Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 95.2
SF3B1O75533 DOCK2-217ENST00000540750 1753 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.826e-6■■■■■ 95.2
SF3B1O75533 DOCK2-208ENST00000520181 1154 ntTSL 57.49□□□□□ -1.216e-6■■■■■ 95.2
SF3B1O75533 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.43e-6■■■■■ 95.2
SF3B1O75533 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.923e-6■■■■■ 95.2
SF3B1O75533 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.323e-6■■■■■ 95.2
SF3B1O75533 PIK3C2A-203ENST00000531428 1593 ntTSL 1 (best)16.54■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 95.2
SF3B1O75533 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 95.2
SF3B1O75533 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.842e-6■■■■■ 95.1
SF3B1O75533 RUNX1-204ENST00000399237 822 ntTSL 523.42■■□□□ 1.343e-6■■■■■ 95.1
SF3B1O75533 MED24-206ENST00000428757 1105 ntTSL 517.56■□□□□ 0.44e-6■■■■■ 95.1
SF3B1O75533 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 95
SF3B1O75533 PPIL2-205ENST00000446951 1926 ntTSL 1 (best)15.91■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 95
SF3B1O75533 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 95
SF3B1O75533 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 54.83□□□□□ -1.641e-6■■■■■ 95
SF3B1O75533 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.164e-6■■■■■ 95
SF3B1O75533 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.042e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.62e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 PPP6R2-201ENST00000216061 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 OTUD7B-201ENST00000417191 1425 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.045e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 R3HDM1-219ENST00000488035 502 ntTSL 32.03□□□□□ -2.082e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-230ENST00000565908 805 ntTSL 326.32■■□□□ 1.82e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-248ENST00000616053 8140 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-238ENST00000568169 870 ntTSL 512.64□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-202ENST00000356073 8317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-232ENST00000566286 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-236ENST00000567880 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-231ENST00000566279 2128 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.732e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-240ENST00000568673 2398 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-226ENST00000565018 2357 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.892e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-205ENST00000537578 2767 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-224ENST00000564403 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.962e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-241ENST00000568740 2628 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-207ENST00000540999 2572 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-203ENST00000398339 2551 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-252ENST00000626425 579 ntTSL 48.51□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-260ENST00000627685 882 ntTSL 58.31□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-255ENST00000626595 833 ntTSL 57.72□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-283ENST00000637115 7883 ntTSL 57.43□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-234ENST00000566514 969 ntTSL 37.01□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.292e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-285ENST00000637239 7771 ntTSL 56.86□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-271ENST00000630319 737 ntTSL 56.69□□□□□ -1.342e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-257ENST00000627136 624 ntTSL 55.69□□□□□ -1.52e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.532e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 TCF4-280ENST00000636751 8283 ntTSL 55.05□□□□□ -1.62e-6■■■■■ 94.9
SF3B1O75533 FOXN2-202ENST00000413569 932 ntTSL 315.31■□□□□ 0.047e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 PRKD2-215ENST00000601605 536 ntTSL 513.95□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 VPS4A-204ENST00000566354 2329 ntTSL 1 (best)13.48□□□□□ -0.255e-9■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 VPS4A-203ENST00000564399 471 ntTSL 58.16□□□□□ -1.15e-9■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.477e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.071e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 21e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 SRPK2-214ENST00000489828 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.984e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.344e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 LAMA5-201ENST00000252999 11426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 SLC35C2-209ENST00000484188 854 ntTSL 524.87■■□□□ 1.571e-14■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.414e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 MAFK-202ENST00000403150 2773 ntTSL 223.79■■□□□ 1.41e-14■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.34e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 DCTD-214ENST00000512766 683 ntTSL 522.8■■□□□ 1.242e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 TSSC2-206ENST00000533775 1210 ntTSL 521.36■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 ENGASE-206ENST00000579809 1428 ntTSL 1 (best)20.11■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 FURIN-202ENST00000558794 844 ntTSL 520.06■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 EXOC5-204ENST00000554598 772 ntTSL 219.68■□□□□ 0.742e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 CLK4-211ENST00000522556 1249 ntTSL 1 (best)19.46■□□□□ 0.711e-14■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.581e-14■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 CLK4-204ENST00000520126 1316 ntTSL 218.65■□□□□ 0.581e-14■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 DCAF15-206ENST00000591802 506 ntTSL 318.45■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 EXOC5-208ENST00000556318 518 ntTSL 417.94■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 CLK4-205ENST00000520199 857 ntTSL 217.09■□□□□ 0.331e-14■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.275e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 NBPF11-203ENST00000614506 5152 ntTSL 1 (best)16.2■□□□□ 0.184e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.185e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.061e-14■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 PPP1R21-203ENST00000416913 3208 ntTSL 215.14■□□□□ 0.025e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 PEX19-208ENST00000532508 1237 ntTSL 514.76□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 AMFR-202ENST00000492830 2249 ntTSL 213.82□□□□□ -0.23e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 SLC10A7-208ENST00000511374 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 SLC10A7-206ENST00000507560 414 ntTSL 513.64□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 CLK4-208ENST00000520957 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.271e-14■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 EXOC5-207ENST00000555749 594 ntTSL 213.13□□□□□ -0.312e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 CLCC1-207ENST00000369976 2468 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 AL449266.1-201ENST00000357393 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-10■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 DCBLD2-202ENST00000326857 3959 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 PEX19-210ENST00000532643 894 ntTSL 212.2□□□□□ -0.465e-6■■■■■ 94.8
SF3B1O75533 PEX19-202ENST00000392220 796 ntTSL 512.09□□□□□ -0.475e-6■■■■■ 94.8
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1318.9 ms