RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585630.5

CIRBP-204, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

APPRIS P3 TSL 3 BASIC

Gene CIRBP, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-204	ENST00000585630	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.95	■■■■■ 4.15
CIRBP-204	ENST00000585630	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.72	■■■■□ 3.47
CIRBP-204	ENST00000585630	ABCC9	O60706	1549 aa		36.03	■■■■□ 3.36
CIRBP-204	ENST00000585630	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.62	■■■■□ 3.13
CIRBP-204	ENST00000585630	NACAD	O15069	1562 aa		34.49	■■■■□ 3.11
CIRBP-204	ENST00000585630	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		34.2	■■■■□ 3.07
CIRBP-204	ENST00000585630	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.1	■■■■□ 3.05
CIRBP-204	ENST00000585630	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		34.06	■■■■□ 3.04
CIRBP-204	ENST00000585630	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.96	■■■■□ 3.03
CIRBP-204	ENST00000585630	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.93	■■■■□ 3.02
CIRBP-204	ENST00000585630	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.6	■■■□□ 2.97
CIRBP-204	ENST00000585630	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.48	■■■□□ 2.95
CIRBP-204	ENST00000585630	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CIRBP-204	ENST00000585630	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.26	■■■□□ 2.92
CIRBP-204	ENST00000585630	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.26	■■■□□ 2.91
CIRBP-204	ENST00000585630	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.72	■■■□□ 2.83
CIRBP-204	ENST00000585630	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CIRBP-204	ENST00000585630	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.42	■■■□□ 2.78
CIRBP-204	ENST00000585630	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.92	■■■□□ 2.7
CIRBP-204	ENST00000585630	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.8	■■■□□ 2.68
CIRBP-204	ENST00000585630	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.76	■■■□□ 2.67
CIRBP-204	ENST00000585630	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.74	■■■□□ 2.67
CIRBP-204	ENST00000585630	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.73	■■■□□ 2.67
CIRBP-204	ENST00000585630	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.69	■■■□□ 2.66
CIRBP-204	ENST00000585630	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.63	■■■□□ 2.65
CIRBP-204	ENST00000585630	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		31.55	■■■□□ 2.64
CIRBP-204	ENST00000585630	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
CIRBP-204	ENST00000585630	WIZ	O95785	1651 aa		31.23	■■■□□ 2.59
CIRBP-204	ENST00000585630	NES	P48681	1621 aa		31.1	■■■□□ 2.57
CIRBP-204	ENST00000585630	ERCC6	Q03468	1493 aa		31.09	■■■□□ 2.57
CIRBP-204	ENST00000585630	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		31.07	■■■□□ 2.56
CIRBP-204	ENST00000585630	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	31.01	■■■□□ 2.55
CIRBP-204	ENST00000585630	CUX2	O14529	1486 aa		30.95	■■■□□ 2.54
CIRBP-204	ENST00000585630	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.9	■■■□□ 2.54
CIRBP-204	ENST00000585630	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.87	■■■□□ 2.53
CIRBP-204	ENST00000585630	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.84	■■■□□ 2.53
CIRBP-204	ENST00000585630	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.77	■■■□□ 2.52
CIRBP-204	ENST00000585630	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.75	■■■□□ 2.51
CIRBP-204	ENST00000585630	CFTR	P13569	1480 aa		30.58	■■■□□ 2.49
CIRBP-204	ENST00000585630	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.56	■■■□□ 2.48
CIRBP-204	ENST00000585630	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30.52	■■■□□ 2.48
CIRBP-204	ENST00000585630	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.5	■■■□□ 2.47
CIRBP-204	ENST00000585630	WDR62	O43379	1518 aa		30.49	■■■□□ 2.47
CIRBP-204	ENST00000585630	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.47	■■■□□ 2.47
CIRBP-204	ENST00000585630	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		30.44	■■■□□ 2.46
CIRBP-204	ENST00000585630	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.32	■■■□□ 2.44
CIRBP-204	ENST00000585630	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	30.22	■■■□□ 2.43
CIRBP-204	ENST00000585630	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.97	■■■□□ 2.39
CIRBP-204	ENST00000585630	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.96	■■■□□ 2.39
CIRBP-204	ENST00000585630	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.93	■■■□□ 2.38
CIRBP-204	ENST00000585630	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CIRBP-204	ENST00000585630	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.81	■■■□□ 2.36
CIRBP-204	ENST00000585630	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
CIRBP-204	ENST00000585630	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.73	■■■□□ 2.35
CIRBP-204	ENST00000585630	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.73	■■■□□ 2.35
CIRBP-204	ENST00000585630	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
CIRBP-204	ENST00000585630	CUX1	P39880	1505 aa		29.64	■■■□□ 2.34
CIRBP-204	ENST00000585630	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.57	■■■□□ 2.32
CIRBP-204	ENST00000585630	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.53	■■■□□ 2.32
CIRBP-204	ENST00000585630	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.51	■■■□□ 2.31
CIRBP-204	ENST00000585630	SOGA1	O94964	1423 aa		29.47	■■■□□ 2.31
CIRBP-204	ENST00000585630	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.47	■■■□□ 2.31	3e-10	■■■■■ 35.8
CIRBP-204	ENST00000585630	CHD1	O14646	1710 aa		29.43	■■■□□ 2.3
CIRBP-204	ENST00000585630	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.42	■■■□□ 2.3
CIRBP-204	ENST00000585630	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		29.38	■■■□□ 2.29
CIRBP-204	ENST00000585630	TOP2B	Q02880	1626 aa		29.34	■■■□□ 2.29
CIRBP-204	ENST00000585630	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
CIRBP-204	ENST00000585630	PBRM1	Q86U86	1689 aa		29.31	■■■□□ 2.28
CIRBP-204	ENST00000585630	SYNJ1	O43426	1573 aa		29.3	■■■□□ 2.28
CIRBP-204	ENST00000585630	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-204	ENST00000585630	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.28	■■■□□ 2.28
CIRBP-204	ENST00000585630	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.27	■■■□□ 2.28
CIRBP-204	ENST00000585630	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	29.27	■■■□□ 2.28	1e-6	■■■■■ 58.5
CIRBP-204	ENST00000585630	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.24	■■■□□ 2.27
CIRBP-204	ENST00000585630	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
CIRBP-204	ENST00000585630	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		29.2	■■■□□ 2.27
CIRBP-204	ENST00000585630	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		29.2	■■■□□ 2.27
CIRBP-204	ENST00000585630	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		29.2	■■■□□ 2.27
CIRBP-204	ENST00000585630	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.19	■■■□□ 2.26
CIRBP-204	ENST00000585630	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.14	■■■□□ 2.26
CIRBP-204	ENST00000585630	ARHGEF11	O15085	1522 aa		29.13	■■■□□ 2.25
CIRBP-204	ENST00000585630	SYNJ2	O15056	1496 aa		29.1	■■■□□ 2.25
CIRBP-204	ENST00000585630	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CIRBP-204	ENST00000585630	FBLN2	P98095	1184 aa		29.06	■■■□□ 2.24
CIRBP-204	ENST00000585630	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.02	■■■□□ 2.24
CIRBP-204	ENST00000585630	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
CIRBP-204	ENST00000585630	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.94	■■■□□ 2.22
CIRBP-204	ENST00000585630	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.9	■■■□□ 2.22
CIRBP-204	ENST00000585630	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CIRBP-204	ENST00000585630	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CIRBP-204	ENST00000585630	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CIRBP-204	ENST00000585630	NUP160	Q12769	1436 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CIRBP-204	ENST00000585630	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CIRBP-204	ENST00000585630	CUL7	Q14999	1698 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CIRBP-204	ENST00000585630	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CIRBP-204	ENST00000585630	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CIRBP-204	ENST00000585630	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CIRBP-204	ENST00000585630	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CIRBP-204	ENST00000585630	IGF1R	P08069	1367 aa		28.53	■■■□□ 2.16
CIRBP-204	ENST00000585630	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		28.38	■■■□□ 2.13

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