RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588230.5

CIRBP-217, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,013 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-217ENST00000588230 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.13■■■■■ 5.14
CIRBP-217ENST00000588230 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.07■■■■■ 4.33
CIRBP-217ENST00000588230 ABCC9O60706 1549 aa41.54■■■■■ 4.24
CIRBP-217ENST00000588230 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.75■■■■□ 3.95
CIRBP-217ENST00000588230 NACADO15069 1562 aa39.63■■■■□ 3.94
CIRBP-217ENST00000588230 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.34■■■■□ 3.89
CIRBP-217ENST00000588230 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.31■■■■□ 3.88
CIRBP-217ENST00000588230 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
CIRBP-217ENST00000588230 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.99■■■■□ 3.83
CIRBP-217ENST00000588230 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.92■■■■□ 3.82
CIRBP-217ENST00000588230 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.71■■■■□ 3.79
CIRBP-217ENST00000588230 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.69■■■■□ 3.78
CIRBP-217ENST00000588230 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.56■■■■□ 3.76
CIRBP-217ENST00000588230 SCRIBQ14160 1630 aa38.34■■■■□ 3.73
CIRBP-217ENST00000588230 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.17■■■■□ 3.7
CIRBP-217ENST00000588230 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.62
CIRBP-217ENST00000588230 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.58■■■■□ 3.61
CIRBP-217ENST00000588230 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.36■■■■□ 3.57
CIRBP-217ENST00000588230 SMARCA4P51532 1647 aa36.66■■■■□ 3.46
CIRBP-217ENST00000588230 NCAPD3P42695 1498 aa36.6■■■■□ 3.45
CIRBP-217ENST00000588230 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.56■■■■□ 3.44
CIRBP-217ENST00000588230 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.52■■■■□ 3.44
CIRBP-217ENST00000588230 SMARCA2P51531 1590 aa36.45■■■■□ 3.43
CIRBP-217ENST00000588230 HMGXB3Q12766 1538 aa36.39■■■■□ 3.42
CIRBP-217ENST00000588230 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.35■■■■□ 3.41
CIRBP-217ENST00000588230 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.33■■■■□ 3.41
CIRBP-217ENST00000588230 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
CIRBP-217ENST00000588230 WIZO95785 1651 aa35.9■■■■□ 3.34
CIRBP-217ENST00000588230 NESP48681 1621 aa35.86■■■■□ 3.33
CIRBP-217ENST00000588230 ERCC6Q03468 1493 aa35.76■■■■□ 3.32
CIRBP-217ENST00000588230 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
CIRBP-217ENST00000588230 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.67■■■■□ 3.3
CIRBP-217ENST00000588230 CUX2O14529 1486 aa35.6■■■■□ 3.29
CIRBP-217ENST00000588230 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.49■■■■□ 3.27
CIRBP-217ENST00000588230 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.48■■■■□ 3.27
CIRBP-217ENST00000588230 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.44■■■■□ 3.26
CIRBP-217ENST00000588230 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.41■■■■□ 3.26
CIRBP-217ENST00000588230 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.4■■■■□ 3.26
CIRBP-217ENST00000588230 CFTRP13569 1480 aa35.22■■■■□ 3.23
CIRBP-217ENST00000588230 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.11■■■■□ 3.21
CIRBP-217ENST00000588230 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.08■■■■□ 3.21
CIRBP-217ENST00000588230 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.07■■■■□ 3.2
CIRBP-217ENST00000588230 WDR62O43379 1518 aa35.06■■■■□ 3.2
CIRBP-217ENST00000588230 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.05■■■■□ 3.2
CIRBP-217ENST00000588230 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.98■■■■□ 3.19
CIRBP-217ENST00000588230 PRDM2Q13029 1718 aa34.89■■■■□ 3.18
CIRBP-217ENST00000588230 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.81■■■■□ 3.16
CIRBP-217ENST00000588230 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
CIRBP-217ENST00000588230 TOPBP1Q92547 1522 aa34.5■■■■□ 3.11
CIRBP-217ENST00000588230 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.41■■■■□ 3.1
CIRBP-217ENST00000588230 ABCC8Q09428 1581 aa34.39■■■■□ 3.1
CIRBP-217ENST00000588230 IFT140Q96RY7 1462 aa34.34■■■■□ 3.09
CIRBP-217ENST00000588230 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
CIRBP-217ENST00000588230 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.19■■■■□ 3.06
CIRBP-217ENST00000588230 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
CIRBP-217ENST00000588230 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
CIRBP-217ENST00000588230 CUX1P39880 1505 aa34.11■■■■□ 3.05
CIRBP-217ENST00000588230 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.03■■■■□ 3.04
CIRBP-217ENST00000588230 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.02■■■■□ 3.04
CIRBP-217ENST00000588230 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34■■■■□ 3.033e-10■■■■■ 35.8
CIRBP-217ENST00000588230 OSCARQ8IYS5 282 aa33.97■■■■□ 3.03
CIRBP-217ENST00000588230 SOGA1O94964 1423 aa33.96■■■■□ 3.03
CIRBP-217ENST00000588230 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
CIRBP-217ENST00000588230 WDR97A6NE52 1622 aa33.83■■■■□ 3.01
CIRBP-217ENST00000588230 CHD1O14646 1710 aa33.74■■■□□ 2.99
CIRBP-217ENST00000588230 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.69■■■□□ 2.98
CIRBP-217ENST00000588230 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.69■■■□□ 2.98
CIRBP-217ENST00000588230 SYNJ1O43426 1573 aa33.68■■■□□ 2.98
CIRBP-217ENST00000588230 TOP2BQ02880 1626 aa33.68■■■□□ 2.98
CIRBP-217ENST00000588230 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.68■■■□□ 2.98
CIRBP-217ENST00000588230 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.67■■■□□ 2.981e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-217ENST00000588230 GRIN2BQ13224 1484 aa33.64■■■□□ 2.98
CIRBP-217ENST00000588230 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.61■■■□□ 2.97
CIRBP-217ENST00000588230 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.61■■■□□ 2.97
CIRBP-217ENST00000588230 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.59■■■□□ 2.97
CIRBP-217ENST00000588230 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.57■■■□□ 2.96
CIRBP-217ENST00000588230 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.57■■■□□ 2.96
CIRBP-217ENST00000588230 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.57■■■□□ 2.96
CIRBP-217ENST00000588230 PBRM1Q86U86 1689 aa33.56■■■□□ 2.96
CIRBP-217ENST00000588230 TRIM41Q8WV44 630 aa33.56■■■□□ 2.96
CIRBP-217ENST00000588230 FBLN2P98095 1184 aa33.53■■■□□ 2.96
CIRBP-217ENST00000588230 ARHGEF11O15085 1522 aa33.53■■■□□ 2.96
CIRBP-217ENST00000588230 SYNJ2O15056 1496 aa33.49■■■□□ 2.95
CIRBP-217ENST00000588230 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.43■■■□□ 2.94
CIRBP-217ENST00000588230 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
CIRBP-217ENST00000588230 ADAMTS12P58397 1594 aa33.31■■■□□ 2.92
CIRBP-217ENST00000588230 ARAP1Q96P48 1450 aa33.26■■■□□ 2.92
CIRBP-217ENST00000588230 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.26■■■□□ 2.91
CIRBP-217ENST00000588230 GRIN2AQ12879 1464 aa33.23■■■□□ 2.91
CIRBP-217ENST00000588230 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.19■■■□□ 2.9
CIRBP-217ENST00000588230 NUP160Q12769 1436 aa33.14■■■□□ 2.9
CIRBP-217ENST00000588230 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.14■■■□□ 2.9
CIRBP-217ENST00000588230 CEP170Q5SW79 1584 aa33.12■■■□□ 2.89
CIRBP-217ENST00000588230 KIF27Q86VH2 1401 aa32.97■■■□□ 2.87
CIRBP-217ENST00000588230 IGF1RP08069 1367 aa32.95■■■□□ 2.86
CIRBP-217ENST00000588230 SHROOM2Q13796 1616 aa32.95■■■□□ 2.86
CIRBP-217ENST00000588230 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.94■■■□□ 2.86
CIRBP-217ENST00000588230 CUL7Q14999 1698 aa32.85■■■□□ 2.85
CIRBP-217ENST00000588230 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.84■■■□□ 2.85
CIRBP-217ENST00000588230 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.7■■■□□ 2.83
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