Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.423e-6■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 CNOT6-205ENST00000507016 382 ntTSL 325.71■■□□□ 1.719e-8■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 CNOT6-203ENST00000502447 552 ntTSL 319.4■□□□□ 0.79e-8■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.639e-8■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.559e-8■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.339e-8■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 221.08■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 RPL13-208ENST00000487034 615 ntTSL 1 (best)24.49■■□□□ 1.513e-6■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 RPL13-205ENST00000467736 528 ntTSL 318.38■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 RPL13-213ENST00000565571 568 ntTSL 215.68■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 31.4
SF3B1O75533 SREBF2-207ENST00000490262 450 ntTSL 213.03□□□□□ -0.325e-6■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.783e-6■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.083e-6■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.328e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 516.86■□□□□ 0.298e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.238e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.118e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -08e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.058e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 GRAMD1A-206ENST00000598073 582 ntTSL 312.47□□□□□ -0.418e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 411.35□□□□□ -0.598e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 EEF1A1-204ENST00000356303 635 ntTSL 29.87□□□□□ -0.838e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 IQGAP1-207ENST00000559682 376 ntTSL 26.29□□□□□ -1.48e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 ATP11B-207ENST00000490303 2290 ntTSL 25.49□□□□□ -1.538e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 ATP11B-210ENST00000498086 3259 ntTSL 53.3□□□□□ -1.888e-11■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 ATXN2L-221ENST00000566946 2162 ntTSL 1 (best)21.18■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 ATXN2L-208ENST00000562583 1933 ntTSL 1 (best)19.15■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 PTTG1IP-205ENST00000474737 580 ntTSL 317.33■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-10■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.482e-10■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 SEMA4C-202ENST00000442264 817 ntTSL 322.33■■□□□ 1.172e-6■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 217.48■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 IGF2BP3-206ENST00000468005 2948 ntTSL 514.5□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 31.3
SF3B1O75533 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.038e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 SNX9-202ENST00000614703 542 ntTSL 410.75□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 SNX9-203ENST00000614800 553 ntTSL 46.92□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 BRWD1-214ENST00000484090 429 ntTSL 224.96■■□□□ 1.591e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NFKBIA-202ENST00000553342 212 ntTSL 522.44■■□□□ 1.181e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.141e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NFKBIA-205ENST00000555629 599 ntTSL 220.54■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NFKBIA-207ENST00000557100 825 ntTSL 319.35■□□□□ 0.691e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.581e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.451e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NFKBIA-210ENST00000557459 780 ntTSL 217.22■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TRAFD1-203ENST00000547063 867 ntTSL 316.92■□□□□ 0.31e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NFKBIA-203ENST00000554001 1396 ntTSL 516.22■□□□□ 0.191e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CLASP2-208ENST00000467956 485 ntTSL 216.07■□□□□ 0.161e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CSAD-206ENST00000424990 565 ntTSL 415.62■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.081e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CSAD-207ENST00000437073 581 ntTSL 415.43■□□□□ 0.061e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -01e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 UCKL1-204ENST00000430743 888 ntTSL 314.37□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 ELOVL5-204ENST00000465983 696 ntTSL 313.94□□□□□ -0.186e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NDUFS5-201ENST00000372967 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NDUFS5-202ENST00000372969 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 ELOVL5-206ENST00000486973 794 ntTSL 313.85□□□□□ -0.196e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CSAD-204ENST00000379850 2379 ntTSL 513.68□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.281e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CSAD-201ENST00000267085 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.366e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TRAFD1-209ENST00000552896 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.74□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TRAFD1-206ENST00000549358 532 ntAPPRIS ALT2 TSL 412.03□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TRAFD1-202ENST00000412615 2697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TTC14-203ENST00000412756 4568 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.61e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TRAFD1-208ENST00000552890 1043 ntTSL 211.17□□□□□ -0.621e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TRAFD1-207ENST00000550051 1003 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 ALDH1A2-215ENST00000559266 545 ntTSL 410.7□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 ALDH1A2-224ENST00000561070 554 ntTSL 410.7□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 ELOVL5-205ENST00000485336 761 ntTSL 510.6□□□□□ -0.716e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TTC14-205ENST00000465065 7052 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TTC14-201ENST00000296015 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 ALDH1A2-217ENST00000559517 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.81e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CCDC66-203ENST00000394672 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.096e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.16e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 BRWD1-212ENST00000470108 1176 ntTSL 37.63□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.36e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 RABGAP1L-221ENST00000529474 524 ntTSL 46.92□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CCDC66-220ENST00000484623 852 ntTSL 55.86□□□□□ -1.471e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CCDC66-204ENST00000422222 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.47□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CCDC66-218ENST00000482673 899 ntTSL 44.24□□□□□ -1.731e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TRAFD1-204ENST00000548092 584 ntTSL 34.16□□□□□ -1.741e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CCDC66-222ENST00000494672 577 ntTSL 44.1□□□□□ -1.751e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CCDC66-202ENST00000341455 3042 ntTSL 1 (best)3.74□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CCDC66-213ENST00000471681 3120 ntTSL 53.72□□□□□ -1.811e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.011e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 TTC14-208ENST00000487397 408 ntTSL 32.34□□□□□ -2.041e-7■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 GGA2-215ENST00000569189 586 ntTSL 526.62■■□□□ 1.853e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 GGA2-203ENST00000562944 388 ntTSL 525.59■■□□□ 1.693e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 GGA2-204ENST00000563047 366 ntTSL 523.41■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 31.2
SF3B1O75533 GGA2-212ENST00000568799 1403 ntTSL 523.16■■□□□ 1.33e-6■■■■■ 31.2
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 3717.9 ms