RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277462.9

PTGES2-201, Transcript of prostaglandin E synthase 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTGES2, Length 1,614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGES2-201ENST00000277462 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.65■■■■■ 4.42
PTGES2-201ENST00000277462 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.81■■■■□ 3.64
PTGES2-201ENST00000277462 ABCC9O60706 1549 aa37.27■■■■□ 3.56
PTGES2-201ENST00000277462 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.84■■■■□ 3.33
PTGES2-201ENST00000277462 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.73■■■■□ 3.31
PTGES2-201ENST00000277462 NACADO15069 1562 aa35.68■■■■□ 3.3
PTGES2-201ENST00000277462 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
PTGES2-201ENST00000277462 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.46■■■■□ 3.27
PTGES2-201ENST00000277462 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.25■■■■□ 3.23
PTGES2-201ENST00000277462 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.91■■■■□ 3.18
PTGES2-201ENST00000277462 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.76■■■■□ 3.15
PTGES2-201ENST00000277462 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.65■■■■□ 3.14
PTGES2-201ENST00000277462 SCRIBQ14160 1630 aa34.55■■■■□ 3.12
PTGES2-201ENST00000277462 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.43■■■■□ 3.1
PTGES2-201ENST00000277462 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.29■■■■□ 3.08
PTGES2-201ENST00000277462 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
PTGES2-201ENST00000277462 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.64■■■□□ 2.98
PTGES2-201ENST00000277462 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.51■■■□□ 2.96
PTGES2-201ENST00000277462 SMARCA4P51532 1647 aa33.04■■■□□ 2.88
PTGES2-201ENST00000277462 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.03■■■□□ 2.88
PTGES2-201ENST00000277462 NCAPD3P42695 1498 aa33.01■■■□□ 2.87
PTGES2-201ENST00000277462 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33■■■□□ 2.87
PTGES2-201ENST00000277462 SMARCA2P51531 1590 aa32.88■■■□□ 2.85
PTGES2-201ENST00000277462 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.86■■■□□ 2.85
PTGES2-201ENST00000277462 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.74■■■□□ 2.83
PTGES2-201ENST00000277462 HMGXB3Q12766 1538 aa32.73■■■□□ 2.83
PTGES2-201ENST00000277462 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.68■■■□□ 2.82
PTGES2-201ENST00000277462 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
PTGES2-201ENST00000277462 WIZO95785 1651 aa32.43■■■□□ 2.78
PTGES2-201ENST00000277462 NESP48681 1621 aa32.21■■■□□ 2.75
PTGES2-201ENST00000277462 ERCC6Q03468 1493 aa32.13■■■□□ 2.73
PTGES2-201ENST00000277462 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
PTGES2-201ENST00000277462 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.07■■■□□ 2.72
PTGES2-201ENST00000277462 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.06■■■□□ 2.72
PTGES2-201ENST00000277462 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.95■■■□□ 2.71
PTGES2-201ENST00000277462 CFTRP13569 1480 aa31.82■■■□□ 2.68
PTGES2-201ENST00000277462 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.81■■■□□ 2.68
PTGES2-201ENST00000277462 CUX2O14529 1486 aa31.81■■■□□ 2.68
PTGES2-201ENST00000277462 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.68■■■□□ 2.66
PTGES2-201ENST00000277462 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
PTGES2-201ENST00000277462 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.65■■■□□ 2.66
PTGES2-201ENST00000277462 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.64■■■□□ 2.66
PTGES2-201ENST00000277462 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.59■■■□□ 2.65
PTGES2-201ENST00000277462 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.56■■■□□ 2.64
PTGES2-201ENST00000277462 WDR62O43379 1518 aa31.44■■■□□ 2.62
PTGES2-201ENST00000277462 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
PTGES2-201ENST00000277462 PRDM2Q13029 1718 aa31.29■■■□□ 2.6
PTGES2-201ENST00000277462 ABCC8Q09428 1581 aa31.12■■■□□ 2.57
PTGES2-201ENST00000277462 TOPBP1Q92547 1522 aa31.11■■■□□ 2.57
PTGES2-201ENST00000277462 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.1■■■□□ 2.57
PTGES2-201ENST00000277462 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.01■■■□□ 2.55
PTGES2-201ENST00000277462 IFT140Q96RY7 1462 aa30.96■■■□□ 2.55
PTGES2-201ENST00000277462 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
PTGES2-201ENST00000277462 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
PTGES2-201ENST00000277462 CUX1P39880 1505 aa30.81■■■□□ 2.52
PTGES2-201ENST00000277462 SOGA1O94964 1423 aa30.78■■■□□ 2.52
PTGES2-201ENST00000277462 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.74■■■□□ 2.51
PTGES2-201ENST00000277462 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.74■■■□□ 2.51
PTGES2-201ENST00000277462 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
PTGES2-201ENST00000277462 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.68■■■□□ 2.56e-7■■■■■ 29.5
PTGES2-201ENST00000277462 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
PTGES2-201ENST00000277462 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.64■■■□□ 2.49
PTGES2-201ENST00000277462 OSCARQ8IYS5 282 aa30.61■■■□□ 2.49
PTGES2-201ENST00000277462 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.6■■■□□ 2.49
PTGES2-201ENST00000277462 TOP2BQ02880 1626 aa30.49■■■□□ 2.47
PTGES2-201ENST00000277462 SYNJ1O43426 1573 aa30.47■■■□□ 2.47
PTGES2-201ENST00000277462 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.46■■■□□ 2.47
PTGES2-201ENST00000277462 WDR97A6NE52 1622 aa30.44■■■□□ 2.46
PTGES2-201ENST00000277462 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.43■■■□□ 2.46
PTGES2-201ENST00000277462 FBLN2P98095 1184 aa30.4■■■□□ 2.46
PTGES2-201ENST00000277462 GRIN2BQ13224 1484 aa30.38■■■□□ 2.45
PTGES2-201ENST00000277462 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.38■■■□□ 2.45
PTGES2-201ENST00000277462 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.34■■■□□ 2.45
PTGES2-201ENST00000277462 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
PTGES2-201ENST00000277462 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
PTGES2-201ENST00000277462 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.25■■■□□ 2.43
PTGES2-201ENST00000277462 SYNJ2O15056 1496 aa30.19■■■□□ 2.42
PTGES2-201ENST00000277462 CHD1O14646 1710 aa30.17■■■□□ 2.42
PTGES2-201ENST00000277462 PBRM1Q86U86 1689 aa30.13■■■□□ 2.41
PTGES2-201ENST00000277462 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.06■■■□□ 2.4
PTGES2-201ENST00000277462 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.04■■■□□ 2.4
PTGES2-201ENST00000277462 TRIM41Q8WV44 630 aa30.02■■■□□ 2.4
PTGES2-201ENST00000277462 KIF27Q86VH2 1401 aa30.02■■■□□ 2.4
PTGES2-201ENST00000277462 ARHGEF11O15085 1522 aa29.98■■■□□ 2.39
PTGES2-201ENST00000277462 ADAMTS12P58397 1594 aa29.97■■■□□ 2.39
PTGES2-201ENST00000277462 GRIN2AQ12879 1464 aa29.97■■■□□ 2.39
PTGES2-201ENST00000277462 IGF1RP08069 1367 aa29.97■■■□□ 2.39
PTGES2-201ENST00000277462 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.94■■■□□ 2.38
PTGES2-201ENST00000277462 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.93■■■□□ 2.38
PTGES2-201ENST00000277462 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.93■■■□□ 2.38
PTGES2-201ENST00000277462 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.93■■■□□ 2.38
PTGES2-201ENST00000277462 CHIC1Q5VXU3 224 aa29.92■■■□□ 2.38
PTGES2-201ENST00000277462 NUP160Q12769 1436 aa29.86■■■□□ 2.37
PTGES2-201ENST00000277462 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.85■■■□□ 2.37
PTGES2-201ENST00000277462 CEP170Q5SW79 1584 aa29.78■■■□□ 2.36
PTGES2-201ENST00000277462 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.76■■■□□ 2.35
PTGES2-201ENST00000277462 ARAP1Q96P48 1450 aa29.73■■■□□ 2.35
PTGES2-201ENST00000277462 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.7■■■□□ 2.34
PTGES2-201ENST00000277462 CUL7Q14999 1698 aa29.69■■■□□ 2.34
PTGES2-201ENST00000277462 JPH4Q96JJ6 628 aa29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms