RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366672.4

GALNT2-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT2, Length 4,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT2-201ENST00000366672 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.44■■■□□ 2.94
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GALNT2-201ENST00000366672 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.03■■■□□ 2.56
GALNT2-201ENST00000366672 EHMT2Q96KQ7 1210 aa29.64■■■□□ 2.33
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GALNT2-201ENST00000366672 APLP2Q06481 763 aa29.16■■■□□ 2.26
GALNT2-201ENST00000366672 TRIM41Q8WV44 630 aa29.13■■■□□ 2.25
GALNT2-201ENST00000366672 PCGF6Q9BYE7 350 aa28.84■■■□□ 2.21
GALNT2-201ENST00000366672 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
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GALNT2-201ENST00000366672 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
GALNT2-201ENST00000366672 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.39■■■□□ 2.14
GALNT2-201ENST00000366672 ABCC9O60706 1549 aa28.35■■■□□ 2.13
GALNT2-201ENST00000366672 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
GALNT2-201ENST00000366672 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
GALNT2-201ENST00000366672 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
GALNT2-201ENST00000366672 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.03■■■□□ 2.08
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GALNT2-201ENST00000366672 HRCP23327 699 aa27.76■■■□□ 2.03
GALNT2-201ENST00000366672 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.62■■■□□ 2.01
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GALNT2-201ENST00000366672 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
GALNT2-201ENST00000366672 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
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GALNT2-201ENST00000366672 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
GALNT2-201ENST00000366672 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.07■■□□□ 1.92
GALNT2-201ENST00000366672 NEFLP07196 543 aa27.03■■□□□ 1.92
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GALNT2-201ENST00000366672 ERICH6Q7L0X2 663 aa26.86■■□□□ 1.89
GALNT2-201ENST00000366672 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.82■■□□□ 1.88
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GALNT2-201ENST00000366672 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
GALNT2-201ENST00000366672 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
GALNT2-201ENST00000366672 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.66■■□□□ 1.86
GALNT2-201ENST00000366672 POLR3GLQ9BT43 218 aa26.65■■□□□ 1.86
GALNT2-201ENST00000366672 FBLN2P98095 1184 aa26.61■■□□□ 1.85
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GALNT2-201ENST00000366672 TRIM52Q96A61 297 aa26.57■■□□□ 1.84
GALNT2-201ENST00000366672 P3H3Q8IVL6 736 aa26.55■■□□□ 1.84
GALNT2-201ENST00000366672 NEUROD1Q13562 356 aa26.46■■□□□ 1.83
GALNT2-201ENST00000366672 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
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GALNT2-201ENST00000366672 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
GALNT2-201ENST00000366672 ARID3CA6NKF2 412 aa26.25■■□□□ 1.79
GALNT2-201ENST00000366672 EEA1Q15075 1411 aa26.24■■□□□ 1.79
GALNT2-201ENST00000366672 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
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GALNT2-201ENST00000366672 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
GALNT2-201ENST00000366672 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.02■■□□□ 1.76
GALNT2-201ENST00000366672 GOLGA3Q08378 1498 aa26.01■■□□□ 1.75
GALNT2-201ENST00000366672 CEP162Q5TB80 1403 aa25.95■■□□□ 1.74
GALNT2-201ENST00000366672 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.9■■□□□ 1.74
GALNT2-201ENST00000366672 KIF27Q86VH2 1401 aa25.9■■□□□ 1.74
GALNT2-201ENST00000366672 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
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GALNT2-201ENST00000366672 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.86■■□□□ 1.73
GALNT2-201ENST00000366672 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.86■■□□□ 1.73
GALNT2-201ENST00000366672 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
GALNT2-201ENST00000366672 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.83■■□□□ 1.73
GALNT2-201ENST00000366672 TONSLQ96HA7 1378 aa25.83■■□□□ 1.73
GALNT2-201ENST00000366672 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.74■■□□□ 1.71
GALNT2-201ENST00000366672 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
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GALNT2-201ENST00000366672 TSPY10P0CW01 314 aa25.67■■□□□ 1.7
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GALNT2-201ENST00000366672 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.49■■□□□ 1.67
GALNT2-201ENST00000366672 CUX2O14529 1486 aa25.47■■□□□ 1.67
GALNT2-201ENST00000366672 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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GALNT2-201ENST00000366672 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
GALNT2-201ENST00000366672 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.67
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GALNT2-201ENST00000366672 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
GALNT2-201ENST00000366672 ABCC8Q09428 1581 aa25.42■■□□□ 1.66
GALNT2-201ENST00000366672 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
GALNT2-201ENST00000366672 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.38■■□□□ 1.65
GALNT2-201ENST00000366672 ERCC6Q03468 1493 aa25.36■■□□□ 1.65
GALNT2-201ENST00000366672 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
GALNT2-201ENST00000366672 NEFMP07197 916 aa25.33■■□□□ 1.64
GALNT2-201ENST00000366672 KCNH8Q96L42 1107 aa25.31■■□□□ 1.64
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