RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590279.1

RNASEH2A-203, Transcript of ribonuclease H2 subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene RNASEH2A, Length 696 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH2A-203ENST00000590279 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.67■■■■■ 6.82
RNASEH2A-203ENST00000590279 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.75■■■■■ 5.87
RNASEH2A-203ENST00000590279 ABCC9O60706 1549 aa51.64■■■■■ 5.86
RNASEH2A-203ENST00000590279 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.17■■■■■ 5.46
RNASEH2A-203ENST00000590279 NACADO15069 1562 aa48.83■■■■■ 5.41
RNASEH2A-203ENST00000590279 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.65■■■■■ 5.38
RNASEH2A-203ENST00000590279 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.3■■■■■ 5.32
RNASEH2A-203ENST00000590279 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.27■■■■■ 5.32
RNASEH2A-203ENST00000590279 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.12■■■■■ 5.29
RNASEH2A-203ENST00000590279 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.07■■■■■ 5.29
RNASEH2A-203ENST00000590279 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.82■■■■■ 5.25
RNASEH2A-203ENST00000590279 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.77■■■■■ 5.24
RNASEH2A-203ENST00000590279 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.59■■■■■ 5.21
RNASEH2A-203ENST00000590279 SCRIBQ14160 1630 aa47.22■■■■■ 5.15
RNASEH2A-203ENST00000590279 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.99■■■■■ 5.11
RNASEH2A-203ENST00000590279 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.68■■■■■ 5.06
RNASEH2A-203ENST00000590279 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
RNASEH2A-203ENST00000590279 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.46■■■■■ 5.03
RNASEH2A-203ENST00000590279 NCAPD3P42695 1498 aa45.04■■■■■ 4.8
RNASEH2A-203ENST00000590279 SMARCA4P51532 1647 aa45.01■■■■■ 4.8
RNASEH2A-203ENST00000590279 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.97■■■■■ 4.79
RNASEH2A-203ENST00000590279 SMARCA2P51531 1590 aa44.85■■■■■ 4.77
RNASEH2A-203ENST00000590279 HMGXB3Q12766 1538 aa44.76■■■■■ 4.76
RNASEH2A-203ENST00000590279 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.75
RNASEH2A-203ENST00000590279 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.55■■■■■ 4.72
RNASEH2A-203ENST00000590279 ERCC6Q03468 1493 aa44.54■■■■■ 4.72
RNASEH2A-203ENST00000590279 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.52■■■■■ 4.72
RNASEH2A-203ENST00000590279 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.48■■■■■ 4.71
RNASEH2A-203ENST00000590279 NESP48681 1621 aa44.41■■■■■ 4.7
RNASEH2A-203ENST00000590279 CUX2O14529 1486 aa44.37■■■■■ 4.69
RNASEH2A-203ENST00000590279 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.2■■■■■ 4.67
RNASEH2A-203ENST00000590279 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.07■■■■■ 4.65
RNASEH2A-203ENST00000590279 WIZO95785 1651 aa44.03■■■■■ 4.64
RNASEH2A-203ENST00000590279 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.94■■■■■ 4.62
RNASEH2A-203ENST00000590279 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.94■■■■■ 4.62
RNASEH2A-203ENST00000590279 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.75■■■■■ 4.59
RNASEH2A-203ENST00000590279 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.68■■■■■ 4.58
RNASEH2A-203ENST00000590279 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.55■■■■■ 4.56
RNASEH2A-203ENST00000590279 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.41■■■■■ 4.54
RNASEH2A-203ENST00000590279 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
RNASEH2A-203ENST00000590279 WDR62O43379 1518 aa43.32■■■■■ 4.52
RNASEH2A-203ENST00000590279 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.27■■■■■ 4.52
RNASEH2A-203ENST00000590279 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.24■■■■■ 4.51
RNASEH2A-203ENST00000590279 CFTRP13569 1480 aa43.23■■■■■ 4.51
RNASEH2A-203ENST00000590279 PRDM2Q13029 1718 aa43.02■■■■■ 4.48
RNASEH2A-203ENST00000590279 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.91■■■■■ 4.46
RNASEH2A-203ENST00000590279 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.89■■■■■ 4.46
RNASEH2A-203ENST00000590279 TOPBP1Q92547 1522 aa42.46■■■■■ 4.39
RNASEH2A-203ENST00000590279 TRIM41Q8WV44 630 aa42.41■■■■■ 4.38
RNASEH2A-203ENST00000590279 IFT140Q96RY7 1462 aa42.37■■■■■ 4.37
RNASEH2A-203ENST00000590279 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.36■■■■■ 4.37
RNASEH2A-203ENST00000590279 OSCARQ8IYS5 282 aa42.34■■■■■ 4.37
RNASEH2A-203ENST00000590279 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.31■■■■■ 4.36
RNASEH2A-203ENST00000590279 ABCC8Q09428 1581 aa42.29■■■■■ 4.36
RNASEH2A-203ENST00000590279 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
RNASEH2A-203ENST00000590279 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.09■■■■■ 4.33
RNASEH2A-203ENST00000590279 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
RNASEH2A-203ENST00000590279 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.98■■■■■ 4.314e-12■■■■□ 26.3
RNASEH2A-203ENST00000590279 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.92■■■■■ 4.3
RNASEH2A-203ENST00000590279 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.92■■■■■ 4.3
RNASEH2A-203ENST00000590279 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.92■■■■■ 4.3
RNASEH2A-203ENST00000590279 CHD1O14646 1710 aa41.92■■■■■ 4.3
RNASEH2A-203ENST00000590279 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.89■■■■■ 4.3
RNASEH2A-203ENST00000590279 SOGA1O94964 1423 aa41.8■■■■■ 4.28
RNASEH2A-203ENST00000590279 CUX1P39880 1505 aa41.79■■■■■ 4.28
RNASEH2A-203ENST00000590279 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.79■■■■■ 4.28
RNASEH2A-203ENST00000590279 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
RNASEH2A-203ENST00000590279 ARHGEF11O15085 1522 aa41.74■■■■■ 4.27
RNASEH2A-203ENST00000590279 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
RNASEH2A-203ENST00000590279 FBLN2P98095 1184 aa41.68■■■■■ 4.26
RNASEH2A-203ENST00000590279 WDR97A6NE52 1622 aa41.6■■■■■ 4.25
RNASEH2A-203ENST00000590279 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.56■■■■■ 4.24
RNASEH2A-203ENST00000590279 PBRM1Q86U86 1689 aa41.43■■■■■ 4.22
RNASEH2A-203ENST00000590279 GRIN2BQ13224 1484 aa41.41■■■■■ 4.22
RNASEH2A-203ENST00000590279 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.41■■■■■ 4.22
RNASEH2A-203ENST00000590279 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
RNASEH2A-203ENST00000590279 ARAP1Q96P48 1450 aa41.34■■■■■ 4.21
RNASEH2A-203ENST00000590279 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
RNASEH2A-203ENST00000590279 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.32■■■■■ 4.2
RNASEH2A-203ENST00000590279 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.31■■■■■ 4.2
RNASEH2A-203ENST00000590279 SYNJ1O43426 1573 aa41.29■■■■■ 4.2
RNASEH2A-203ENST00000590279 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.28■■■■■ 4.2
RNASEH2A-203ENST00000590279 SYNJ2O15056 1496 aa41.28■■■■■ 4.2
RNASEH2A-203ENST00000590279 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.27■■■■■ 4.2
RNASEH2A-203ENST00000590279 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.18■■■■■ 4.18
RNASEH2A-203ENST00000590279 TOP2BQ02880 1626 aa41.15■■■■■ 4.18
RNASEH2A-203ENST00000590279 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.11■■■■■ 4.17
RNASEH2A-203ENST00000590279 ADAMTS12P58397 1594 aa40.95■■■■■ 4.15
RNASEH2A-203ENST00000590279 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.92■■■■■ 4.14
RNASEH2A-203ENST00000590279 GRIN2AQ12879 1464 aa40.91■■■■■ 4.14
RNASEH2A-203ENST00000590279 CEP170Q5SW79 1584 aa40.82■■■■■ 4.12
RNASEH2A-203ENST00000590279 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.77■■■■■ 4.12
RNASEH2A-203ENST00000590279 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.76■■■■■ 4.11
RNASEH2A-203ENST00000590279 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.74■■■■■ 4.11
RNASEH2A-203ENST00000590279 NUP160Q12769 1436 aa40.74■■■■■ 4.11
RNASEH2A-203ENST00000590279 SHROOM2Q13796 1616 aa40.62■■■■■ 4.09
RNASEH2A-203ENST00000590279 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.37■■■■■ 4.05
RNASEH2A-203ENST00000590279 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
RNASEH2A-203ENST00000590279 JPH4Q96JJ6 628 aa40.32■■■■■ 4.05
RNASEH2A-203ENST00000590279 KIF27Q86VH2 1401 aa40.27■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms