RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628979.2

CIRBP-246, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CIRBP, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-246ENST00000628979 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.25■■■■■ 5.63
CIRBP-246ENST00000628979 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.68■■■■■ 4.74
CIRBP-246ENST00000628979 ABCC9O60706 1549 aa44.03■■■■■ 4.64
CIRBP-246ENST00000628979 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.3■■■■■ 4.36
CIRBP-246ENST00000628979 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.19■■■■■ 4.34
CIRBP-246ENST00000628979 NACADO15069 1562 aa42.07■■■■■ 4.33
CIRBP-246ENST00000628979 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
CIRBP-246ENST00000628979 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.67■■■■■ 4.26
CIRBP-246ENST00000628979 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.47■■■■■ 4.23
CIRBP-246ENST00000628979 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.26■■■■■ 4.2
CIRBP-246ENST00000628979 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.18■■■■■ 4.18
CIRBP-246ENST00000628979 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.91■■■■■ 4.14
CIRBP-246ENST00000628979 SCRIBQ14160 1630 aa40.89■■■■■ 4.14
CIRBP-246ENST00000628979 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.55■■■■■ 4.08
CIRBP-246ENST00000628979 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.34■■■■■ 4.05
CIRBP-246ENST00000628979 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.86■■■■□ 3.97
CIRBP-246ENST00000628979 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.76■■■■□ 3.96
CIRBP-246ENST00000628979 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.53■■■■□ 3.92
CIRBP-246ENST00000628979 SMARCA4P51532 1647 aa39.03■■■■□ 3.84
CIRBP-246ENST00000628979 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.95■■■■□ 3.83
CIRBP-246ENST00000628979 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.86■■■■□ 3.81
CIRBP-246ENST00000628979 NCAPD3P42695 1498 aa38.82■■■■□ 3.81
CIRBP-246ENST00000628979 SMARCA2P51531 1590 aa38.78■■■■□ 3.8
CIRBP-246ENST00000628979 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.76■■■■□ 3.8
CIRBP-246ENST00000628979 HMGXB3Q12766 1538 aa38.59■■■■□ 3.77
CIRBP-246ENST00000628979 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.57■■■■□ 3.76
CIRBP-246ENST00000628979 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
CIRBP-246ENST00000628979 WIZO95785 1651 aa38.37■■■■□ 3.73
CIRBP-246ENST00000628979 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.25■■■■□ 3.71
CIRBP-246ENST00000628979 NESP48681 1621 aa38.04■■■■□ 3.68
CIRBP-246ENST00000628979 ERCC6Q03468 1493 aa37.96■■■■□ 3.67
CIRBP-246ENST00000628979 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
CIRBP-246ENST00000628979 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.83■■■■□ 3.65
CIRBP-246ENST00000628979 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.73■■■■□ 3.63
CIRBP-246ENST00000628979 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.62■■■■□ 3.61
CIRBP-246ENST00000628979 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.57■■■■□ 3.61
CIRBP-246ENST00000628979 CUX2O14529 1486 aa37.51■■■■□ 3.59
CIRBP-246ENST00000628979 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.49■■■■□ 3.59
CIRBP-246ENST00000628979 CFTRP13569 1480 aa37.44■■■■□ 3.58
CIRBP-246ENST00000628979 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.42■■■■□ 3.58
CIRBP-246ENST00000628979 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
CIRBP-246ENST00000628979 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.32■■■■□ 3.56
CIRBP-246ENST00000628979 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.27■■■■□ 3.56
CIRBP-246ENST00000628979 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.25■■■■□ 3.55
CIRBP-246ENST00000628979 PRDM2Q13029 1718 aa37.16■■■■□ 3.54
CIRBP-246ENST00000628979 WDR62O43379 1518 aa37.09■■■■□ 3.53
CIRBP-246ENST00000628979 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.95■■■■□ 3.5
CIRBP-246ENST00000628979 TOPBP1Q92547 1522 aa36.69■■■■□ 3.46
CIRBP-246ENST00000628979 ABCC8Q09428 1581 aa36.64■■■■□ 3.46
CIRBP-246ENST00000628979 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.61■■■■□ 3.45
CIRBP-246ENST00000628979 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.6■■■■□ 3.45
CIRBP-246ENST00000628979 IFT140Q96RY7 1462 aa36.48■■■■□ 3.43
CIRBP-246ENST00000628979 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.38■■■■□ 3.41
CIRBP-246ENST00000628979 CUX1P39880 1505 aa36.37■■■■□ 3.41
CIRBP-246ENST00000628979 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
CIRBP-246ENST00000628979 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.28■■■■□ 3.4
CIRBP-246ENST00000628979 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
CIRBP-246ENST00000628979 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.27■■■■□ 3.4
CIRBP-246ENST00000628979 SOGA1O94964 1423 aa36.25■■■■□ 3.39
CIRBP-246ENST00000628979 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
CIRBP-246ENST00000628979 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.18■■■■□ 3.383e-10■■■■■ 35.8
CIRBP-246ENST00000628979 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
CIRBP-246ENST00000628979 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.08■■■■□ 3.371e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-246ENST00000628979 OSCARQ8IYS5 282 aa36.03■■■■□ 3.36
CIRBP-246ENST00000628979 SYNJ1O43426 1573 aa36■■■■□ 3.35
CIRBP-246ENST00000628979 TOP2BQ02880 1626 aa35.98■■■■□ 3.35
CIRBP-246ENST00000628979 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.97■■■■□ 3.35
CIRBP-246ENST00000628979 WDR97A6NE52 1622 aa35.93■■■■□ 3.34
CIRBP-246ENST00000628979 FBLN2P98095 1184 aa35.88■■■■□ 3.33
CIRBP-246ENST00000628979 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.87■■■■□ 3.33
CIRBP-246ENST00000628979 GRIN2BQ13224 1484 aa35.81■■■■□ 3.32
CIRBP-246ENST00000628979 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.81■■■■□ 3.32
CIRBP-246ENST00000628979 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.81■■■■□ 3.32
CIRBP-246ENST00000628979 CHD1O14646 1710 aa35.81■■■■□ 3.32
CIRBP-246ENST00000628979 PBRM1Q86U86 1689 aa35.75■■■■□ 3.31
CIRBP-246ENST00000628979 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.73■■■■□ 3.31
CIRBP-246ENST00000628979 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.7■■■■□ 3.31
CIRBP-246ENST00000628979 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
CIRBP-246ENST00000628979 SYNJ2O15056 1496 aa35.59■■■■□ 3.29
CIRBP-246ENST00000628979 TRIM41Q8WV44 630 aa35.5■■■■□ 3.27
CIRBP-246ENST00000628979 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.43■■■■□ 3.26
CIRBP-246ENST00000628979 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.43■■■■□ 3.26
CIRBP-246ENST00000628979 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.43■■■■□ 3.26
CIRBP-246ENST00000628979 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.43■■■■□ 3.26
CIRBP-246ENST00000628979 ADAMTS12P58397 1594 aa35.42■■■■□ 3.26
CIRBP-246ENST00000628979 ARHGEF11O15085 1522 aa35.39■■■■□ 3.26
CIRBP-246ENST00000628979 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.37■■■■□ 3.25
CIRBP-246ENST00000628979 GRIN2AQ12879 1464 aa35.35■■■■□ 3.25
CIRBP-246ENST00000628979 KIF27Q86VH2 1401 aa35.34■■■■□ 3.25
CIRBP-246ENST00000628979 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.34■■■■□ 3.25
CIRBP-246ENST00000628979 IGF1RP08069 1367 aa35.22■■■■□ 3.23
CIRBP-246ENST00000628979 CEP170Q5SW79 1584 aa35.18■■■■□ 3.22
CIRBP-246ENST00000628979 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.18■■■■□ 3.22
CIRBP-246ENST00000628979 NUP160Q12769 1436 aa35.16■■■■□ 3.22
CIRBP-246ENST00000628979 ARAP1Q96P48 1450 aa35.09■■■■□ 3.21
CIRBP-246ENST00000628979 CUL7Q14999 1698 aa35.09■■■■□ 3.21
CIRBP-246ENST00000628979 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.03■■■■□ 3.2
CIRBP-246ENST00000628979 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.03■■■■□ 3.2
CIRBP-246ENST00000628979 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.92■■■■□ 3.18
CIRBP-246ENST00000628979 JPH4Q96JJ6 628 aa34.9■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms