RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565908.6

TCF4-230, Transcript of transcription factor 4, humanhuman

TSL 3

Gene TCF4, Length 805 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4-230ENST00000565908 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.92■■■■■ 7.02
TCF4-230ENST00000565908 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.5■■■■■ 5.99
TCF4-230ENST00000565908 ABCC9O60706 1549 aa51.76■■■■■ 5.88
TCF4-230ENST00000565908 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.63■■■■■ 5.54
TCF4-230ENST00000565908 NACADO15069 1562 aa49.49■■■■■ 5.51
TCF4-230ENST00000565908 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.42■■■■■ 5.5
TCF4-230ENST00000565908 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.11■■■■■ 5.45
TCF4-230ENST00000565908 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.99■■■■■ 5.43
TCF4-230ENST00000565908 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.74■■■■■ 5.39
TCF4-230ENST00000565908 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.36■■■■■ 5.33
TCF4-230ENST00000565908 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.33■■■■■ 5.33
TCF4-230ENST00000565908 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.09■■■■■ 5.29
TCF4-230ENST00000565908 SCRIBQ14160 1630 aa47.87■■■■■ 5.25
TCF4-230ENST00000565908 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.84■■■■■ 5.25
TCF4-230ENST00000565908 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.65■■■■■ 5.22
TCF4-230ENST00000565908 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
TCF4-230ENST00000565908 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.78■■■■■ 5.08
TCF4-230ENST00000565908 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.57■■■■■ 5.05
TCF4-230ENST00000565908 SMARCA4P51532 1647 aa45.77■■■■■ 4.92
TCF4-230ENST00000565908 NCAPD3P42695 1498 aa45.7■■■■■ 4.91
TCF4-230ENST00000565908 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.7■■■■■ 4.91
TCF4-230ENST00000565908 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.66■■■■■ 4.9
TCF4-230ENST00000565908 SMARCA2P51531 1590 aa45.58■■■■■ 4.89
TCF4-230ENST00000565908 HMGXB3Q12766 1538 aa45.42■■■■■ 4.86
TCF4-230ENST00000565908 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.38■■■■■ 4.86
TCF4-230ENST00000565908 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.34■■■■■ 4.85
TCF4-230ENST00000565908 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.26■■■■■ 4.84
TCF4-230ENST00000565908 WIZO95785 1651 aa44.83■■■■■ 4.77
TCF4-230ENST00000565908 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.76
TCF4-230ENST00000565908 ERCC6Q03468 1493 aa44.67■■■■■ 4.74
TCF4-230ENST00000565908 NESP48681 1621 aa44.65■■■■■ 4.74
TCF4-230ENST00000565908 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.52■■■■■ 4.72
TCF4-230ENST00000565908 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
TCF4-230ENST00000565908 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.36■■■■■ 4.69
TCF4-230ENST00000565908 CUX2O14529 1486 aa44.34■■■■■ 4.69
TCF4-230ENST00000565908 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.29■■■■■ 4.68
TCF4-230ENST00000565908 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.06■■■■■ 4.64
TCF4-230ENST00000565908 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.05■■■■■ 4.64
TCF4-230ENST00000565908 CFTRP13569 1480 aa44■■■■■ 4.63
TCF4-230ENST00000565908 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.88■■■■■ 4.61
TCF4-230ENST00000565908 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.83■■■■■ 4.61
TCF4-230ENST00000565908 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.83■■■■■ 4.61
TCF4-230ENST00000565908 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.81■■■■■ 4.6
TCF4-230ENST00000565908 WDR62O43379 1518 aa43.67■■■■■ 4.58
TCF4-230ENST00000565908 PRDM2Q13029 1718 aa43.51■■■■■ 4.56
TCF4-230ENST00000565908 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.42■■■■■ 4.54
TCF4-230ENST00000565908 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
TCF4-230ENST00000565908 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.37■■■■■ 4.53
TCF4-230ENST00000565908 ABCC8Q09428 1581 aa43.09■■■■■ 4.49
TCF4-230ENST00000565908 TOPBP1Q92547 1522 aa43.07■■■■■ 4.49
TCF4-230ENST00000565908 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.99■■■■■ 4.47
TCF4-230ENST00000565908 IFT140Q96RY7 1462 aa42.92■■■■■ 4.46
TCF4-230ENST00000565908 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
TCF4-230ENST00000565908 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
TCF4-230ENST00000565908 CUX1P39880 1505 aa42.6■■■■■ 4.41
TCF4-230ENST00000565908 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
TCF4-230ENST00000565908 SOGA1O94964 1423 aa42.54■■■■■ 4.4
TCF4-230ENST00000565908 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.53■■■■■ 4.4
TCF4-230ENST00000565908 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.51■■■■■ 4.4
TCF4-230ENST00000565908 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.5■■■■■ 4.39
TCF4-230ENST00000565908 OSCARQ8IYS5 282 aa42.47■■■■■ 4.39
TCF4-230ENST00000565908 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.45■■■■■ 4.39
TCF4-230ENST00000565908 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.33■■■■■ 4.37
TCF4-230ENST00000565908 WDR97A6NE52 1622 aa42.28■■■■■ 4.36
TCF4-230ENST00000565908 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.23■■■■■ 4.35
TCF4-230ENST00000565908 TOP2BQ02880 1626 aa42.13■■■■■ 4.33
TCF4-230ENST00000565908 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.11■■■■■ 4.33
TCF4-230ENST00000565908 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.1■■■■■ 4.33
TCF4-230ENST00000565908 GRIN2BQ13224 1484 aa42.08■■■■■ 4.33
TCF4-230ENST00000565908 SYNJ1O43426 1573 aa42.08■■■■■ 4.33
TCF4-230ENST00000565908 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.05■■■■■ 4.32
TCF4-230ENST00000565908 FBLN2P98095 1184 aa42.05■■■■■ 4.32
TCF4-230ENST00000565908 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.03■■■■■ 4.32
TCF4-230ENST00000565908 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
TCF4-230ENST00000565908 CHD1O14646 1710 aa41.99■■■■■ 4.31
TCF4-230ENST00000565908 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.93■■■■■ 4.3
TCF4-230ENST00000565908 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
TCF4-230ENST00000565908 PBRM1Q86U86 1689 aa41.86■■■■■ 4.29
TCF4-230ENST00000565908 SYNJ2O15056 1496 aa41.84■■■■■ 4.29
TCF4-230ENST00000565908 TRIM41Q8WV44 630 aa41.83■■■■■ 4.29
TCF4-230ENST00000565908 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
TCF4-230ENST00000565908 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
TCF4-230ENST00000565908 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.73■■■■■ 4.27
TCF4-230ENST00000565908 ARHGEF11O15085 1522 aa41.72■■■■■ 4.27
TCF4-230ENST00000565908 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.6■■■■■ 4.25
TCF4-230ENST00000565908 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.6■■■■■ 4.25
TCF4-230ENST00000565908 ADAMTS12P58397 1594 aa41.56■■■■■ 4.24
TCF4-230ENST00000565908 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.54■■■■■ 4.24
TCF4-230ENST00000565908 GRIN2AQ12879 1464 aa41.52■■■■■ 4.24
TCF4-230ENST00000565908 KIF27Q86VH2 1401 aa41.39■■■■■ 4.22
TCF4-230ENST00000565908 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.39■■■■■ 4.22
TCF4-230ENST00000565908 NUP160Q12769 1436 aa41.36■■■■■ 4.21
TCF4-230ENST00000565908 ARAP1Q96P48 1450 aa41.36■■■■■ 4.21
TCF4-230ENST00000565908 CEP170Q5SW79 1584 aa41.29■■■■■ 4.2
TCF4-230ENST00000565908 IGF1RP08069 1367 aa41.26■■■■■ 4.2
TCF4-230ENST00000565908 CUL7Q14999 1698 aa41.12■■■■■ 4.17
TCF4-230ENST00000565908 SHROOM2Q13796 1616 aa41.04■■■■■ 4.16
TCF4-230ENST00000565908 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.02■■■■■ 4.16
TCF4-230ENST00000565908 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.97■■■■■ 4.15
TCF4-230ENST00000565908 JPH4Q96JJ6 628 aa40.97■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms