RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507016.1

CNOT6-205, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

TSL 3

Gene CNOT6, Length 382 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6-205ENST00000507016 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.68■■■■■ 6.82
CNOT6-205ENST00000507016 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.63■■■■■ 5.86
CNOT6-205ENST00000507016 ABCC9O60706 1549 aa51.42■■■■■ 5.82
CNOT6-205ENST00000507016 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.06■■■■■ 5.44
CNOT6-205ENST00000507016 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.78■■■■■ 5.4
CNOT6-205ENST00000507016 NACADO15069 1562 aa48.75■■■■■ 5.39
CNOT6-205ENST00000507016 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.11■■■■■ 5.29
CNOT6-205ENST00000507016 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.93■■■■■ 5.26
CNOT6-205ENST00000507016 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.87■■■■■ 5.25
CNOT6-205ENST00000507016 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.81■■■■■ 5.24
CNOT6-205ENST00000507016 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.8■■■■■ 5.24
CNOT6-205ENST00000507016 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.61■■■■■ 5.21
CNOT6-205ENST00000507016 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.48■■■■■ 5.19
CNOT6-205ENST00000507016 SCRIBQ14160 1630 aa47.16■■■■■ 5.14
CNOT6-205ENST00000507016 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.96■■■■■ 5.11
CNOT6-205ENST00000507016 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.4■■■■■ 5.02
CNOT6-205ENST00000507016 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
CNOT6-205ENST00000507016 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.27■■■■■ 5
CNOT6-205ENST00000507016 NCAPD3P42695 1498 aa44.96■■■■■ 4.79
CNOT6-205ENST00000507016 SMARCA4P51532 1647 aa44.94■■■■■ 4.79
CNOT6-205ENST00000507016 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.9■■■■■ 4.78
CNOT6-205ENST00000507016 SMARCA2P51531 1590 aa44.85■■■■■ 4.77
CNOT6-205ENST00000507016 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.81■■■■■ 4.76
CNOT6-205ENST00000507016 HMGXB3Q12766 1538 aa44.7■■■■■ 4.75
CNOT6-205ENST00000507016 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.58■■■■■ 4.73
CNOT6-205ENST00000507016 ERCC6Q03468 1493 aa44.47■■■■■ 4.71
CNOT6-205ENST00000507016 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.45■■■■■ 4.71
CNOT6-205ENST00000507016 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.43■■■■■ 4.7
CNOT6-205ENST00000507016 NESP48681 1621 aa44.2■■■■■ 4.67
CNOT6-205ENST00000507016 CUX2O14529 1486 aa44.15■■■■■ 4.66
CNOT6-205ENST00000507016 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.96■■■■■ 4.63
CNOT6-205ENST00000507016 WIZO95785 1651 aa43.94■■■■■ 4.63
CNOT6-205ENST00000507016 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.75■■■■■ 4.59
CNOT6-205ENST00000507016 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.73■■■■■ 4.59
CNOT6-205ENST00000507016 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
CNOT6-205ENST00000507016 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.67■■■■■ 4.58
CNOT6-205ENST00000507016 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.64■■■■■ 4.58
CNOT6-205ENST00000507016 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.63■■■■■ 4.58
CNOT6-205ENST00000507016 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.44■■■■■ 4.54
CNOT6-205ENST00000507016 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.33■■■■■ 4.53
CNOT6-205ENST00000507016 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.26■■■■■ 4.52
CNOT6-205ENST00000507016 CFTRP13569 1480 aa43.2■■■■■ 4.51
CNOT6-205ENST00000507016 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.2■■■■■ 4.51
CNOT6-205ENST00000507016 WDR62O43379 1518 aa43.17■■■■■ 4.5
CNOT6-205ENST00000507016 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.92■■■■■ 4.46
CNOT6-205ENST00000507016 PRDM2Q13029 1718 aa42.78■■■■■ 4.44
CNOT6-205ENST00000507016 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.77■■■■■ 4.44
CNOT6-205ENST00000507016 TOPBP1Q92547 1522 aa42.39■■■■■ 4.38
CNOT6-205ENST00000507016 IFT140Q96RY7 1462 aa42.36■■■■■ 4.37
CNOT6-205ENST00000507016 ABCC8Q09428 1581 aa42.35■■■■■ 4.37
CNOT6-205ENST00000507016 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.28■■■■■ 4.36
CNOT6-205ENST00000507016 OSCARQ8IYS5 282 aa42.24■■■■■ 4.35
CNOT6-205ENST00000507016 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.21■■■■■ 4.35
CNOT6-205ENST00000507016 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
CNOT6-205ENST00000507016 TRIM41Q8WV44 630 aa42.13■■■■■ 4.33
CNOT6-205ENST00000507016 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.03■■■■■ 4.32
CNOT6-205ENST00000507016 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.98■■■■■ 4.31
CNOT6-205ENST00000507016 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.93■■■■■ 4.3
CNOT6-205ENST00000507016 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.89■■■■■ 4.3
CNOT6-205ENST00000507016 SOGA1O94964 1423 aa41.83■■■■■ 4.29
CNOT6-205ENST00000507016 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.83■■■■■ 4.29
CNOT6-205ENST00000507016 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.79■■■■■ 4.28
CNOT6-205ENST00000507016 CUX1P39880 1505 aa41.75■■■■■ 4.27
CNOT6-205ENST00000507016 FBLN2P98095 1184 aa41.72■■■■■ 4.27
CNOT6-205ENST00000507016 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
CNOT6-205ENST00000507016 CHD1O14646 1710 aa41.63■■■■■ 4.25
CNOT6-205ENST00000507016 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
CNOT6-205ENST00000507016 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
CNOT6-205ENST00000507016 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.6■■■■■ 4.25
CNOT6-205ENST00000507016 WDR97A6NE52 1622 aa41.58■■■■■ 4.25
CNOT6-205ENST00000507016 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.52■■■■■ 4.24
CNOT6-205ENST00000507016 ARHGEF11O15085 1522 aa41.51■■■■■ 4.24
CNOT6-205ENST00000507016 GRIN2BQ13224 1484 aa41.44■■■■■ 4.22
CNOT6-205ENST00000507016 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
CNOT6-205ENST00000507016 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
CNOT6-205ENST00000507016 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.33■■■■■ 4.21
CNOT6-205ENST00000507016 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.29■■■■■ 4.2
CNOT6-205ENST00000507016 PBRM1Q86U86 1689 aa41.26■■■■■ 4.2
CNOT6-205ENST00000507016 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.26■■■■■ 4.2
CNOT6-205ENST00000507016 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.26■■■■■ 4.19
CNOT6-205ENST00000507016 SYNJ2O15056 1496 aa41.25■■■■■ 4.19
CNOT6-205ENST00000507016 SYNJ1O43426 1573 aa41.24■■■■■ 4.19
CNOT6-205ENST00000507016 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.19■■■■■ 4.18
CNOT6-205ENST00000507016 TOP2BQ02880 1626 aa41.18■■■■■ 4.18
CNOT6-205ENST00000507016 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.16■■■■■ 4.18
CNOT6-205ENST00000507016 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.13■■■■■ 4.17
CNOT6-205ENST00000507016 ARAP1Q96P48 1450 aa41.11■■■■■ 4.17
CNOT6-205ENST00000507016 ADAMTS12P58397 1594 aa40.9■■■■■ 4.14
CNOT6-205ENST00000507016 GRIN2AQ12879 1464 aa40.89■■■■■ 4.14
CNOT6-205ENST00000507016 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.82■■■■■ 4.12
CNOT6-205ENST00000507016 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.8■■■■■ 4.12
CNOT6-205ENST00000507016 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.8■■■■■ 4.12
CNOT6-205ENST00000507016 CEP170Q5SW79 1584 aa40.69■■■■■ 4.11
CNOT6-205ENST00000507016 NUP160Q12769 1436 aa40.68■■■■■ 4.1
CNOT6-205ENST00000507016 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.52■■■■■ 4.08
CNOT6-205ENST00000507016 KIF27Q86VH2 1401 aa40.47■■■■■ 4.07
CNOT6-205ENST00000507016 SHROOM2Q13796 1616 aa40.44■■■■■ 4.06
CNOT6-205ENST00000507016 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.35■■■■■ 4.05
CNOT6-205ENST00000507016 JPH4Q96JJ6 628 aa40.33■■■■■ 4.05
CNOT6-205ENST00000507016 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.32■■■■■ 4.04
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