RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421383.1

LBR-203, Transcript of lamin B receptor, humanhuman

TSL 3

Gene LBR, Length 736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBR-203ENST00000421383 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.15■■■■■ 7.38
LBR-203ENST00000421383 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa54.4■■■■■ 6.3
LBR-203ENST00000421383 ABCC9O60706 1549 aa53.93■■■■■ 6.22
LBR-203ENST00000421383 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.72■■■■■ 5.87
LBR-203ENST00000421383 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.55■■■■■ 5.84
LBR-203ENST00000421383 NACADO15069 1562 aa51.36■■■■■ 5.81
LBR-203ENST00000421383 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.81■■■■■ 5.72
LBR-203ENST00000421383 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.78■■■■■ 5.72
LBR-203ENST00000421383 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.47■■■■■ 5.67
LBR-203ENST00000421383 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.46■■■■■ 5.67
LBR-203ENST00000421383 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.26■■■■■ 5.64
LBR-203ENST00000421383 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.97■■■■■ 5.59
LBR-203ENST00000421383 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.95■■■■■ 5.59
LBR-203ENST00000421383 SCRIBQ14160 1630 aa49.79■■■■■ 5.56
LBR-203ENST00000421383 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.3■■■■■ 5.48
LBR-203ENST00000421383 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.71■■■■■ 5.39
LBR-203ENST00000421383 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.65■■■■■ 5.38
LBR-203ENST00000421383 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.47■■■■■ 5.35
LBR-203ENST00000421383 SMARCA4P51532 1647 aa47.5■■■■■ 5.19
LBR-203ENST00000421383 NCAPD3P42695 1498 aa47.44■■■■■ 5.18
LBR-203ENST00000421383 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.42■■■■■ 5.18
LBR-203ENST00000421383 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
LBR-203ENST00000421383 SMARCA2P51531 1590 aa47.3■■■■■ 5.16
LBR-203ENST00000421383 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.15■■■■■ 5.14
LBR-203ENST00000421383 HMGXB3Q12766 1538 aa47.07■■■■■ 5.13
LBR-203ENST00000421383 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.04■■■■■ 5.12
LBR-203ENST00000421383 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.95■■■■■ 5.11
LBR-203ENST00000421383 WIZO95785 1651 aa46.62■■■■■ 5.05
LBR-203ENST00000421383 ERCC6Q03468 1493 aa46.55■■■■■ 5.04
LBR-203ENST00000421383 NESP48681 1621 aa46.51■■■■■ 5.04
LBR-203ENST00000421383 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.48■■■■■ 5.03
LBR-203ENST00000421383 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.22■■■■■ 4.99
LBR-203ENST00000421383 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.11■■■■■ 4.97
LBR-203ENST00000421383 CUX2O14529 1486 aa46.06■■■■■ 4.96
LBR-203ENST00000421383 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.04■■■■■ 4.96
LBR-203ENST00000421383 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.03■■■■■ 4.96
LBR-203ENST00000421383 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.82■■■■■ 4.92
LBR-203ENST00000421383 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.72■■■■■ 4.91
LBR-203ENST00000421383 CFTRP13569 1480 aa45.67■■■■■ 4.9
LBR-203ENST00000421383 CCDC88BA6NC98 1476 aa45.61■■■■■ 4.89
LBR-203ENST00000421383 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.56■■■■■ 4.88
LBR-203ENST00000421383 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.53■■■■■ 4.88
LBR-203ENST00000421383 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.53■■■■■ 4.88
LBR-203ENST00000421383 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.33■■■■■ 4.85
LBR-203ENST00000421383 WDR62O43379 1518 aa45.31■■■■■ 4.84
LBR-203ENST00000421383 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.28■■■■■ 4.84
LBR-203ENST00000421383 PRDM2Q13029 1718 aa45.11■■■■■ 4.81
LBR-203ENST00000421383 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.09■■■■■ 4.81
LBR-203ENST00000421383 TOPBP1Q92547 1522 aa44.75■■■■■ 4.76
LBR-203ENST00000421383 ABCC8Q09428 1581 aa44.73■■■■■ 4.75
LBR-203ENST00000421383 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.61■■■■■ 4.73
LBR-203ENST00000421383 IFT140Q96RY7 1462 aa44.59■■■■■ 4.73
LBR-203ENST00000421383 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.46■■■■■ 4.71
LBR-203ENST00000421383 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.34■■■■■ 4.69
LBR-203ENST00000421383 OSCARQ8IYS5 282 aa44.31■■■■■ 4.68
LBR-203ENST00000421383 SOGA1O94964 1423 aa44.27■■■■■ 4.68
LBR-203ENST00000421383 CUX1P39880 1505 aa44.24■■■■■ 4.67
LBR-203ENST00000421383 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.24■■■■■ 4.67
LBR-203ENST00000421383 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.21■■■■■ 4.67
LBR-203ENST00000421383 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.21■■■■■ 4.67
LBR-203ENST00000421383 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.2■■■■■ 4.67
LBR-203ENST00000421383 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
LBR-203ENST00000421383 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
LBR-203ENST00000421383 FBLN2P98095 1184 aa43.97■■■■■ 4.63
LBR-203ENST00000421383 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.87■■■■■ 4.61
LBR-203ENST00000421383 TRIM41Q8WV44 630 aa43.82■■■■■ 4.61
LBR-203ENST00000421383 WDR97A6NE52 1622 aa43.77■■■■■ 4.6
LBR-203ENST00000421383 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.73■■■■■ 4.59
LBR-203ENST00000421383 GRIN2BQ13224 1484 aa43.72■■■■■ 4.59
LBR-203ENST00000421383 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.71■■■■■ 4.59
LBR-203ENST00000421383 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.7■■■■■ 4.59
LBR-203ENST00000421383 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.7■■■■■ 4.59
LBR-203ENST00000421383 TOP2BQ02880 1626 aa43.7■■■■■ 4.59
LBR-203ENST00000421383 SYNJ1O43426 1573 aa43.69■■■■■ 4.58
LBR-203ENST00000421383 CHD1O14646 1710 aa43.68■■■■■ 4.58
LBR-203ENST00000421383 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.65■■■■■ 4.58
LBR-203ENST00000421383 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.6■■■■■ 4.57
LBR-203ENST00000421383 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.48■■■■■ 4.55
LBR-203ENST00000421383 PBRM1Q86U86 1689 aa43.48■■■■■ 4.55
LBR-203ENST00000421383 SYNJ2O15056 1496 aa43.46■■■■■ 4.55
LBR-203ENST00000421383 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.44■■■■■ 4.54
LBR-203ENST00000421383 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.44■■■■■ 4.54
LBR-203ENST00000421383 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.44■■■■■ 4.54
LBR-203ENST00000421383 ARHGEF11O15085 1522 aa43.4■■■■■ 4.54
LBR-203ENST00000421383 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.28■■■■■ 4.52
LBR-203ENST00000421383 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.18■■■■■ 4.5
LBR-203ENST00000421383 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.16■■■■■ 4.5
LBR-203ENST00000421383 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.15■■■■■ 4.5
LBR-203ENST00000421383 GRIN2AQ12879 1464 aa43.13■■■■■ 4.49
LBR-203ENST00000421383 ADAMTS12P58397 1594 aa43.12■■■■■ 4.49
LBR-203ENST00000421383 ARAP1Q96P48 1450 aa43.02■■■■■ 4.48
LBR-203ENST00000421383 KIF27Q86VH2 1401 aa43■■■■■ 4.47
LBR-203ENST00000421383 NUP160Q12769 1436 aa42.93■■■■■ 4.46
LBR-203ENST00000421383 IGF1RP08069 1367 aa42.9■■■■■ 4.46
LBR-203ENST00000421383 CEP170Q5SW79 1584 aa42.9■■■■■ 4.46
LBR-203ENST00000421383 JPH4Q96JJ6 628 aa42.71■■■■■ 4.43
LBR-203ENST00000421383 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.67■■■■■ 4.42
LBR-203ENST00000421383 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.65■■■■■ 4.42
LBR-203ENST00000421383 CUL7Q14999 1698 aa42.64■■■■■ 4.42
LBR-203ENST00000421383 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.61■■■■■ 4.41
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