Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.682e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.762e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.231e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.72e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.872e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 C9orf3-206ENST00000428313 2288 ntTSL 1 (best)15.47■□□□□ 0.071e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 C9orf3-204ENST00000424143 1605 ntTSL 215.05■□□□□ -01e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.171e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.571e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 H2AFY-219ENST00000513210 775 ntTSL 211.87□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.283e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 BCL2L2-206ENST00000557579 596 ntTSL 314.52□□□□□ -0.091e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 BCL2L2-202ENST00000553824 548 ntTSL 411.66□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 SORBS2-202ENST00000319454 2011 ntTSL 1 (best)11.11□□□□□ -0.635e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.295e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 MINK1-213ENST00000577021 675 ntTSL 59.1□□□□□ -0.956e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 SHANK3-202ENST00000414786 7394 ntTSL 518.55■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.122e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.43e-22■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 CTSB-203ENST00000420692 2230 ntTSL 215.95■□□□□ 0.143e-22■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -03e-22■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.083e-22■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 CTSB-211ENST00000526481 660 ntTSL 514.01□□□□□ -0.173e-22■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 TRAF4-207ENST00000461195 787 ntTSL 221.17■□□□□ 0.984e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.894e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 TRAF4-204ENST00000422344 631 ntTSL 320.55■□□□□ 0.884e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.864e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 TRAF4-203ENST00000394925 702 ntTSL 219.3■□□□□ 0.684e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 TRAF4-216ENST00000586813 789 ntTSL 317.75■□□□□ 0.434e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.44e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 TRAF4-212ENST00000498540 748 ntTSL 313.48□□□□□ -0.254e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 TRAF4-210ENST00000475329 544 ntTSL 313.45□□□□□ -0.264e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.614e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 GRB2-208ENST00000578961 687 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.812e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 GRB2-210ENST00000582582 584 ntTSL 49.52□□□□□ -0.892e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.583e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.085e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 TMUB1-206ENST00000488752 584 ntTSL 221.43■■□□□ 1.025e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.543e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.293e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.143e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.093e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.163e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 NPRL3-210ENST00000610509 2917 ntTSL 212.9□□□□□ -0.347e-11■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 CRTC3-209ENST00000560320 554 ntTSL 410.41□□□□□ -0.743e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SRGAP2-214ENST00000605476 2484 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.773e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SRGAP2-215ENST00000605610 3212 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.783e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 DLGAP4-AS1-204ENST00000559455 584 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.783e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.843e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.123e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.163e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.213e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 AP000893.2-201ENST00000527550 433 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.253e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SOX6-208ENST00000527619 2699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.273e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.433e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.473e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 VPS13D-202ENST00000460333 4910 ntTSL 25.87□□□□□ -1.473e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 TNFRSF1A-206ENST00000535038 578 ntTSL 45.79□□□□□ -1.483e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)5.77□□□□□ -1.493e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.563e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.623e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.673e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.692e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.241e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 DGAT1-203ENST00000524965 1336 ntTSL 512.37□□□□□ -0.437e-10■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 DGAT1-202ENST00000524844 401 ntTSL 37.49□□□□□ -1.217e-10■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 ARHGEF40-206ENST00000555232 3902 ntTSL 212.02□□□□□ -0.492e-9■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 ZNF219-208ENST00000555270 798 ntTSL 416.14■□□□□ 0.171e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 ZNF219-207ENST00000554923 567 ntTSL 414.1□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 ZNF219-210ENST00000556101 475 ntTSL 46.1□□□□□ -1.431e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.512e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.582e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.642e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.662e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.792e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 CLCN7-208ENST00000564968 652 ntTSL 414.61□□□□□ -0.071e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.074e-10■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 ERRFI1-205ENST00000487559 787 ntTSL 221.76■■□□□ 1.074e-10■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.024e-10■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.034e-10■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.023e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.973e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.673e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.553e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SPAG16-203ENST00000406979 2352 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.473e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SPAG16-206ENST00000420497 514 ntTSL 517.64■□□□□ 0.413e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SPAG16-208ENST00000440779 805 ntTSL 317.64■□□□□ 0.413e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.323e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 SPAG16-211ENST00000452556 4751 ntTSL 28.81□□□□□ -13e-7■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-202ENST00000378458 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.132e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-209ENST00000464952 558 ntTSL 47.84□□□□□ -1.152e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.32e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-213ENST00000472095 475 ntTSL 46.04□□□□□ -1.442e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-208ENST00000452706 834 ntTSL 26.01□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 17.8
PCBP2Q15366 FAM107B-227ENST00000495292 542 ntTSL 46.01□□□□□ -1.452e-6■■■□□ 17.8
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