RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490756.1

PIEZO1-209, Transcript of piezo type mechanosensitive ion channel component 1, humanhuman

TSL 3

Gene PIEZO1, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIEZO1-209ENST00000490756 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.18■■■■■ 5.78
PIEZO1-209ENST00000490756 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.95■■■■■ 4.95
PIEZO1-209ENST00000490756 ABCC9O60706 1549 aa45.59■■■■■ 4.89
PIEZO1-209ENST00000490756 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.6■■■■■ 4.57
PIEZO1-209ENST00000490756 NACADO15069 1562 aa43.38■■■■■ 4.54
PIEZO1-209ENST00000490756 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.94■■■■■ 4.46
PIEZO1-209ENST00000490756 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.85■■■■■ 4.45
PIEZO1-209ENST00000490756 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.61■■■■■ 4.41
PIEZO1-209ENST00000490756 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.59■■■■■ 4.41
PIEZO1-209ENST00000490756 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
PIEZO1-209ENST00000490756 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.41■■■■■ 4.38
PIEZO1-209ENST00000490756 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.4■■■■■ 4.38
PIEZO1-209ENST00000490756 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.31■■■■■ 4.36
PIEZO1-209ENST00000490756 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.92■■■■■ 4.3
PIEZO1-209ENST00000490756 SCRIBQ14160 1630 aa41.69■■■■■ 4.27
PIEZO1-209ENST00000490756 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.27■■■■■ 4.2
PIEZO1-209ENST00000490756 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
PIEZO1-209ENST00000490756 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.12■■■■■ 4.17
PIEZO1-209ENST00000490756 NCAPD3P42695 1498 aa40.04■■■■■ 4
PIEZO1-209ENST00000490756 SMARCA4P51532 1647 aa39.89■■■■□ 3.98
PIEZO1-209ENST00000490756 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.88■■■■□ 3.98
PIEZO1-209ENST00000490756 SMARCA2P51531 1590 aa39.83■■■■□ 3.97
PIEZO1-209ENST00000490756 HMGXB3Q12766 1538 aa39.77■■■■□ 3.96
PIEZO1-209ENST00000490756 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.74■■■■□ 3.95
PIEZO1-209ENST00000490756 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.6■■■■□ 3.93
PIEZO1-209ENST00000490756 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.48■■■■□ 3.91
PIEZO1-209ENST00000490756 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.38■■■■□ 3.9
PIEZO1-209ENST00000490756 CUX2O14529 1486 aa39.38■■■■□ 3.9
PIEZO1-209ENST00000490756 ERCC6Q03468 1493 aa39.37■■■■□ 3.89
PIEZO1-209ENST00000490756 NESP48681 1621 aa39.22■■■■□ 3.87
PIEZO1-209ENST00000490756 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.11■■■■□ 3.85
PIEZO1-209ENST00000490756 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.1■■■■□ 3.85
PIEZO1-209ENST00000490756 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.9■■■■□ 3.82
PIEZO1-209ENST00000490756 WIZO95785 1651 aa38.9■■■■□ 3.82
PIEZO1-209ENST00000490756 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.83■■■■□ 3.81
PIEZO1-209ENST00000490756 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.78■■■■□ 3.8
PIEZO1-209ENST00000490756 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.77■■■■□ 3.8
PIEZO1-209ENST00000490756 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.64■■■■□ 3.78
PIEZO1-209ENST00000490756 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.49■■■■□ 3.75
PIEZO1-209ENST00000490756 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.48■■■■□ 3.75
PIEZO1-209ENST00000490756 WDR62O43379 1518 aa38.43■■■■□ 3.74
PIEZO1-209ENST00000490756 CFTRP13569 1480 aa38.41■■■■□ 3.74
PIEZO1-209ENST00000490756 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.35■■■■□ 3.73
PIEZO1-209ENST00000490756 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.31■■■■□ 3.72
PIEZO1-209ENST00000490756 PRDM2Q13029 1718 aa38.06■■■■□ 3.68
PIEZO1-209ENST00000490756 CCDC88BA6NC98 1476 aa38■■■■□ 3.67
PIEZO1-209ENST00000490756 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
PIEZO1-209ENST00000490756 ABCC8Q09428 1581 aa37.63■■■■□ 3.61
PIEZO1-209ENST00000490756 TOPBP1Q92547 1522 aa37.61■■■■□ 3.61
PIEZO1-209ENST00000490756 IFT140Q96RY7 1462 aa37.61■■■■□ 3.61
PIEZO1-209ENST00000490756 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.52■■■■□ 3.6
PIEZO1-209ENST00000490756 OSCARQ8IYS5 282 aa37.51■■■■□ 3.6
PIEZO1-209ENST00000490756 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.46■■■■□ 3.59
PIEZO1-209ENST00000490756 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.31■■■■□ 3.56
PIEZO1-209ENST00000490756 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.3■■■■□ 3.56
PIEZO1-209ENST00000490756 TRIM41Q8WV44 630 aa37.27■■■■□ 3.56
PIEZO1-209ENST00000490756 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
PIEZO1-209ENST00000490756 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.12■■■■□ 3.534e-14■■□□□ 13.9
PIEZO1-209ENST00000490756 WDR97A6NE52 1622 aa37.05■■■■□ 3.52
PIEZO1-209ENST00000490756 SOGA1O94964 1423 aa37.03■■■■□ 3.52
PIEZO1-209ENST00000490756 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.03■■■■□ 3.52
PIEZO1-209ENST00000490756 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.03■■■■□ 3.52
PIEZO1-209ENST00000490756 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.03■■■■□ 3.52
PIEZO1-209ENST00000490756 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.02■■■■□ 3.52
PIEZO1-209ENST00000490756 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.01■■■■□ 3.51
PIEZO1-209ENST00000490756 CUX1P39880 1505 aa37■■■■□ 3.51
PIEZO1-209ENST00000490756 CHD1O14646 1710 aa36.97■■■■□ 3.51
PIEZO1-209ENST00000490756 ARHGEF11O15085 1522 aa36.94■■■■□ 3.5
PIEZO1-209ENST00000490756 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
PIEZO1-209ENST00000490756 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
PIEZO1-209ENST00000490756 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.77■■■■□ 3.48
PIEZO1-209ENST00000490756 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
PIEZO1-209ENST00000490756 GRIN2BQ13224 1484 aa36.75■■■■□ 3.47
PIEZO1-209ENST00000490756 FBLN2P98095 1184 aa36.73■■■■□ 3.47
PIEZO1-209ENST00000490756 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.66■■■■□ 3.46
PIEZO1-209ENST00000490756 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.62■■■■□ 3.45
PIEZO1-209ENST00000490756 SYNJ2O15056 1496 aa36.62■■■■□ 3.45
PIEZO1-209ENST00000490756 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.62■■■■□ 3.45
PIEZO1-209ENST00000490756 PBRM1Q86U86 1689 aa36.6■■■■□ 3.45
PIEZO1-209ENST00000490756 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.59■■■■□ 3.45
PIEZO1-209ENST00000490756 SYNJ1O43426 1573 aa36.59■■■■□ 3.45
PIEZO1-209ENST00000490756 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.58■■■■□ 3.45
PIEZO1-209ENST00000490756 ARAP1Q96P48 1450 aa36.57■■■■□ 3.45
PIEZO1-209ENST00000490756 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.54■■■■□ 3.44
PIEZO1-209ENST00000490756 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.52■■■■□ 3.44
PIEZO1-209ENST00000490756 TOP2BQ02880 1626 aa36.5■■■■□ 3.43
PIEZO1-209ENST00000490756 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.5■■■■□ 3.43
PIEZO1-209ENST00000490756 ADAMTS12P58397 1594 aa36.28■■■■□ 3.4
PIEZO1-209ENST00000490756 GRIN2AQ12879 1464 aa36.27■■■■□ 3.4
PIEZO1-209ENST00000490756 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.22■■■■□ 3.39
PIEZO1-209ENST00000490756 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.18■■■■□ 3.38
PIEZO1-209ENST00000490756 NUP160Q12769 1436 aa36.18■■■■□ 3.38
PIEZO1-209ENST00000490756 CEP170Q5SW79 1584 aa36.11■■■■□ 3.37
PIEZO1-209ENST00000490756 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
PIEZO1-209ENST00000490756 SHROOM2Q13796 1616 aa36.03■■■■□ 3.36
PIEZO1-209ENST00000490756 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.96■■■■□ 3.35
PIEZO1-209ENST00000490756 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.78■■■■□ 3.32
PIEZO1-209ENST00000490756 KIF27Q86VH2 1401 aa35.76■■■■□ 3.32
PIEZO1-209ENST00000490756 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
PIEZO1-209ENST00000490756 IGF1RP08069 1367 aa35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.9 ms