RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521611.1

RB1CC1-208, Transcript of RB1 inducible coiled-coil 1, humanhuman

TSL 5

Gene RB1CC1, Length 528 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1-208ENST00000521611 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.04■■■■■ 6.72
RB1CC1-208ENST00000521611 ABCC9O60706 1549 aa51.86■■■■■ 5.89
RB1CC1-208ENST00000521611 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.3■■■■■ 5.8
RB1CC1-208ENST00000521611 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.07■■■■■ 5.45
RB1CC1-208ENST00000521611 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.99■■■■■ 5.43
RB1CC1-208ENST00000521611 NACADO15069 1562 aa48.6■■■■■ 5.37
RB1CC1-208ENST00000521611 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.52■■■■■ 5.36
RB1CC1-208ENST00000521611 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.26■■■■■ 5.32
RB1CC1-208ENST00000521611 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.02■■■■■ 5.28
RB1CC1-208ENST00000521611 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.71■■■■■ 5.23
RB1CC1-208ENST00000521611 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.68■■■■■ 5.22
RB1CC1-208ENST00000521611 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.19■■■■■ 5.14
RB1CC1-208ENST00000521611 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.99■■■■■ 5.11
RB1CC1-208ENST00000521611 SCRIBQ14160 1630 aa46.89■■■■■ 5.1
RB1CC1-208ENST00000521611 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.84■■■■■ 5.09
RB1CC1-208ENST00000521611 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.76■■■■■ 5.08
RB1CC1-208ENST00000521611 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.7■■■■■ 5.07
RB1CC1-208ENST00000521611 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.55■■■■■ 5.04
RB1CC1-208ENST00000521611 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.17■■■■■ 4.82
RB1CC1-208ENST00000521611 NCAPD3P42695 1498 aa44.87■■■■■ 4.77
RB1CC1-208ENST00000521611 ERCC6Q03468 1493 aa44.78■■■■■ 4.76
RB1CC1-208ENST00000521611 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.74■■■■■ 4.75
RB1CC1-208ENST00000521611 CUX2O14529 1486 aa44.72■■■■■ 4.75
RB1CC1-208ENST00000521611 SMARCA4P51532 1647 aa44.61■■■■■ 4.73
RB1CC1-208ENST00000521611 SMARCA2P51531 1590 aa44.56■■■■■ 4.72
RB1CC1-208ENST00000521611 HMGXB3Q12766 1538 aa44.5■■■■■ 4.71
RB1CC1-208ENST00000521611 NESP48681 1621 aa44.44■■■■■ 4.7
RB1CC1-208ENST00000521611 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
RB1CC1-208ENST00000521611 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
RB1CC1-208ENST00000521611 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.08■■■■■ 4.65
RB1CC1-208ENST00000521611 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.01■■■■■ 4.64
RB1CC1-208ENST00000521611 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.99■■■■■ 4.63
RB1CC1-208ENST00000521611 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.94■■■■■ 4.62
RB1CC1-208ENST00000521611 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.82■■■■■ 4.61
RB1CC1-208ENST00000521611 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.72■■■■■ 4.59
RB1CC1-208ENST00000521611 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.54■■■■■ 4.56
RB1CC1-208ENST00000521611 WIZO95785 1651 aa43.49■■■■■ 4.55
RB1CC1-208ENST00000521611 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.38■■■■■ 4.54
RB1CC1-208ENST00000521611 WDR62O43379 1518 aa43.27■■■■■ 4.52
RB1CC1-208ENST00000521611 TRIM41Q8WV44 630 aa43.2■■■■■ 4.51
RB1CC1-208ENST00000521611 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.15■■■■■ 4.5
RB1CC1-208ENST00000521611 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.08■■■■■ 4.49
RB1CC1-208ENST00000521611 CFTRP13569 1480 aa42.94■■■■■ 4.46
RB1CC1-208ENST00000521611 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
RB1CC1-208ENST00000521611 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.84■■■■■ 4.45
RB1CC1-208ENST00000521611 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
RB1CC1-208ENST00000521611 OSCARQ8IYS5 282 aa42.66■■■■■ 4.42
RB1CC1-208ENST00000521611 PRDM2Q13029 1718 aa42.48■■■■■ 4.39
RB1CC1-208ENST00000521611 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.4■■■■■ 4.38
RB1CC1-208ENST00000521611 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
RB1CC1-208ENST00000521611 IFT140Q96RY7 1462 aa42.27■■■■■ 4.36
RB1CC1-208ENST00000521611 TOPBP1Q92547 1522 aa42.22■■■■■ 4.35
RB1CC1-208ENST00000521611 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1-208ENST00000521611 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1-208ENST00000521611 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.19■■■■■ 4.34
RB1CC1-208ENST00000521611 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.05■■■■■ 4.32
RB1CC1-208ENST00000521611 ARHGEF11O15085 1522 aa42■■■■■ 4.31
RB1CC1-208ENST00000521611 ABCC8Q09428 1581 aa42■■■■■ 4.31
RB1CC1-208ENST00000521611 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42■■■■■ 4.31
RB1CC1-208ENST00000521611 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.9■■■■■ 4.31e-6■■■■□ 23.3
RB1CC1-208ENST00000521611 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.85■■■■■ 4.29
RB1CC1-208ENST00000521611 CHD1O14646 1710 aa41.83■■■■■ 4.29
RB1CC1-208ENST00000521611 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.78■■■■■ 4.28
RB1CC1-208ENST00000521611 FBLN2P98095 1184 aa41.77■■■■■ 4.28
RB1CC1-208ENST00000521611 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
RB1CC1-208ENST00000521611 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.68■■■■■ 4.26
RB1CC1-208ENST00000521611 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
RB1CC1-208ENST00000521611 ARAP1Q96P48 1450 aa41.58■■■■■ 4.25
RB1CC1-208ENST00000521611 SOGA1O94964 1423 aa41.57■■■■■ 4.25
RB1CC1-208ENST00000521611 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.48■■■■■ 4.23
RB1CC1-208ENST00000521611 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
RB1CC1-208ENST00000521611 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.45■■■■■ 4.23
RB1CC1-208ENST00000521611 CUX1P39880 1505 aa41.37■■■■■ 4.21
RB1CC1-208ENST00000521611 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
RB1CC1-208ENST00000521611 WDR97A6NE52 1622 aa41.29■■■■■ 4.2
RB1CC1-208ENST00000521611 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.28■■■■■ 4.2
RB1CC1-208ENST00000521611 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
RB1CC1-208ENST00000521611 GRIN2BQ13224 1484 aa41.23■■■■■ 4.19
RB1CC1-208ENST00000521611 SYNJ1O43426 1573 aa41.22■■■■■ 4.19
RB1CC1-208ENST00000521611 SYNJ2O15056 1496 aa41.13■■■■■ 4.17
RB1CC1-208ENST00000521611 PBRM1Q86U86 1689 aa41.07■■■■■ 4.17
RB1CC1-208ENST00000521611 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.05■■■■■ 4.16
RB1CC1-208ENST00000521611 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.92■■■■■ 4.14
RB1CC1-208ENST00000521611 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.91■■■■■ 4.14
RB1CC1-208ENST00000521611 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
RB1CC1-208ENST00000521611 GRIN2AQ12879 1464 aa40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1-208ENST00000521611 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.71■■■■■ 4.11
RB1CC1-208ENST00000521611 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.69■■■■■ 4.1
RB1CC1-208ENST00000521611 ADAMTS12P58397 1594 aa40.65■■■■■ 4.1
RB1CC1-208ENST00000521611 CEP170Q5SW79 1584 aa40.61■■■■■ 4.09
RB1CC1-208ENST00000521611 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.56■■■■■ 4.08
RB1CC1-208ENST00000521611 NUP160Q12769 1436 aa40.55■■■■■ 4.08
RB1CC1-208ENST00000521611 TOP2BQ02880 1626 aa40.55■■■■■ 4.08
RB1CC1-208ENST00000521611 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.53■■■■■ 4.08
RB1CC1-208ENST00000521611 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.49■■■■■ 4.07
RB1CC1-208ENST00000521611 SHROOM2Q13796 1616 aa40.41■■■■■ 4.06
RB1CC1-208ENST00000521611 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.37■■■■■ 4.05
RB1CC1-208ENST00000521611 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.26■■■■■ 4.04
RB1CC1-208ENST00000521611 JPH4Q96JJ6 628 aa40.19■■■■■ 4.02
RB1CC1-208ENST00000521611 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.14■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms