RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395789.5

C6orf48-209, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene C6orf48, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C6orf48-209ENST00000395789 CUX2O14529 1486 aa23.96■■□□□ 1.43
C6orf48-209ENST00000395789 PRDM2Q13029 1718 aa23.96■■□□□ 1.43
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C6orf48-209ENST00000395789 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.89■■□□□ 1.42
C6orf48-209ENST00000395789 WDR62O43379 1518 aa23.84■■□□□ 1.41
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C6orf48-209ENST00000395789 IFT140Q96RY7 1462 aa23.43■■□□□ 1.34
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C6orf48-209ENST00000395789 PBRM1Q86U86 1689 aa22.99■■□□□ 1.27
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C6orf48-209ENST00000395789 ARHGEF11O15085 1522 aa22.62■■□□□ 1.21
C6orf48-209ENST00000395789 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.62■■□□□ 1.21
C6orf48-209ENST00000395789 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.62■■□□□ 1.21
C6orf48-209ENST00000395789 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.62■■□□□ 1.21
C6orf48-209ENST00000395789 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.6■■□□□ 1.21
C6orf48-209ENST00000395789 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.59■■□□□ 1.21
C6orf48-209ENST00000395789 SHROOM2Q13796 1616 aa22.5■■□□□ 1.19
C6orf48-209ENST00000395789 ARAP1Q96P48 1450 aa22.47■■□□□ 1.19
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