 PIEZO1-209ENST00000490756 446 ntTSL 321.5■■□□□ 1.032e-9■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.982e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 VASP-202ENST00000586014 1725 ntTSL 521.1■□□□□ 0.972e-13■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-215ENST00000533476 1912 ntTSL 220.76■□□□□ 0.912e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 SUB1-205ENST00000504789 570 ntTSL 420.75■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 EXT2-205ENST00000527014 580 ntTSL 420.56■□□□□ 0.883e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 EXT2-209ENST00000532479 580 ntTSL 420.38■□□□□ 0.853e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 CLASRP-208ENST00000587472 345 ntTSL 220.27■□□□□ 0.843e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-204ENST00000524762 763 ntTSL 320.22■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-211ENST00000531056 560 ntTSL 420.22■□□□□ 0.832e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-212ENST00000531625 542 ntTSL 220.08■□□□□ 0.812e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 VASP-203ENST00000586619 655 ntTSL 220.04■□□□□ 0.82e-13■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-208ENST00000527421 1085 ntTSL 519.88■□□□□ 0.772e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-216ENST00000487668 1040 ntTSL 519.51■□□□□ 0.713e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.73e-6■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 UBXN1-203ENST00000436354 592 ntTSL 219.38■□□□□ 0.692e-8■■■■■ 37.3
UTP3Q9NQZ2 RAVER1-202ENST00000585935 470 ntTSL 319.28■□□□□ 0.682e-10■■■■■ 37.3
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 4677.5 ms