RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576393.5

HGS-215, Transcript of hepatocyte growth factor-regulated tyrosine kinase substrate, humanhuman

TSL 2

Gene HGS, Length 922 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGS-215ENST00000576393 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.64■■■■■ 5.86
HGS-215ENST00000576393 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.29■■■■■ 5
HGS-215ENST00000576393 ABCC9O60706 1549 aa45.98■■■■■ 4.95
HGS-215ENST00000576393 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.97■■■■■ 4.63
HGS-215ENST00000576393 NACADO15069 1562 aa43.72■■■■■ 4.59
HGS-215ENST00000576393 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.52■■■■■ 4.56
HGS-215ENST00000576393 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.21■■■■■ 4.51
HGS-215ENST00000576393 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.89■■■■■ 4.46
HGS-215ENST00000576393 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.86■■■■■ 4.45
HGS-215ENST00000576393 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
HGS-215ENST00000576393 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.83■■■■■ 4.45
HGS-215ENST00000576393 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.72■■■■■ 4.43
HGS-215ENST00000576393 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.56■■■■■ 4.4
HGS-215ENST00000576393 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.17■■■■■ 4.34
HGS-215ENST00000576393 SCRIBQ14160 1630 aa42.12■■■■■ 4.33
HGS-215ENST00000576393 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.58■■■■■ 4.25
HGS-215ENST00000576393 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
HGS-215ENST00000576393 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.44■■■■■ 4.22
HGS-215ENST00000576393 NCAPD3P42695 1498 aa40.32■■■■■ 4.05
HGS-215ENST00000576393 SMARCA4P51532 1647 aa40.24■■■■■ 4.03
HGS-215ENST00000576393 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.21■■■■■ 4.03
HGS-215ENST00000576393 SMARCA2P51531 1590 aa40.17■■■■■ 4.02
HGS-215ENST00000576393 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
HGS-215ENST00000576393 HMGXB3Q12766 1538 aa40.06■■■■■ 4
HGS-215ENST00000576393 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
HGS-215ENST00000576393 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.86■■■■□ 3.97
HGS-215ENST00000576393 ERCC6Q03468 1493 aa39.76■■■■□ 3.96
HGS-215ENST00000576393 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.75■■■■□ 3.95
HGS-215ENST00000576393 CUX2O14529 1486 aa39.62■■■■□ 3.93
HGS-215ENST00000576393 NESP48681 1621 aa39.53■■■■□ 3.92
HGS-215ENST00000576393 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.41■■■■□ 3.9
HGS-215ENST00000576393 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.3■■■■□ 3.88
HGS-215ENST00000576393 WIZO95785 1651 aa39.29■■■■□ 3.88
HGS-215ENST00000576393 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.2■■■■□ 3.87
HGS-215ENST00000576393 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
HGS-215ENST00000576393 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.11■■■■□ 3.85
HGS-215ENST00000576393 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.08■■■■□ 3.85
HGS-215ENST00000576393 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.03■■■■□ 3.84
HGS-215ENST00000576393 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.85■■■■□ 3.81
HGS-215ENST00000576393 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.79■■■■□ 3.8
HGS-215ENST00000576393 CFTRP13569 1480 aa38.71■■■■□ 3.79
HGS-215ENST00000576393 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.7■■■■□ 3.79
HGS-215ENST00000576393 WDR62O43379 1518 aa38.68■■■■□ 3.78
HGS-215ENST00000576393 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.66■■■■□ 3.78
HGS-215ENST00000576393 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.4■■■■□ 3.74
HGS-215ENST00000576393 PRDM2Q13029 1718 aa38.38■■■■□ 3.74
HGS-215ENST00000576393 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.28■■■■□ 3.72
HGS-215ENST00000576393 ABCC8Q09428 1581 aa37.98■■■■□ 3.67
HGS-215ENST00000576393 TOPBP1Q92547 1522 aa37.94■■■■□ 3.66
HGS-215ENST00000576393 IFT140Q96RY7 1462 aa37.93■■■■□ 3.66
HGS-215ENST00000576393 OSCARQ8IYS5 282 aa37.87■■■■□ 3.65
HGS-215ENST00000576393 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.85■■■■□ 3.65
HGS-215ENST00000576393 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.76■■■■□ 3.63
HGS-215ENST00000576393 TRIM41Q8WV44 630 aa37.65■■■■□ 3.62
HGS-215ENST00000576393 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
HGS-215ENST00000576393 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.58■■■■□ 3.61
HGS-215ENST00000576393 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.56■■■■□ 3.6
HGS-215ENST00000576393 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
HGS-215ENST00000576393 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.46■■■■□ 3.591e-7■■■■□ 23.5
HGS-215ENST00000576393 SOGA1O94964 1423 aa37.44■■■■□ 3.58
HGS-215ENST00000576393 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.39■■■■□ 3.58
HGS-215ENST00000576393 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.36■■■■□ 3.57
HGS-215ENST00000576393 CUX1P39880 1505 aa37.34■■■■□ 3.57
HGS-215ENST00000576393 WDR97A6NE52 1622 aa37.32■■■■□ 3.56
HGS-215ENST00000576393 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.29■■■■□ 3.56
HGS-215ENST00000576393 CHD1O14646 1710 aa37.28■■■■□ 3.56
HGS-215ENST00000576393 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.27■■■■□ 3.56
HGS-215ENST00000576393 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.27■■■■□ 3.56
HGS-215ENST00000576393 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.27■■■■□ 3.56
HGS-215ENST00000576393 FBLN2P98095 1184 aa37.24■■■■□ 3.55
HGS-215ENST00000576393 ARHGEF11O15085 1522 aa37.19■■■■□ 3.54
HGS-215ENST00000576393 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.1■■■■□ 3.53
HGS-215ENST00000576393 GRIN2BQ13224 1484 aa37.09■■■■□ 3.53
HGS-215ENST00000576393 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.07■■■■□ 3.53
HGS-215ENST00000576393 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
HGS-215ENST00000576393 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.98■■■■□ 3.51
HGS-215ENST00000576393 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.98■■■■□ 3.51
HGS-215ENST00000576393 PBRM1Q86U86 1689 aa36.94■■■■□ 3.5
HGS-215ENST00000576393 SYNJ2O15056 1496 aa36.94■■■■□ 3.5
HGS-215ENST00000576393 SYNJ1O43426 1573 aa36.92■■■■□ 3.5
HGS-215ENST00000576393 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.92■■■■□ 3.5
HGS-215ENST00000576393 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.91■■■■□ 3.5
HGS-215ENST00000576393 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.88■■■■□ 3.49
HGS-215ENST00000576393 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.85■■■■□ 3.49
HGS-215ENST00000576393 TOP2BQ02880 1626 aa36.85■■■■□ 3.49
HGS-215ENST00000576393 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.85■■■■□ 3.49
HGS-215ENST00000576393 ARAP1Q96P48 1450 aa36.81■■■■□ 3.48
HGS-215ENST00000576393 GRIN2AQ12879 1464 aa36.59■■■■□ 3.45
HGS-215ENST00000576393 ADAMTS12P58397 1594 aa36.58■■■■□ 3.45
HGS-215ENST00000576393 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.54■■■■□ 3.44
HGS-215ENST00000576393 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.53■■■■□ 3.44
HGS-215ENST00000576393 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
HGS-215ENST00000576393 NUP160Q12769 1436 aa36.44■■■■□ 3.42
HGS-215ENST00000576393 CEP170Q5SW79 1584 aa36.4■■■■□ 3.42
HGS-215ENST00000576393 SHROOM2Q13796 1616 aa36.26■■■■□ 3.4
HGS-215ENST00000576393 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.23■■■■□ 3.39
HGS-215ENST00000576393 KIF27Q86VH2 1401 aa36.18■■■■□ 3.38
HGS-215ENST00000576393 JPH4Q96JJ6 628 aa36.11■■■■□ 3.37
HGS-215ENST00000576393 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.09■■■■□ 3.37
HGS-215ENST00000576393 IGF1RP08069 1367 aa36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms