RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.28■□□□□ 0.36
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CS-212ENST00000548567 ABCC8Q09428 1581 aa12.83□□□□□ -0.36
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CS-212ENST00000548567 TOPBP1Q92547 1522 aa12.79□□□□□ -0.36
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CS-212ENST00000548567 IFT140Q96RY7 1462 aa12.62□□□□□ -0.39
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CS-212ENST00000548567 UBTFP17480 764 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
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CS-212ENST00000548567 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-212ENST00000548567 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-212ENST00000548567 ARHGEF11O15085 1522 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-212ENST00000548567 SYNJ1O43426 1573 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-212ENST00000548567 GRIN2BQ13224 1484 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-212ENST00000548567 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 ARAP1Q96P48 1450 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 IGF1RP08069 1367 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-212ENST00000548567 MYT1LQ9UL68 1186 aa12.41□□□□□ -0.42
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