RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287038.7

RPL30-201, Transcript of ribosomal protein L30, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPL30, Length 543 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30-201ENST00000287038 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.45■■■□□ 2.31
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RPL30-201ENST00000287038 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.73■■□□□ 1.55
RPL30-201ENST00000287038 NACADO15069 1562 aa24.67■■□□□ 1.54
RPL30-201ENST00000287038 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
RPL30-201ENST00000287038 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.46■■□□□ 1.51
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RPL30-201ENST00000287038 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.21■■□□□ 1.47
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RPL30-201ENST00000287038 SCRIBQ14160 1630 aa23.94■■□□□ 1.42
RPL30-201ENST00000287038 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.84■■□□□ 1.41
RPL30-201ENST00000287038 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.67■■□□□ 1.38
RPL30-201ENST00000287038 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
RPL30-201ENST00000287038 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.33■■□□□ 1.32
RPL30-201ENST00000287038 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.18■■□□□ 1.3
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RPL30-201ENST00000287038 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RPL30-201ENST00000287038 NCAPD3P42695 1498 aa22.79■■□□□ 1.24
RPL30-201ENST00000287038 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.79■■□□□ 1.24
RPL30-201ENST00000287038 SMARCA2P51531 1590 aa22.73■■□□□ 1.23
RPL30-201ENST00000287038 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.72■■□□□ 1.23
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RPL30-201ENST00000287038 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.63■■□□□ 1.21
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RPL30-201ENST00000287038 NESP48681 1621 aa22.31■■□□□ 1.16
RPL30-201ENST00000287038 ERCC6Q03468 1493 aa22.23■■□□□ 1.15
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RPL30-201ENST00000287038 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.06■■□□□ 1.12
RPL30-201ENST00000287038 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.02■■□□□ 1.12
RPL30-201ENST00000287038 CUX2O14529 1486 aa22.01■■□□□ 1.11
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RPL30-201ENST00000287038 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
RPL30-201ENST00000287038 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.86■■□□□ 1.09
RPL30-201ENST00000287038 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.83■■□□□ 1.09
RPL30-201ENST00000287038 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.83■■□□□ 1.08
RPL30-201ENST00000287038 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
RPL30-201ENST00000287038 PRDM2Q13029 1718 aa21.77■■□□□ 1.08
RPL30-201ENST00000287038 WDR62O43379 1518 aa21.75■■□□□ 1.07
RPL30-201ENST00000287038 CHIC1Q5VXU3 224 aa21.68■■□□□ 1.06
RPL30-201ENST00000287038 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
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RPL30-201ENST00000287038 ABCC8Q09428 1581 aa21.48■■□□□ 1.03
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RPL30-201ENST00000287038 IFT140Q96RY7 1462 aa21.39■■□□□ 1.01
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RPL30-201ENST00000287038 CUX1P39880 1505 aa21.3■■□□□ 1
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RPL30-201ENST00000287038 SOGA1O94964 1423 aa21.25■□□□□ 0.99
RPL30-201ENST00000287038 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.25■□□□□ 0.99
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RPL30-201ENST00000287038 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
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RPL30-201ENST00000287038 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.12■□□□□ 0.97
RPL30-201ENST00000287038 TOP2BQ02880 1626 aa21.08■□□□□ 0.97
RPL30-201ENST00000287038 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.08■□□□□ 0.97
RPL30-201ENST00000287038 SYNJ1O43426 1573 aa21.08■□□□□ 0.97
RPL30-201ENST00000287038 WDR97A6NE52 1622 aa21.06■□□□□ 0.96
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RPL30-201ENST00000287038 FBLN2P98095 1184 aa21■□□□□ 0.95
RPL30-201ENST00000287038 CHD1O14646 1710 aa20.99■□□□□ 0.95
RPL30-201ENST00000287038 GRIN2BQ13224 1484 aa20.98■□□□□ 0.95
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RPL30-201ENST00000287038 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.95■□□□□ 0.94
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RPL30-201ENST00000287038 CEP170Q5SW79 1584 aa20.63■□□□□ 0.89
RPL30-201ENST00000287038 NUP160Q12769 1436 aa20.61■□□□□ 0.89
RPL30-201ENST00000287038 ARAP1Q96P48 1450 aa20.59■□□□□ 0.89
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RPL30-201ENST00000287038 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.51■□□□□ 0.87
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