RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393362.8

MAPK9-204, Transcript of mitogen-activated protein kinase 9, humanhuman

TSL 5

Gene MAPK9, Length 1,344 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPK9-204ENST00000393362 NISCHQ9Y2I1 1504 aa82.26■■■■■ 10.76
MAPK9-204ENST00000393362 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa73.22■■■■■ 9.31
MAPK9-204ENST00000393362 ABCC9O60706 1549 aa72.49■■■■■ 9.2
MAPK9-204ENST00000393362 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa69.3■■■■■ 8.68
MAPK9-204ENST00000393362 DCAF8L2P0C7V8 631 aa69.15■■■■■ 8.66
MAPK9-204ENST00000393362 NACADO15069 1562 aa69.09■■■■■ 8.65
MAPK9-204ENST00000393362 MYO15BQ96JP2 1530 aa68.47■■■■■ 8.55
MAPK9-204ENST00000393362 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP68.35■■■■■ 8.53
MAPK9-204ENST00000393362 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa67.96■■■■■ 8.47
MAPK9-204ENST00000393362 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP67.77■■■■■ 8.44
MAPK9-204ENST00000393362 UNC13AQ9UPW8 1703 aa67.72■■■■■ 8.43
MAPK9-204ENST00000393362 DNAJC5BQ9UF47 199 aa67.36■■■■■ 8.37
MAPK9-204ENST00000393362 BICRAQ9NZM4 1560 aa67.36■■■■■ 8.37
MAPK9-204ENST00000393362 SCRIBQ14160 1630 aa66.89■■■■■ 8.3
MAPK9-204ENST00000393362 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa66.39■■■■■ 8.22
MAPK9-204ENST00000393362 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP65.57■■■■■ 8.09
MAPK9-204ENST00000393362 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa65.47■■■■■ 8.07
MAPK9-204ENST00000393362 CECR2Q9BXF3 1484 aa65.17■■■■■ 8.02
MAPK9-204ENST00000393362 SMARCA4P51532 1647 aa63.9■■■■■ 7.82
MAPK9-204ENST00000393362 NCAPD3P42695 1498 aa63.87■■■■■ 7.82
MAPK9-204ENST00000393362 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa63.81■■■■■ 7.81
MAPK9-204ENST00000393362 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP63.72■■■■■ 7.79
MAPK9-204ENST00000393362 SMARCA2P51531 1590 aa63.58■■■■■ 7.77
MAPK9-204ENST00000393362 MROH2BQ7Z745 1585 aa63.44■■■■■ 7.75
MAPK9-204ENST00000393362 HMGXB3Q12766 1538 aa63.36■■■■■ 7.73
MAPK9-204ENST00000393362 PEG3Q9GZU2 1588 aa63.28■■■■■ 7.72
MAPK9-204ENST00000393362 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP63.17■■■■■ 7.7
MAPK9-204ENST00000393362 WIZO95785 1651 aa62.67■■■■■ 7.62
MAPK9-204ENST00000393362 NESP48681 1621 aa62.59■■■■■ 7.61
MAPK9-204ENST00000393362 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP62.51■■■■■ 7.6
MAPK9-204ENST00000393362 ERCC6Q03468 1493 aa62.43■■■■■ 7.59
MAPK9-204ENST00000393362 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa62.15■■■■■ 7.54
MAPK9-204ENST00000393362 CADPSQ9ULU8 1353 aa62■■■■■ 7.52
MAPK9-204ENST00000393362 CUX2O14529 1486 aa61.99■■■■■ 7.51
MAPK9-204ENST00000393362 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP61.91■■■■■ 7.5
MAPK9-204ENST00000393362 PDS5BQ9NTI5 1447 aa61.84■■■■■ 7.49
MAPK9-204ENST00000393362 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa61.65■■■■■ 7.46
MAPK9-204ENST00000393362 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP61.62■■■■■ 7.45
MAPK9-204ENST00000393362 CFTRP13569 1480 aa61.46■■■■■ 7.43
MAPK9-204ENST00000393362 CCDC88BA6NC98 1476 aa61.31■■■■■ 7.41
MAPK9-204ENST00000393362 FANCD2Q9BXW9 1451 aa61.24■■■■■ 7.39
MAPK9-204ENST00000393362 MRC2Q9UBG0 1479 aa61.22■■■■■ 7.39
MAPK9-204ENST00000393362 CEP164Q9UPV0 1460 aa61.16■■■■■ 7.38
MAPK9-204ENST00000393362 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa61.05■■■■■ 7.36
MAPK9-204ENST00000393362 WDR62O43379 1518 aa61.02■■■■■ 7.36
MAPK9-204ENST00000393362 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP60.7■■■■■ 7.31
MAPK9-204ENST00000393362 PRDM2Q13029 1718 aa60.69■■■■■ 7.31
MAPK9-204ENST00000393362 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP60.53■■■■■ 7.28
MAPK9-204ENST00000393362 TOPBP1Q92547 1522 aa60.19■■■■■ 7.23
MAPK9-204ENST00000393362 ABCC8Q09428 1581 aa60.07■■■■■ 7.21
MAPK9-204ENST00000393362 DNMBPQ6XZF7 1577 aa59.98■■■■■ 7.19
MAPK9-204ENST00000393362 IFT140Q96RY7 1462 aa59.93■■■■■ 7.18
MAPK9-204ENST00000393362 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP59.82■■■■■ 7.17
MAPK9-204ENST00000393362 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP59.64■■■■■ 7.14
MAPK9-204ENST00000393362 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP59.56■■■■■ 7.12
MAPK9-204ENST00000393362 CUX1P39880 1505 aa59.52■■■■■ 7.12
MAPK9-204ENST00000393362 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa59.47■■■■■ 7.11
MAPK9-204ENST00000393362 OSCARQ8IYS5 282 aa59.47■■■■■ 7.11
MAPK9-204ENST00000393362 SOGA1O94964 1423 aa59.43■■■■■ 7.1
MAPK9-204ENST00000393362 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP59.42■■■■■ 7.1
MAPK9-204ENST00000393362 FGD5Q6ZNL6 1462 aa59.4■■■■■ 7.1
MAPK9-204ENST00000393362 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP59.39■■■■■ 7.1
MAPK9-204ENST00000393362 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP59.23■■■■■ 7.07
MAPK9-204ENST00000393362 WDR97A6NE52 1622 aa58.89■■■■■ 7.02
MAPK9-204ENST00000393362 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP58.88■■■■■ 7.02
MAPK9-204ENST00000393362 FBLN2P98095 1184 aa58.84■■■■■ 7.01
MAPK9-204ENST00000393362 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa58.78■■■■■ 7
MAPK9-204ENST00000393362 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa58.77■■■■■ 7
MAPK9-204ENST00000393362 TOP2BQ02880 1626 aa58.76■■■■■ 7
MAPK9-204ENST00000393362 SYNJ1O43426 1573 aa58.76■■■■■ 7
MAPK9-204ENST00000393362 CHD1O14646 1710 aa58.76■■■■■ 7
MAPK9-204ENST00000393362 GRIN2BQ13224 1484 aa58.74■■■■■ 6.99
MAPK9-204ENST00000393362 TRIM41Q8WV44 630 aa58.73■■■■■ 6.99
MAPK9-204ENST00000393362 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa58.72■■■■■ 6.99
MAPK9-204ENST00000393362 GAPVD1Q14C86 1478 aa58.68■■■■■ 6.98
MAPK9-204ENST00000393362 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP58.61■■■■■ 6.97
MAPK9-204ENST00000393362 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP58.55■■■■■ 6.96
MAPK9-204ENST00000393362 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa58.54■■■■■ 6.96
MAPK9-204ENST00000393362 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa58.46■■■■■ 6.95
MAPK9-204ENST00000393362 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa58.46■■■■■ 6.95
MAPK9-204ENST00000393362 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa58.46■■■■■ 6.95
MAPK9-204ENST00000393362 PBRM1Q86U86 1689 aa58.45■■■■■ 6.95
MAPK9-204ENST00000393362 SYNJ2O15056 1496 aa58.42■■■■■ 6.94
MAPK9-204ENST00000393362 ARHGEF11O15085 1522 aa58.41■■■■■ 6.94
MAPK9-204ENST00000393362 CLASP1Q7Z460 1538 aa58.17■■■■■ 6.9
MAPK9-204ENST00000393362 CYB5RLQ6IPT4 315 aa58.05■■■■■ 6.88
MAPK9-204ENST00000393362 ADAMTS12P58397 1594 aa58.02■■■■■ 6.88
MAPK9-204ENST00000393362 ERICH3Q5RHP9 1530 aa58.01■■■■■ 6.88
MAPK9-204ENST00000393362 GRIN2AQ12879 1464 aa57.98■■■■■ 6.87
MAPK9-204ENST00000393362 FHAD1B1AJZ9 1412 aa57.98■■■■■ 6.87
MAPK9-204ENST00000393362 ARAP1Q96P48 1450 aa57.93■■■■■ 6.86
MAPK9-204ENST00000393362 NUP160Q12769 1436 aa57.78■■■■■ 6.84
MAPK9-204ENST00000393362 CEP170Q5SW79 1584 aa57.73■■■■■ 6.83
MAPK9-204ENST00000393362 KIF27Q86VH2 1401 aa57.69■■■■■ 6.82
MAPK9-204ENST00000393362 IGF1RP08069 1367 aa57.68■■■■■ 6.82
MAPK9-204ENST00000393362 ERCC6L2Q5T890 1561 aa57.43■■■■■ 6.78
MAPK9-204ENST00000393362 SHROOM2Q13796 1616 aa57.34■■■■■ 6.77
MAPK9-204ENST00000393362 JPH4Q96JJ6 628 aa57.3■■■■■ 6.76
MAPK9-204ENST00000393362 CUL7Q14999 1698 aa57.28■■■■■ 6.76
MAPK9-204ENST00000393362 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa57.26■■■■■ 6.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93.5 ms