Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 URI1-206ENST00000574110 2495 ntTSL 1 (best)34.86■■■■□ 3.172e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 URI1-208ENST00000574233 486 ntTSL 37□□□□□ -1.292e-7■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 LBR-203ENST00000421383 736 ntTSL 339.62■■■■□ 3.931e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 LBR-205ENST00000425080 874 ntTSL 314.02□□□□□ -0.171e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 TSC1-205ENST00000475903 820 ntTSL 422.92■■□□□ 1.263e-16■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 TSC1-206ENST00000490179 681 ntTSL 322.57■■□□□ 1.23e-16■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RPRD1B-204ENST00000471511 571 ntTSL 415.84■□□□□ 0.131e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 N4BP2L2-212ENST00000505213 2343 ntTSL 513.82□□□□□ -0.21e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RSRC1-213ENST00000494002 679 ntTSL 211.23□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 N4BP2L2-213ENST00000509076 3060 ntTSL 57.65□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 N4BP2L2-209ENST00000503296 2315 ntTSL 27.58□□□□□ -1.21e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 N4BP2L2-206ENST00000473025 273 ntTSL 46.96□□□□□ -1.31e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.391e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RSRC1-204ENST00000468344 551 ntTSL 35.97□□□□□ -1.451e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 N4BP2L2-203ENST00000380121 2807 ntTSL 1 (best)4.7□□□□□ -1.661e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.941e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.951e-8■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RB1CC1-206ENST00000518710 711 ntTSL 339.66■■■■□ 3.942e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RB1CC1-208ENST00000521611 528 ntTSL 536.78■■■■□ 3.481e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RB1CC1-204ENST00000518211 891 ntTSL 529.7■■■□□ 2.352e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RB1CC1-203ENST00000517963 551 ntTSL 428.51■■■□□ 2.152e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 RB1CC1-205ENST00000518468 507 ntTSL 34.07□□□□□ -1.762e-6■■■■■ 29.1
HNRNPMP52272 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 213.36□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ELP3-215ENST00000523357 874 ntTSL 316.33■□□□□ 0.29e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ELP3-218ENST00000524103 1914 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.149e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ELP3-202ENST00000380353 3078 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.269e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.299e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ELP3-210ENST00000521015 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.429e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ELP3-204ENST00000518112 2059 ntTSL 212.17□□□□□ -0.469e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ELP3-216ENST00000523687 1923 ntTSL 211.58□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ELP3-205ENST00000519261 1924 ntTSL 211.32□□□□□ -0.69e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ELP3-203ENST00000517975 680 ntTSL 35.56□□□□□ -1.529e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.341e-6■■■■■ 29
HNRNPMP52272 RCL1-206ENST00000442869 1644 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 29
HNRNPMP52272 NSUN2-205ENST00000505892 3558 ntTSL 1 (best)11.15□□□□□ -0.625e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.233e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-216ENST00000479525 1368 ntTSL 527.94■■■□□ 2.063e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.433e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.973e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-209ENST00000454591 1515 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.353e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ZNF507-202ENST00000355898 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-207ENST00000430841 1009 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.833e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-208ENST00000436638 766 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.3□□□□□ -0.923e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-206ENST00000417628 767 ntTSL 58.88□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-204ENST00000368292 854 ntTSL 56.97□□□□□ -1.293e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-211ENST00000460558 301 ntTSL 56.73□□□□□ -1.333e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-215ENST00000475319 1543 ntTSL 26.6□□□□□ -1.353e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-205ENST00000368295 1966 ntTSL 55.05□□□□□ -1.63e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.633e-8■■■■■ 29
HNRNPMP52272 CBFA2T2-207ENST00000471007 712 ntTSL 233.81■■■■□ 31e-6■■■■■ 29
HNRNPMP52272 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.421e-6■■■■■ 29
HNRNPMP52272 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 29
HNRNPMP52272 FAT1-201ENST00000441802 14786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.589e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.769e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.29■□□□□ 0.26e-15■■■■■ 29
HNRNPMP52272 MORC2-206ENST00000476152 811 ntTSL 57.93□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 29
HNRNPMP52272 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.986e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 POLE4-201ENST00000233699 602 ntTSL 318.26■□□□□ 0.516e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 POLE4-203ENST00000465242 528 ntTSL 28.11□□□□□ -1.116e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-221ENST00000513121 573 ntTSL 230.53■■■□□ 2.484e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-225ENST00000514528 532 ntTSL 427.67■■■□□ 2.024e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.014e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-222ENST00000513678 444 ntTSL 226.93■■□□□ 1.94e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-220ENST00000512876 575 ntTSL 326.93■■□□□ 1.94e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-208ENST00000504045 1530 ntTSL 526.78■■□□□ 1.884e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-213ENST00000508689 561 ntTSL 425.95■■□□□ 1.744e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-239ENST00000514694 587 ntTSL 424.05■■□□□ 1.444e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-235ENST00000506147 580 ntTSL 423.96■■□□□ 1.434e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-238ENST00000512107 579 ntTSL 422.52■■□□□ 1.24e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-236ENST00000509644 750 ntTSL 321.15■□□□□ 0.984e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-234ENST00000505016 664 ntTSL 219.71■□□□□ 0.754e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-231ENST00000502394 589 ntTSL 418.32■□□□□ 0.524e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.514e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.364e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.044e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-210ENST00000504643 2560 ntTSL 212.46□□□□□ -0.424e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.544e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.574e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.884e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.144e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-218ENST00000511978 573 ntTSL 37.77□□□□□ -1.174e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-212ENST00000507860 571 ntTSL 46.76□□□□□ -1.334e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-214ENST00000509918 377 ntTSL 45.47□□□□□ -1.534e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-209ENST00000504311 423 ntTSL 35.34□□□□□ -1.554e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 MATR3-216ENST00000511249 447 ntTSL 45.06□□□□□ -1.64e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 ANKRD11-210ENST00000566858 580 ntTSL 425.8■■□□□ 1.723e-7■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 PTPN4-207ENST00000460162 623 ntTSL 436.44■■■■□ 3.421e-9■■■■■ 28.9
HNRNPMP52272 PTPN4-208ENST00000460289 577 ntTSL 436.3■■■■□ 3.41e-9■■■■■ 28.9
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 155.3 ms