Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 CASC19-273ENST00000642010 925 nt8.35□□□□□ -1.073e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.083e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 KIDINS220-209ENST00000489024 4084 ntTSL 58.08□□□□□ -1.123e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-214ENST00000641171 1493 nt7.97□□□□□ -1.133e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-252ENST00000641704 1313 nt7.9□□□□□ -1.143e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.151e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 KIDINS220-202ENST00000319688 3765 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.153e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-216ENST00000641179 1140 nt7.77□□□□□ -1.173e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 HIVEP1-206ENST00000487103 585 ntTSL 27.62□□□□□ -1.193e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-283ENST00000642134 870 nt7.61□□□□□ -1.193e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-239ENST00000641547 915 nt7.49□□□□□ -1.213e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-224ENST00000641362 1146 nt7.49□□□□□ -1.213e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-220ENST00000641298 974 nt7.49□□□□□ -1.213e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-276ENST00000642077 993 nt7.49□□□□□ -1.213e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.213e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-207ENST00000641029 1047 nt7.47□□□□□ -1.213e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 HIVEP1-207ENST00000491710 579 ntTSL 37.47□□□□□ -1.213e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC7.46□□□□□ -1.213e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-257ENST00000641786 816 nt7.43□□□□□ -1.223e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 IPO11-205ENST00000424533 3005 ntTSL 27.37□□□□□ -1.233e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.243e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-211ENST00000641106 1184 nt7.23□□□□□ -1.253e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC7.22□□□□□ -1.253e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC7.2□□□□□ -1.263e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-266ENST00000641934 1050 nt7.07□□□□□ -1.283e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CDC73-204ENST00000635846 3987 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.283e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.283e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CHKA-205ENST00000530730 582 ntTSL 36.81□□□□□ -1.323e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-249ENST00000641681 871 nt6.8□□□□□ -1.323e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-225ENST00000641365 2219 nt6.5□□□□□ -1.373e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.49□□□□□ -1.373e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-233ENST00000641487 966 nt6.48□□□□□ -1.373e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-274ENST00000642018 970 ntBASIC6.41□□□□□ -1.383e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.393e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.18□□□□□ -1.423e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC5.99□□□□□ -1.453e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CHKA-208ENST00000533910 864 ntTSL 35.91□□□□□ -1.463e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 KIDINS220-212ENST00000569008 8735 ntTSL 55.86□□□□□ -1.473e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CCDC144NL-AS1-204ENST00000437829 837 ntTSL 55.83□□□□□ -1.481e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.71□□□□□ -1.493e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 KIDINS220-208ENST00000488729 5988 ntTSL 1 (best)5.54□□□□□ -1.523e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-215ENST00000641174 959 nt5.45□□□□□ -1.543e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.541e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.32□□□□□ -1.563e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC5.21□□□□□ -1.583e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC5.12□□□□□ -1.593e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CHKA-204ENST00000528235 570 ntTSL 55.11□□□□□ -1.593e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC4.99□□□□□ -1.613e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-262ENST00000641867 866 nt4.88□□□□□ -1.633e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CCNT2-207ENST00000452521 638 ntTSL 34.86□□□□□ -1.632e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.631e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.63□□□□□ -1.673e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.672e-10■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PUS10-206ENST00000602599 6366 ntTSL 1 (best)4.46□□□□□ -1.71e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.753e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PCM1-215ENST00000522275 2379 ntTSL 24.07□□□□□ -1.763e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 TSG101-206ENST00000542488 304 ntTSL 53.77□□□□□ -1.813e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 AC138409.2-204ENST00000512782 1398 ntTSL 1 (best)3.51□□□□□ -1.853e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 CASC19-217ENST00000641187 875 nt3.37□□□□□ -1.873e-13■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.023e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 ADCY6-203ENST00000547260 4758 ntTSL 213.32□□□□□ -0.282e-7■■□□□ 14.5
PCBP2Q15366 EPB41L5-206ENST00000461128 622 ntTSL 24.8□□□□□ -1.642e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.81e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 STRN4-222ENST00000601869 2240 nt19.08■□□□□ 0.652e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 STRN4-208ENST00000594581 2692 ntTSL 217.53■□□□□ 0.42e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 PCGF5-202ENST00000490164 973 ntTSL 215.61■□□□□ 0.095e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 HNRNPD-205ENST00000507010 748 ntTSL 323.09■■□□□ 1.296e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.236e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 HNRNPD-209ENST00000513584 1240 ntTSL 222.53■■□□□ 1.26e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.16e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 HNRNPD-204ENST00000503822 607 ntTSL 520.52■□□□□ 0.886e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 HNRNPD-207ENST00000509107 583 ntTSL 519.92■□□□□ 0.786e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.336e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 HNRNPD-212ENST00000515432 545 ntTSL 57.01□□□□□ -1.296e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 HDLBP-232ENST00000470482 624 ntTSL 210.93□□□□□ -0.665e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 NCOA2-202ENST00000518287 6087 ntTSL 56.58□□□□□ -1.362e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 CS-215ENST00000549143 2811 ntTSL 28.24□□□□□ -1.091e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.261e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.371e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.516e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.096e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.096e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 C16orf58-210ENST00000568491 2422 ntTSL 214.5□□□□□ -0.096e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.322e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.829e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 IGF2BP2-208ENST00000466476 469 ntTSL 211.24□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.379e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.853e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 RNF40-203ENST00000493683 5371 ntTSL 219.33■□□□□ 0.693e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 RNF40-212ENST00000602784 991 ntTSL 313.29□□□□□ -0.283e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.793e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 RNF40-202ENST00000357890 3917 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.873e-9■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.962e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 CDK5RAP2-214ENST00000481266 970 ntTSL 518.51■□□□□ 0.551e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 CDK5RAP2-218ENST00000491334 546 ntTSL 217.87■□□□□ 0.451e-7■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.282e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-6■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.4■□□□□ 0.382e-8■■□□□ 14.4
PCBP2Q15366 UBAP2L-214ENST00000475373 838 ntTSL 29.14□□□□□ -0.952e-8■■□□□ 14.4
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