RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591097.5

CIRBP-231, Transcript of cold inducible RNA binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CIRBP, Length 1,507 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBP-231ENST00000591097 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.7■■■■■ 6.67
CIRBP-231ENST00000591097 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.35■■■■■ 5.65
CIRBP-231ENST00000591097 ABCC9O60706 1549 aa49.11■■■■■ 5.45
CIRBP-231ENST00000591097 NACADO15069 1562 aa47.3■■■■■ 5.16
CIRBP-231ENST00000591097 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.3■■■■■ 5.16
CIRBP-231ENST00000591097 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
CIRBP-231ENST00000591097 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.15■■■■■ 5.14
CIRBP-231ENST00000591097 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.11■■■■■ 5.13
CIRBP-231ENST00000591097 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.95■■■■■ 5.11
CIRBP-231ENST00000591097 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.28■■■■■ 5
CIRBP-231ENST00000591097 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.94■■■■■ 4.95
CIRBP-231ENST00000591097 SCRIBQ14160 1630 aa45.93■■■■■ 4.94
CIRBP-231ENST00000591097 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.88■■■■■ 4.94
CIRBP-231ENST00000591097 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.45■■■■■ 4.87
CIRBP-231ENST00000591097 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45■■■■■ 4.79
CIRBP-231ENST00000591097 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
CIRBP-231ENST00000591097 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.46■■■■■ 4.71
CIRBP-231ENST00000591097 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.16■■■■■ 4.66
CIRBP-231ENST00000591097 SMARCA4P51532 1647 aa43.97■■■■■ 4.63
CIRBP-231ENST00000591097 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.92■■■■■ 4.62
CIRBP-231ENST00000591097 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.71■■■■■ 4.59
CIRBP-231ENST00000591097 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.7■■■■■ 4.59
CIRBP-231ENST00000591097 NCAPD3P42695 1498 aa43.67■■■■■ 4.58
CIRBP-231ENST00000591097 SMARCA2P51531 1590 aa43.63■■■■■ 4.58
CIRBP-231ENST00000591097 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.59■■■■■ 4.57
CIRBP-231ENST00000591097 HMGXB3Q12766 1538 aa43.47■■■■■ 4.55
CIRBP-231ENST00000591097 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.31■■■■■ 4.52
CIRBP-231ENST00000591097 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.25■■■■■ 4.51
CIRBP-231ENST00000591097 WIZO95785 1651 aa43.22■■■■■ 4.51
CIRBP-231ENST00000591097 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.78■■■■■ 4.44
CIRBP-231ENST00000591097 NESP48681 1621 aa42.57■■■■■ 4.4
CIRBP-231ENST00000591097 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.47■■■■■ 4.39
CIRBP-231ENST00000591097 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.37■■■■■ 4.37
CIRBP-231ENST00000591097 ERCC6Q03468 1493 aa42.28■■■■■ 4.36
CIRBP-231ENST00000591097 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.27■■■■■ 4.36
CIRBP-231ENST00000591097 CFTRP13569 1480 aa42.18■■■■■ 4.34
CIRBP-231ENST00000591097 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.15■■■■■ 4.34
CIRBP-231ENST00000591097 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
CIRBP-231ENST00000591097 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.06■■■■■ 4.32
CIRBP-231ENST00000591097 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
CIRBP-231ENST00000591097 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.88■■■■■ 4.29
CIRBP-231ENST00000591097 PRDM2Q13029 1718 aa41.84■■■■■ 4.29
CIRBP-231ENST00000591097 CUX2O14529 1486 aa41.84■■■■■ 4.29
CIRBP-231ENST00000591097 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.81■■■■■ 4.28
CIRBP-231ENST00000591097 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.74■■■■■ 4.27
CIRBP-231ENST00000591097 WDR62O43379 1518 aa41.63■■■■■ 4.26
CIRBP-231ENST00000591097 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
CIRBP-231ENST00000591097 TOPBP1Q92547 1522 aa41.24■■■■■ 4.19
CIRBP-231ENST00000591097 ABCC8Q09428 1581 aa41.2■■■■■ 4.19
CIRBP-231ENST00000591097 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.2■■■■■ 4.19
CIRBP-231ENST00000591097 CUX1P39880 1505 aa41■■■■■ 4.15
CIRBP-231ENST00000591097 IFT140Q96RY7 1462 aa40.93■■■■■ 4.14
CIRBP-231ENST00000591097 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.91■■■■■ 4.14
CIRBP-231ENST00000591097 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.82■■■■■ 4.12
CIRBP-231ENST00000591097 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.81■■■■■ 4.12
CIRBP-231ENST00000591097 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.77■■■■■ 4.12
CIRBP-231ENST00000591097 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.75■■■■■ 4.111e-6■■■■■ 58.5
CIRBP-231ENST00000591097 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.71■■■■■ 4.11
CIRBP-231ENST00000591097 SOGA1O94964 1423 aa40.7■■■■■ 4.11
CIRBP-231ENST00000591097 TOP2BQ02880 1626 aa40.67■■■■■ 4.1
CIRBP-231ENST00000591097 SYNJ1O43426 1573 aa40.67■■■■■ 4.1
CIRBP-231ENST00000591097 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.66■■■■■ 4.1
CIRBP-231ENST00000591097 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
CIRBP-231ENST00000591097 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.53■■■■■ 4.083e-10■■■■■ 35.8
CIRBP-231ENST00000591097 WDR97A6NE52 1622 aa40.51■■■■■ 4.08
CIRBP-231ENST00000591097 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.46■■■■■ 4.07
CIRBP-231ENST00000591097 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.44■■■■■ 4.07
CIRBP-231ENST00000591097 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.39■■■■■ 4.06
CIRBP-231ENST00000591097 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.29■■■■■ 4.04
CIRBP-231ENST00000591097 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.25■■■■■ 4.03
CIRBP-231ENST00000591097 GRIN2BQ13224 1484 aa40.23■■■■■ 4.03
CIRBP-231ENST00000591097 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.16■■■■■ 4.02
CIRBP-231ENST00000591097 PBRM1Q86U86 1689 aa40.16■■■■■ 4.02
CIRBP-231ENST00000591097 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.12■■■■■ 4.01
CIRBP-231ENST00000591097 OSCARQ8IYS5 282 aa40.07■■■■■ 4.01
CIRBP-231ENST00000591097 CHD1O14646 1710 aa40.05■■■■■ 4
CIRBP-231ENST00000591097 SYNJ2O15056 1496 aa39.97■■■■□ 3.99
CIRBP-231ENST00000591097 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.95■■■■□ 3.99
CIRBP-231ENST00000591097 FBLN2P98095 1184 aa39.92■■■■□ 3.98
CIRBP-231ENST00000591097 ADAMTS12P58397 1594 aa39.88■■■■□ 3.97
CIRBP-231ENST00000591097 KIF27Q86VH2 1401 aa39.86■■■■□ 3.97
CIRBP-231ENST00000591097 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.86■■■■□ 3.97
CIRBP-231ENST00000591097 TRIM41Q8WV44 630 aa39.79■■■■□ 3.96
CIRBP-231ENST00000591097 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.78■■■■□ 3.96
CIRBP-231ENST00000591097 GRIN2AQ12879 1464 aa39.73■■■■□ 3.95
CIRBP-231ENST00000591097 IGF1RP08069 1367 aa39.72■■■■□ 3.95
CIRBP-231ENST00000591097 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.67■■■■□ 3.94
CIRBP-231ENST00000591097 CUL7Q14999 1698 aa39.6■■■■□ 3.93
CIRBP-231ENST00000591097 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.58■■■■□ 3.93
CIRBP-231ENST00000591097 NUP160Q12769 1436 aa39.57■■■■□ 3.93
CIRBP-231ENST00000591097 CEP170Q5SW79 1584 aa39.55■■■■□ 3.92
CIRBP-231ENST00000591097 ARHGEF11O15085 1522 aa39.49■■■■□ 3.91
CIRBP-231ENST00000591097 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.47■■■■□ 3.91
CIRBP-231ENST00000591097 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.47■■■■□ 3.91
CIRBP-231ENST00000591097 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.47■■■■□ 3.91
CIRBP-231ENST00000591097 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.45■■■■□ 3.91
CIRBP-231ENST00000591097 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.45■■■■□ 3.91
CIRBP-231ENST00000591097 SHROOM2Q13796 1616 aa39.27■■■■□ 3.88
CIRBP-231ENST00000591097 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.24■■■■□ 3.87
CIRBP-231ENST00000591097 ARAP1Q96P48 1450 aa39.2■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms