RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332503.5

HOXB4-201, Transcript of homeobox B4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB4, Length 3,757 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4-201ENST00000332503 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXB4-201ENST00000332503 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXB4-201ENST00000332503 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXB4-201ENST00000332503 HRCP23327 699 aa25.77■■□□□ 1.72
HOXB4-201ENST00000332503 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.67■■□□□ 1.7
HOXB4-201ENST00000332503 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXB4-201ENST00000332503 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.5■■□□□ 1.67
HOXB4-201ENST00000332503 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
HOXB4-201ENST00000332503 ABCC9O60706 1549 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXB4-201ENST00000332503 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXB4-201ENST00000332503 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXB4-201ENST00000332503 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
HOXB4-201ENST00000332503 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.51■■□□□ 1.51
HOXB4-201ENST00000332503 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
HOXB4-201ENST00000332503 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
HOXB4-201ENST00000332503 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.47■■□□□ 1.51
HOXB4-201ENST00000332503 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
HOXB4-201ENST00000332503 SCRIBQ14160 1630 aa24.15■■□□□ 1.46
HOXB4-201ENST00000332503 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB4-201ENST00000332503 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
HOXB4-201ENST00000332503 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
HOXB4-201ENST00000332503 NACADO15069 1562 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB4-201ENST00000332503 WIZO95785 1651 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB4-201ENST00000332503 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB4-201ENST00000332503 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.86■■□□□ 1.41
HOXB4-201ENST00000332503 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB4-201ENST00000332503 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXB4-201ENST00000332503 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXB4-201ENST00000332503 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB4-201ENST00000332503 TRIM41Q8WV44 630 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXB4-201ENST00000332503 SMARCA2P51531 1590 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXB4-201ENST00000332503 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXB4-201ENST00000332503 NEUROD1Q13562 356 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB4-201ENST00000332503 SMARCA4P51532 1647 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB4-201ENST00000332503 ABCC8Q09428 1581 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB4-201ENST00000332503 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXB4-201ENST00000332503 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.33■■□□□ 1.32
HOXB4-201ENST00000332503 KIF21BO75037 1637 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXB4-201ENST00000332503 CEP162Q5TB80 1403 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB4-201ENST00000332503 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB4-201ENST00000332503 EEA1Q15075 1411 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB4-201ENST00000332503 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXB4-201ENST00000332503 SOGA1O94964 1423 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB4-201ENST00000332503 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXB4-201ENST00000332503 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXB4-201ENST00000332503 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HOXB4-201ENST00000332503 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.08■■□□□ 1.29
HOXB4-201ENST00000332503 SYNJ1O43426 1573 aa23.06■■□□□ 1.28
HOXB4-201ENST00000332503 MYT1Q01538 1121 aa23.01■■□□□ 1.27
HOXB4-201ENST00000332503 GOLGA3Q08378 1498 aa22.99■■□□□ 1.27
HOXB4-201ENST00000332503 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.98■■□□□ 1.27
HOXB4-201ENST00000332503 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HOXB4-201ENST00000332503 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.91■■□□□ 1.26
HOXB4-201ENST00000332503 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
HOXB4-201ENST00000332503 CUX2O14529 1486 aa22.87■■□□□ 1.25
HOXB4-201ENST00000332503 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
HOXB4-201ENST00000332503 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.81■■□□□ 1.24
HOXB4-201ENST00000332503 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HOXB4-201ENST00000332503 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.79■■□□□ 1.24
HOXB4-201ENST00000332503 TOP2BQ02880 1626 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB4-201ENST00000332503 CLIP1P30622 1438 aa22.78■■□□□ 1.24
HOXB4-201ENST00000332503 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.73■■□□□ 1.23
HOXB4-201ENST00000332503 MIER1Q8N108 512 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB4-201ENST00000332503 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.67■■□□□ 1.22
HOXB4-201ENST00000332503 ARAP1Q96P48 1450 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.63■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.59■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 PRXQ9BXM0 1461 aa22.58■■□□□ 1.21
HOXB4-201ENST00000332503 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.57■■□□□ 1.2
HOXB4-201ENST00000332503 PRDM2Q13029 1718 aa22.55■■□□□ 1.2
HOXB4-201ENST00000332503 MAPKBP1O60336 1514 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB4-201ENST00000332503 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXB4-201ENST00000332503 MAP3K1Q13233 1512 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB4-201ENST00000332503 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB4-201ENST00000332503 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXB4-201ENST00000332503 CUX1P39880 1505 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXB4-201ENST00000332503 HMGXB3Q12766 1538 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB4-201ENST00000332503 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB4-201ENST00000332503 TIAM1Q13009 1591 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB4-201ENST00000332503 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB4-201ENST00000332503 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB4-201ENST00000332503 WDR97A6NE52 1622 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXB4-201ENST00000332503 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB4-201ENST00000332503 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXB4-201ENST00000332503 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXB4-201ENST00000332503 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
HOXB4-201ENST00000332503 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXB4-201ENST00000332503 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXB4-201ENST00000332503 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB4-201ENST00000332503 CFTRP13569 1480 aa21.98■■□□□ 1.11
HOXB4-201ENST00000332503 NCAPD3P42695 1498 aa21.96■■□□□ 1.11
HOXB4-201ENST00000332503 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.95■■□□□ 1.1
HOXB4-201ENST00000332503 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.93■■□□□ 1.1
HOXB4-201ENST00000332503 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
HOXB4-201ENST00000332503 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HOXB4-201ENST00000332503 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.9■■□□□ 1.1
HOXB4-201ENST00000332503 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.5 ms