RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375639.6

C6orf48-204, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C6orf48, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-204ENST00000375639 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.93■■■■■ 4.3
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C6orf48-204ENST00000375639 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.64■■■■□ 3.14
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C6orf48-204ENST00000375639 SCRIBQ14160 1630 aa33.89■■■■□ 3.02
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C6orf48-204ENST00000375639 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.71■■■□□ 2.83
C6orf48-204ENST00000375639 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.68■■■□□ 2.82
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C6orf48-204ENST00000375639 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.56■■■□□ 2.8
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C6orf48-204ENST00000375639 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.35■■■□□ 2.77
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C6orf48-204ENST00000375639 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.14■■■□□ 2.74
C6orf48-204ENST00000375639 SMARCA2P51531 1590 aa32.11■■■□□ 2.73
C6orf48-204ENST00000375639 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.06■■■□□ 2.72
C6orf48-204ENST00000375639 WIZO95785 1651 aa32.03■■■□□ 2.72
C6orf48-204ENST00000375639 NCAPD3P42695 1498 aa32.03■■■□□ 2.72
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C6orf48-204ENST00000375639 NESP48681 1621 aa31.15■■■□□ 2.58
C6orf48-204ENST00000375639 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.09■■■□□ 2.57
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C6orf48-204ENST00000375639 PRDM2Q13029 1718 aa30.81■■■□□ 2.52
C6orf48-204ENST00000375639 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.8■■■□□ 2.52
C6orf48-204ENST00000375639 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.76■■■□□ 2.51
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C6orf48-204ENST00000375639 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.55■■■□□ 2.48
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C6orf48-204ENST00000375639 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.85■■■□□ 2.37
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C6orf48-204ENST00000375639 SYNJ2O15056 1496 aa29.35■■■□□ 2.29
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C6orf48-204ENST00000375639 CUL7Q14999 1698 aa29.31■■■□□ 2.28
C6orf48-204ENST00000375639 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.3■■■□□ 2.28
C6orf48-204ENST00000375639 CHD1O14646 1710 aa29.28■■■□□ 2.28
C6orf48-204ENST00000375639 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
C6orf48-204ENST00000375639 GRIN2AQ12879 1464 aa29.23■■■□□ 2.27
C6orf48-204ENST00000375639 PRXQ9BXM0 1461 aa29.18■■■□□ 2.26
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