Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 UTP4-203ENST00000562237 2186 ntTSL 1 (best)21.51■■□□□ 1.031e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CENPA-206ENST00000475662 1208 ntTSL 218.78■□□□□ 0.61e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 LMNA-209ENST00000459904 916 ntTSL 218.49■□□□□ 0.551e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 DCTN2-212ENST00000549394 1439 ntTSL 213.79□□□□□ -0.21e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 UTP4-202ENST00000352319 1841 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.371e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SLC35F6-201ENST00000344420 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.441e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SLC35F6-203ENST00000429494 3738 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.491e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 DCTN2-202ENST00000543672 1321 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.621e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SLC35F6-202ENST00000414029 3605 ntTSL 1 (best)10.42□□□□□ -0.741e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 UTP4-210ENST00000567287 366 ntTSL 39.06□□□□□ -0.961e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 NDUFB3-203ENST00000450023 462 ntTSL 38.67□□□□□ -1.024e-22■□□□□ 10
PABPC4Q13310 DCTN2-205ENST00000546758 817 ntTSL 57.43□□□□□ -1.221e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 UTP4-212ENST00000567500 737 ntTSL 56.12□□□□□ -1.431e-11■□□□□ 10
PABPC4Q13310 POLR1D-208ENST00000626064 988 ntTSL 226.65■■□□□ 1.865e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CPSF1-209ENST00000532725 597 ntTSL 223.62■■□□□ 1.375e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FLOT1-211ENST00000484693 1001 ntTSL 223.5■■□□□ 1.355e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.275e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CPSF1-210ENST00000532935 506 ntTSL 518.42■□□□□ 0.545e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CPSF1-201ENST00000526271 697 ntTSL 317.52■□□□□ 0.45e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.055e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SPEN-205ENST00000487496 543 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.25e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 AC074091.1-201ENST00000505973 1741 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.215e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HIST1H2BG-201ENST00000541790 1534 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.255e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SUMO2-201ENST00000314523 809 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.592e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZNF512-204ENST00000416005 3515 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.635e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZNF512-202ENST00000379717 3417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.795e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.885e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.915e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.925e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 OLA1-207ENST00000429575 485 ntTSL 38.77□□□□□ -1.015e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.185e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.185e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)7.7□□□□□ -1.185e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 OLA1-208ENST00000462000 656 ntTSL 27.32□□□□□ -1.245e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ZNF512-206ENST00000488055 2465 ntTSL 27.16□□□□□ -1.265e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 KMT2C-203ENST00000360104 11186 ntTSL 1 (best)6.06□□□□□ -1.445e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PCMT1-206ENST00000480010 377 ntTSL 54.05□□□□□ -1.765e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 POLR1D-214ENST00000636226 100 ntTSL 52.38□□□□□ -2.035e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC9.53□□□□□ -0.884e-10■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.395e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.555e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FADS3-211ENST00000533676 5314 ntTSL 216.77■□□□□ 0.285e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FADS3-208ENST00000529404 2379 ntTSL 216.71■□□□□ 0.265e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CAPZA1-201ENST00000263168 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-44■□□□□ 10
PABPC4Q13310 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.012e-10■□□□□ 10
PABPC4Q13310 AP003108.2-202ENST00000541135 580 ntAPPRIS P1 TSL 423.42■■□□□ 1.343e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 AP003108.2-206ENST00000544801 875 ntTSL 520.13■□□□□ 0.813e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 AP003108.2-207ENST00000544880 591 ntTSL 419.18■□□□□ 0.663e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.283e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.273e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 AP003108.2-203ENST00000536670 449 ntTSL 511.63□□□□□ -0.553e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 AP003108.2-208ENST00000543044 883 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.653e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 AP003108.2-205ENST00000538594 569 ntTSL 410.22□□□□□ -0.773e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 AP003108.2-201ENST00000544025 563 ntTSL 410.17□□□□□ -0.783e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TMBIM6-219ENST00000549471 484 ntTSL 25.42□□□□□ -1.541e-52■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PMPCB-205ENST00000453466 1509 ntTSL 523.69■■□□□ 1.384e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.144e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PMPCB-204ENST00000444457 2385 ntTSL 220.49■□□□□ 0.874e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.24e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PMPCB-203ENST00000443722 1323 ntTSL 515.99■□□□□ 0.154e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PMPCB-207ENST00000469560 1615 ntTSL 27.98□□□□□ -1.134e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ALDOA-218ENST00000566146 365 ntTSL 1 (best)11.1□□□□□ -0.631e-66■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-231ENST00000591097 1507 ntTSL 1 (best)27.69■■■□□ 2.022e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-224ENST00000589686 532 ntTSL 225.29■■□□□ 1.642e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.572e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-226ENST00000590171 905 ntTSL 324.85■■□□□ 1.572e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-234ENST00000591659 587 ntTSL 224.85■■□□□ 1.572e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-229ENST00000590704 1456 ntTSL 224.78■■□□□ 1.562e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.552e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.392e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.262e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-238ENST00000592412 532 ntTSL 422.51■■□□□ 1.192e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-243ENST00000593128 796 ntTSL 321.86■■□□□ 1.092e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-244ENST00000593283 758 ntTSL 521.38■■□□□ 1.012e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.782e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-241ENST00000593048 650 ntTSL 319.66■□□□□ 0.742e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-230ENST00000591055 928 ntTSL 219.3■□□□□ 0.682e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 CIRBP-218ENST00000588344 370 ntTSL 310.7□□□□□ -0.72e-9■□□□□ 10
PABPC4Q13310 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.012e-18■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.468e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PPP1R15A-202ENST00000600406 1725 nt17.55■□□□□ 0.48e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.437e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TMEM147-204ENST00000477168 986 ntTSL 224.29■■□□□ 1.487e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.887e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TMEM147-205ENST00000593027 669 ntTSL 320.5■□□□□ 0.877e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TMEM147-209ENST00000599895 1045 ntTSL 519.97■□□□□ 0.797e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 TMEM147-207ENST00000595467 1783 ntTSL 219.9■□□□□ 0.787e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.368e-71■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.148e-71■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.088e-71■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-209ENST00000586201 881 ntTSL 314.65□□□□□ -0.068e-71■□□□□ 10
PABPC4Q13310 ATP6V0A1-211ENST00000587299 1000 ntTSL 37.78□□□□□ -1.168e-71■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.644e-8■□□□□ 10
PABPC4Q13310 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.894e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SLC35F2-202ENST00000524991 562 ntTSL 426.22■■□□□ 1.794e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HGS-215ENST00000576393 922 ntTSL 225.38■■□□□ 1.655e-7■□□□□ 10
PABPC4Q13310 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.62e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.62e-6■□□□□ 10
PABPC4Q13310 HGS-205ENST00000571518 644 ntTSL 224.76■■□□□ 1.555e-7■□□□□ 10
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 462 ms