RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591097.5

CIRBP-231, Transcript of cold inducible RNA binding protein, human

TSL 1 (best)

Gene CIRBP, Length 1,507 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIRBP-231	ENST00000591097	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		56.7	■■■■■ 6.67
CIRBP-231	ENST00000591097	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		50.35	■■■■■ 5.65
CIRBP-231	ENST00000591097	ABCC9	O60706	1549 aa		49.11	■■■■■ 5.45
CIRBP-231	ENST00000591097	NACAD	O15069	1562 aa		47.3	■■■■■ 5.16
CIRBP-231	ENST00000591097	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.3	■■■■■ 5.16
CIRBP-231	ENST00000591097	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	47.29	■■■■■ 5.16
CIRBP-231	ENST00000591097	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		47.15	■■■■■ 5.14
CIRBP-231	ENST00000591097	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		47.11	■■■■■ 5.13
CIRBP-231	ENST00000591097	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		46.95	■■■■■ 5.11
CIRBP-231	ENST00000591097	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.28	■■■■■ 5
CIRBP-231	ENST00000591097	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		45.94	■■■■■ 4.95
CIRBP-231	ENST00000591097	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.93	■■■■■ 4.94
CIRBP-231	ENST00000591097	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	45.88	■■■■■ 4.94
CIRBP-231	ENST00000591097	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.45	■■■■■ 4.87
CIRBP-231	ENST00000591097	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		45	■■■■■ 4.79
CIRBP-231	ENST00000591097	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.68	■■■■■ 4.74
CIRBP-231	ENST00000591097	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.46	■■■■■ 4.71
CIRBP-231	ENST00000591097	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.16	■■■■■ 4.66
CIRBP-231	ENST00000591097	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.97	■■■■■ 4.63
CIRBP-231	ENST00000591097	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	43.92	■■■■■ 4.62
CIRBP-231	ENST00000591097	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		43.71	■■■■■ 4.59
CIRBP-231	ENST00000591097	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.7	■■■■■ 4.59
CIRBP-231	ENST00000591097	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.67	■■■■■ 4.58
CIRBP-231	ENST00000591097	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.63	■■■■■ 4.58
CIRBP-231	ENST00000591097	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		43.59	■■■■■ 4.57
CIRBP-231	ENST00000591097	HMGXB3	Q12766	1538 aa		43.47	■■■■■ 4.55
CIRBP-231	ENST00000591097	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	43.31	■■■■■ 4.52
CIRBP-231	ENST00000591097	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	43.25	■■■■■ 4.51
CIRBP-231	ENST00000591097	WIZ	O95785	1651 aa		43.22	■■■■■ 4.51
CIRBP-231	ENST00000591097	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	42.78	■■■■■ 4.44
CIRBP-231	ENST00000591097	NES	P48681	1621 aa		42.57	■■■■■ 4.4
CIRBP-231	ENST00000591097	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.47	■■■■■ 4.39
CIRBP-231	ENST00000591097	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		42.37	■■■■■ 4.37
CIRBP-231	ENST00000591097	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.28	■■■■■ 4.36
CIRBP-231	ENST00000591097	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		42.27	■■■■■ 4.36
CIRBP-231	ENST00000591097	CFTR	P13569	1480 aa		42.18	■■■■■ 4.34
CIRBP-231	ENST00000591097	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42.15	■■■■■ 4.34
CIRBP-231	ENST00000591097	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
CIRBP-231	ENST00000591097	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42.06	■■■■■ 4.32
CIRBP-231	ENST00000591097	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	41.92	■■■■■ 4.3
CIRBP-231	ENST00000591097	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.88	■■■■■ 4.29
CIRBP-231	ENST00000591097	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.84	■■■■■ 4.29
CIRBP-231	ENST00000591097	CUX2	O14529	1486 aa		41.84	■■■■■ 4.29
CIRBP-231	ENST00000591097	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.81	■■■■■ 4.28
CIRBP-231	ENST00000591097	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.74	■■■■■ 4.27
CIRBP-231	ENST00000591097	WDR62	O43379	1518 aa		41.63	■■■■■ 4.26
CIRBP-231	ENST00000591097	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.49	■■■■■ 4.23
CIRBP-231	ENST00000591097	TOPBP1	Q92547	1522 aa		41.24	■■■■■ 4.19
CIRBP-231	ENST00000591097	ABCC8	Q09428	1581 aa		41.2	■■■■■ 4.19
CIRBP-231	ENST00000591097	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		41.2	■■■■■ 4.19
CIRBP-231	ENST00000591097	CUX1	P39880	1505 aa		41	■■■■■ 4.15
CIRBP-231	ENST00000591097	IFT140	Q96RY7	1462 aa		40.93	■■■■■ 4.14
CIRBP-231	ENST00000591097	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.91	■■■■■ 4.14
CIRBP-231	ENST00000591097	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.12
CIRBP-231	ENST00000591097	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.81	■■■■■ 4.12
CIRBP-231	ENST00000591097	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.77	■■■■■ 4.12
CIRBP-231	ENST00000591097	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	40.75	■■■■■ 4.11	1e-6	■■■■■ 58.5
CIRBP-231	ENST00000591097	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.71	■■■■■ 4.11
CIRBP-231	ENST00000591097	SOGA1	O94964	1423 aa		40.7	■■■■■ 4.11
CIRBP-231	ENST00000591097	TOP2B	Q02880	1626 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CIRBP-231	ENST00000591097	SYNJ1	O43426	1573 aa		40.67	■■■■■ 4.1
CIRBP-231	ENST00000591097	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		40.66	■■■■■ 4.1
CIRBP-231	ENST00000591097	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.61	■■■■■ 4.09
CIRBP-231	ENST00000591097	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.53	■■■■■ 4.08	3e-10	■■■■■ 35.8
CIRBP-231	ENST00000591097	WDR97	A6NE52	1622 aa		40.51	■■■■■ 4.08
CIRBP-231	ENST00000591097	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
CIRBP-231	ENST00000591097	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		40.44	■■■■■ 4.07
CIRBP-231	ENST00000591097	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		40.39	■■■■■ 4.06
CIRBP-231	ENST00000591097	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		40.29	■■■■■ 4.04
CIRBP-231	ENST00000591097	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		40.25	■■■■■ 4.03
CIRBP-231	ENST00000591097	GRIN2B	Q13224	1484 aa		40.23	■■■■■ 4.03
CIRBP-231	ENST00000591097	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CIRBP-231	ENST00000591097	PBRM1	Q86U86	1689 aa		40.16	■■■■■ 4.02
CIRBP-231	ENST00000591097	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	40.12	■■■■■ 4.01
CIRBP-231	ENST00000591097	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.07	■■■■■ 4.01
CIRBP-231	ENST00000591097	CHD1	O14646	1710 aa		40.05	■■■■■ 4
CIRBP-231	ENST00000591097	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.97	■■■■□ 3.99
CIRBP-231	ENST00000591097	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.95	■■■■□ 3.99
CIRBP-231	ENST00000591097	FBLN2	P98095	1184 aa		39.92	■■■■□ 3.98
CIRBP-231	ENST00000591097	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.88	■■■■□ 3.97
CIRBP-231	ENST00000591097	KIF27	Q86VH2	1401 aa		39.86	■■■■□ 3.97
CIRBP-231	ENST00000591097	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	39.86	■■■■□ 3.97
CIRBP-231	ENST00000591097	TRIM41	Q8WV44	630 aa		39.79	■■■■□ 3.96
CIRBP-231	ENST00000591097	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.78	■■■■□ 3.96
CIRBP-231	ENST00000591097	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.73	■■■■□ 3.95
CIRBP-231	ENST00000591097	IGF1R	P08069	1367 aa		39.72	■■■■□ 3.95
CIRBP-231	ENST00000591097	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.67	■■■■□ 3.94
CIRBP-231	ENST00000591097	CUL7	Q14999	1698 aa		39.6	■■■■□ 3.93
CIRBP-231	ENST00000591097	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		39.58	■■■■□ 3.93
CIRBP-231	ENST00000591097	NUP160	Q12769	1436 aa		39.57	■■■■□ 3.93
CIRBP-231	ENST00000591097	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.55	■■■■□ 3.92
CIRBP-231	ENST00000591097	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.49	■■■■□ 3.91
CIRBP-231	ENST00000591097	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		39.47	■■■■□ 3.91
CIRBP-231	ENST00000591097	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		39.47	■■■■□ 3.91
CIRBP-231	ENST00000591097	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		39.47	■■■■□ 3.91
CIRBP-231	ENST00000591097	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		39.45	■■■■□ 3.91
CIRBP-231	ENST00000591097	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		39.45	■■■■□ 3.91
CIRBP-231	ENST00000591097	SHROOM2	Q13796	1616 aa		39.27	■■■■□ 3.88
CIRBP-231	ENST00000591097	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		39.24	■■■■□ 3.87
CIRBP-231	ENST00000591097	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.2	■■■■□ 3.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms