RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435572.6

NFE2-202, Transcript of nuclear factor, erythroid 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NFE2, Length 1,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2-202ENST00000435572 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.88■■■■□ 3.81
NFE2-202ENST00000435572 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.04■■■■□ 3.04
NFE2-202ENST00000435572 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.65■■■□□ 2.82
NFE2-202ENST00000435572 ABCC9O60706 1549 aa32.24■■■□□ 2.75
NFE2-202ENST00000435572 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.15■■■□□ 2.74
NFE2-202ENST00000435572 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.11■■■□□ 2.73
NFE2-202ENST00000435572 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.76■■■□□ 2.67
NFE2-202ENST00000435572 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.69■■■□□ 2.66
NFE2-202ENST00000435572 NACADO15069 1562 aa31.66■■■□□ 2.66
NFE2-202ENST00000435572 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.45■■■□□ 2.62
NFE2-202ENST00000435572 SCRIBQ14160 1630 aa31.31■■■□□ 2.6
NFE2-202ENST00000435572 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.93■■■□□ 2.54
NFE2-202ENST00000435572 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.49■■■□□ 2.47
NFE2-202ENST00000435572 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
NFE2-202ENST00000435572 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.33■■■□□ 2.45
NFE2-202ENST00000435572 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.22■■■□□ 2.43
NFE2-202ENST00000435572 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
NFE2-202ENST00000435572 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.05■■■□□ 2.4
NFE2-202ENST00000435572 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
NFE2-202ENST00000435572 SMARCA4P51532 1647 aa29.97■■■□□ 2.39
NFE2-202ENST00000435572 WIZO95785 1651 aa29.86■■■□□ 2.37
NFE2-202ENST00000435572 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
NFE2-202ENST00000435572 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.56■■■□□ 2.32
NFE2-202ENST00000435572 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
NFE2-202ENST00000435572 SMARCA2P51531 1590 aa29.45■■■□□ 2.31
NFE2-202ENST00000435572 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.43■■■□□ 2.3
NFE2-202ENST00000435572 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
NFE2-202ENST00000435572 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.2■■■□□ 2.26
NFE2-202ENST00000435572 HMGXB3Q12766 1538 aa29.19■■■□□ 2.26
NFE2-202ENST00000435572 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.16■■■□□ 2.26
NFE2-202ENST00000435572 NCAPD3P42695 1498 aa29.16■■■□□ 2.26
NFE2-202ENST00000435572 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.98■■■□□ 2.23
NFE2-202ENST00000435572 ABCC8Q09428 1581 aa28.6■■■□□ 2.17
NFE2-202ENST00000435572 TRIM41Q8WV44 630 aa28.56■■■□□ 2.16
NFE2-202ENST00000435572 PRDM2Q13029 1718 aa28.55■■■□□ 2.16
NFE2-202ENST00000435572 CFTRP13569 1480 aa28.51■■■□□ 2.15
NFE2-202ENST00000435572 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.44■■■□□ 2.14
NFE2-202ENST00000435572 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.41■■■□□ 2.14
NFE2-202ENST00000435572 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.36■■■□□ 2.135e-8■■■■□ 24.1
NFE2-202ENST00000435572 SYNJ1O43426 1573 aa28.31■■■□□ 2.12
NFE2-202ENST00000435572 NESP48681 1621 aa28.28■■■□□ 2.12
NFE2-202ENST00000435572 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.27■■■□□ 2.12
NFE2-202ENST00000435572 TOP2BQ02880 1626 aa28.18■■■□□ 2.1
NFE2-202ENST00000435572 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.18■■■□□ 2.1
NFE2-202ENST00000435572 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.15■■■□□ 2.1
NFE2-202ENST00000435572 CUX1P39880 1505 aa28.12■■■□□ 2.09
NFE2-202ENST00000435572 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
NFE2-202ENST00000435572 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.03■■■□□ 2.08
NFE2-202ENST00000435572 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.01■■■□□ 2.07
NFE2-202ENST00000435572 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28■■■□□ 2.07
NFE2-202ENST00000435572 SOGA1O94964 1423 aa27.96■■■□□ 2.07
NFE2-202ENST00000435572 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.92■■■□□ 2.06
NFE2-202ENST00000435572 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.9■■■□□ 2.06
NFE2-202ENST00000435572 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.88■■■□□ 2.05
NFE2-202ENST00000435572 EEA1Q15075 1411 aa27.86■■■□□ 2.05
NFE2-202ENST00000435572 TOPBP1Q92547 1522 aa27.85■■■□□ 2.05
NFE2-202ENST00000435572 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.84■■■□□ 2.05
NFE2-202ENST00000435572 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
NFE2-202ENST00000435572 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.73■■■□□ 2.03
NFE2-202ENST00000435572 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.7■■■□□ 2.02
NFE2-202ENST00000435572 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
NFE2-202ENST00000435572 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.69■■■□□ 2.02
NFE2-202ENST00000435572 ERCC6Q03468 1493 aa27.67■■■□□ 2.02
NFE2-202ENST00000435572 KIF27Q86VH2 1401 aa27.64■■■□□ 2.02
NFE2-202ENST00000435572 CUX2O14529 1486 aa27.62■■■□□ 2.01
NFE2-202ENST00000435572 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.61■■■□□ 2.01
NFE2-202ENST00000435572 KIF21BO75037 1637 aa27.59■■■□□ 2.01
NFE2-202ENST00000435572 WDR97A6NE52 1622 aa27.58■■■□□ 2.01
NFE2-202ENST00000435572 WDR62O43379 1518 aa27.56■■■□□ 2
NFE2-202ENST00000435572 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.55■■■□□ 2
NFE2-202ENST00000435572 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
NFE2-202ENST00000435572 GOLGA3Q08378 1498 aa27.52■■■□□ 2
NFE2-202ENST00000435572 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
NFE2-202ENST00000435572 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.42■■□□□ 1.98
NFE2-202ENST00000435572 PRXQ9BXM0 1461 aa27.41■■□□□ 1.98
NFE2-202ENST00000435572 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.4■■□□□ 1.98
NFE2-202ENST00000435572 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.4■■□□□ 1.98
NFE2-202ENST00000435572 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
NFE2-202ENST00000435572 IGF1RP08069 1367 aa27.36■■□□□ 1.97
NFE2-202ENST00000435572 TNIKQ9UKE5 1360 aa27.36■■□□□ 1.97
NFE2-202ENST00000435572 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
NFE2-202ENST00000435572 IFT140Q96RY7 1462 aa27.31■■□□□ 1.96
NFE2-202ENST00000435572 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.3■■□□□ 1.96
NFE2-202ENST00000435572 CUL7Q14999 1698 aa27.29■■□□□ 1.96
NFE2-202ENST00000435572 PBRM1Q86U86 1689 aa27.28■■□□□ 1.96
NFE2-202ENST00000435572 CEP162Q5TB80 1403 aa27.26■■□□□ 1.95
NFE2-202ENST00000435572 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.25■■□□□ 1.95
NFE2-202ENST00000435572 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
NFE2-202ENST00000435572 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.949e-8■■■■■ 40.4
NFE2-202ENST00000435572 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
NFE2-202ENST00000435572 GRIN2BQ13224 1484 aa27.09■■□□□ 1.93
NFE2-202ENST00000435572 CLIP1P30622 1438 aa27.07■■□□□ 1.92
NFE2-202ENST00000435572 ADAMTS12P58397 1594 aa27.06■■□□□ 1.92
NFE2-202ENST00000435572 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.04■■□□□ 1.92
NFE2-202ENST00000435572 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
NFE2-202ENST00000435572 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.97■■□□□ 1.91
NFE2-202ENST00000435572 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.96■■□□□ 1.91
NFE2-202ENST00000435572 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.89
NFE2-202ENST00000435572 ARAP1Q96P48 1450 aa26.83■■□□□ 1.89
NFE2-202ENST00000435572 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms