Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5P1

ZC3H8, Zinc finger CCCH domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H8Q8N5P1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.532e-34■■■■■ 31.9
ZC3H8Q8N5P1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-34■■■■■ 31.9
ZC3H8Q8N5P1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.412e-34■■■■■ 31.9
ZC3H8Q8N5P1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.412e-34■■■■■ 31.9
ZC3H8Q8N5P1 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-34■■■■■ 31.9
ZC3H8Q8N5P1 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.262e-34■■■■■ 31.9
ZC3H8Q8N5P1 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-34■■■■■ 31.9
ZC3H8Q8N5P1 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.132e-34■■■■■ 31.9
ZC3H8Q8N5P1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.431e-31■■■■■ 31.3
ZC3H8Q8N5P1 RPS12-202ENST00000484616 639 ntTSL 23.74□□□□□ -1.811e-31■■■■■ 31.3
ZC3H8Q8N5P1 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.443e-10■■■■■ 31.2
ZC3H8Q8N5P1 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.31e-6■■■■■ 31.1
ZC3H8Q8N5P1 PHB2-208ENST00000543465 1518 ntTSL 522.75■■□□□ 1.237e-55■■■■■ 29.9
ZC3H8Q8N5P1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.917e-55■■■■■ 29.9
ZC3H8Q8N5P1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.867e-55■■■■■ 29.9
ZC3H8Q8N5P1 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.627e-55■■■■■ 29.9
ZC3H8Q8N5P1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.617e-55■■■■■ 29.9
ZC3H8Q8N5P1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.487e-55■■■■■ 29.9
ZC3H8Q8N5P1 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 515.09■□□□□ 0.017e-55■■■■■ 29.9
ZC3H8Q8N5P1 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.13□□□□□ -0.157e-55■■■■■ 29.9
ZC3H8Q8N5P1 PHB2-212ENST00000545555 309 ntTSL 59.69□□□□□ -0.867e-55■■■■■ 29.9
ZC3H8Q8N5P1 UBAP2-209ENST00000474372 1339 ntTSL 514.2□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 UBAP2-211ENST00000488443 492 ntTSL 513.31□□□□□ -0.281e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 GNL3-201ENST00000394799 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 GNL3-202ENST00000418458 2040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 27.98□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.141e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 UBAP2-204ENST00000379238 4289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.151e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 GNL3-211ENST00000496254 2118 ntTSL 55.68□□□□□ -1.51e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.24□□□□□ -1.731e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 GNL3-209ENST00000484022 668 ntTSL 23.77□□□□□ -1.811e-8■■■■■ 29.5
ZC3H8Q8N5P1 MED24-225ENST00000580885 1963 ntTSL 517■□□□□ 0.311e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-213ENST00000535071 2441 ntTSL 515.58■□□□□ 0.091e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 212.95□□□□□ -0.341e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-212ENST00000501516 3037 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.441e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.471e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.511e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-231ENST00000584782 542 ntTSL 39.54□□□□□ -0.881e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-228ENST00000581058 524 ntTSL 48.56□□□□□ -1.041e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-219ENST00000578901 728 ntTSL 1 (best)8.07□□□□□ -1.121e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.161e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.241e-11■■■■■ 29.4
ZC3H8Q8N5P1 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 28.6
ZC3H8Q8N5P1 SUPT7L-204ENST00000406540 2869 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 28.6
ZC3H8Q8N5P1 SUPT7L-201ENST00000337768 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 28.6
ZC3H8Q8N5P1 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 28.6
ZC3H8Q8N5P1 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.192e-6■■■■■ 28.6
ZC3H8Q8N5P1 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.162e-16■■■■■ 28.3
ZC3H8Q8N5P1 SNHG22-202ENST00000615535 421 nt14.72□□□□□ -0.052e-16■■■■■ 28.3
ZC3H8Q8N5P1 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.65□□□□□ -2.152e-15■■■■■ 28.2
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-201ENST00000578528 481 ntTSL 323.58■■□□□ 1.376e-10■■■■■ 27.8
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 219.51■□□□□ 0.716e-10■■■■■ 27.8
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 517.05■□□□□ 0.326e-10■■■■■ 27.8
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 316.94■□□□□ 0.36e-10■■■■■ 27.8
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 512.05□□□□□ -0.486e-10■■■■■ 27.8
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 510.22□□□□□ -0.776e-10■■■■■ 27.8
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 59.9□□□□□ -0.826e-10■■■■■ 27.8
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 36.55□□□□□ -1.366e-10■■■■■ 27.8
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 35.28□□□□□ -1.566e-10■■■■■ 27.8
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)4.77□□□□□ -1.656e-10■■■■■ 27.8
ZC3H8Q8N5P1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.743e-19■■■■■ 27
ZC3H8Q8N5P1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.693e-19■■■■■ 27
ZC3H8Q8N5P1 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)16.5■□□□□ 0.233e-19■■■■■ 27
ZC3H8Q8N5P1 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.033e-19■■■■■ 27
ZC3H8Q8N5P1 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.143e-19■■■■■ 27
ZC3H8Q8N5P1 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.423e-19■■■■■ 27
ZC3H8Q8N5P1 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.028e-11■■■■□ 26.2
ZC3H8Q8N5P1 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.561e-7■■■■□ 26.1
ZC3H8Q8N5P1 ZRANB2-202ENST00000370920 3078 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-7■■■■□ 26.1
ZC3H8Q8N5P1 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.661e-7■■■■□ 26.1
ZC3H8Q8N5P1 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.072e-14■■■■□ 26.1
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.855e-10■■■■□ 25.7
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 219.33■□□□□ 0.685e-10■■■■□ 25.7
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 319.33■□□□□ 0.685e-10■■■■□ 25.7
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 316.82■□□□□ 0.285e-10■■■■□ 25.7
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.445e-10■■■■□ 25.7
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.795e-10■■■■□ 25.7
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.85e-10■■■■□ 25.7
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.865e-10■■■■□ 25.7
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.015e-10■■■■□ 25.7
ZC3H8Q8N5P1 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.25e-10■■■■□ 25.7
ZC3H8Q8N5P1 RPS11-204ENST00000599167 1133 ntTSL 511.95□□□□□ -0.52e-44■■■■□ 25.5
ZC3H8Q8N5P1 RPS11-206ENST00000600027 944 ntTSL 511.95□□□□□ -0.52e-44■■■■□ 25.5
ZC3H8Q8N5P1 RPS11-207ENST00000601216 602 ntTSL 49.42□□□□□ -0.92e-44■■■■□ 25.5
ZC3H8Q8N5P1 RPS11-201ENST00000270625 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.912e-44■■■■□ 25.5
ZC3H8Q8N5P1 RPS11-202ENST00000594493 575 ntTSL 3 BASIC8.08□□□□□ -1.122e-44■■■■□ 25.5
ZC3H8Q8N5P1 RPS11-209ENST00000602252 751 ntTSL 28.08□□□□□ -1.122e-44■■■■□ 25.5
ZC3H8Q8N5P1 RPS11-208ENST00000601306 547 ntTSL 37.76□□□□□ -1.172e-44■■■■□ 25.5
ZC3H8Q8N5P1 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.242e-44■■■■□ 25.5
ZC3H8Q8N5P1 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.332e-44■■■■□ 25.5
ZC3H8Q8N5P1 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.22□□□□□ -1.732e-44■■■■□ 25.5
ZC3H8Q8N5P1 TMEM107-205ENST00000449985 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.423e-7■■■■□ 25.2
ZC3H8Q8N5P1 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.63□□□□□ -2.313e-7■■■■□ 25.2
ZC3H8Q8N5P1 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 25
ZC3H8Q8N5P1 ARVCF-206ENST00000467828 258 ntTSL 319.26■□□□□ 0.676e-6■■■■□ 24.9
ZC3H8Q8N5P1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.496e-6■■■■□ 24.9
ZC3H8Q8N5P1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.316e-6■■■■□ 24.9
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