Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN17

LIN28B, Protein lin-28 homolog B, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LIN28BQ6ZN17 FLNB-202ENST00000358537 9391 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.893e-16■■■■■ 83
LIN28BQ6ZN17 FLNB-214ENST00000493452 7402 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.963e-16■■■■■ 83
LIN28BQ6ZN17 FLNB-212ENST00000490882 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.993e-16■■■■■ 83
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LIN28BQ6ZN17 ATP13A3-206ENST00000461660 3517 ntTSL 1 (best)4.26□□□□□ -1.731e-37■■■■■ 82.4
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LIN28BQ6ZN17 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.322e-24■■■■■ 82.1
LIN28BQ6ZN17 MAPK9-205ENST00000397072 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.382e-24■■■■■ 82.1
LIN28BQ6ZN17 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.32e-24■■■■■ 82.1
LIN28BQ6ZN17 DNMT1-201ENST00000340748 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.366e-36■■■■■ 82
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