RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440779.5

SPAG16-208, Transcript of sperm associated antigen 16, humanhuman

TSL 3

Gene SPAG16, Length 805 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG16-208ENST00000440779 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.92■■■■■ 5.42
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SPAG16-208ENST00000440779 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.18■■■■■ 4.34
SPAG16-208ENST00000440779 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.04■■■■■ 4.32
SPAG16-208ENST00000440779 NACADO15069 1562 aa41.76■■■■■ 4.28
SPAG16-208ENST00000440779 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.41■■■■■ 4.22
SPAG16-208ENST00000440779 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.38■■■■■ 4.22
SPAG16-208ENST00000440779 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.31■■■■■ 4.2
SPAG16-208ENST00000440779 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.01■■■■■ 4.16
SPAG16-208ENST00000440779 BICRAQ9NZM4 1560 aa41■■■■■ 4.15
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SPAG16-208ENST00000440779 SCRIBQ14160 1630 aa40.21■■■■■ 4.03
SPAG16-208ENST00000440779 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.21■■■■■ 4.03
SPAG16-208ENST00000440779 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.09■■■■■ 4.01
SPAG16-208ENST00000440779 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
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SPAG16-208ENST00000440779 ERCC6Q03468 1493 aa38.41■■■■□ 3.74
SPAG16-208ENST00000440779 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.37■■■■□ 3.73
SPAG16-208ENST00000440779 SMARCA4P51532 1647 aa38.3■■■■□ 3.72
SPAG16-208ENST00000440779 SMARCA2P51531 1590 aa38.26■■■■□ 3.72
SPAG16-208ENST00000440779 HMGXB3Q12766 1538 aa38.25■■■■□ 3.71
SPAG16-208ENST00000440779 NESP48681 1621 aa38.12■■■■□ 3.69
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SPAG16-208ENST00000440779 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
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SPAG16-208ENST00000440779 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.72■■■■□ 3.63
SPAG16-208ENST00000440779 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.71■■■■□ 3.63
SPAG16-208ENST00000440779 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.51■■■■□ 3.59
SPAG16-208ENST00000440779 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.31■■■■□ 3.56
SPAG16-208ENST00000440779 WIZO95785 1651 aa37.31■■■■□ 3.56
SPAG16-208ENST00000440779 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.26■■■■□ 3.55
SPAG16-208ENST00000440779 WDR62O43379 1518 aa37.2■■■■□ 3.55
SPAG16-208ENST00000440779 TRIM41Q8WV44 630 aa37.04■■■■□ 3.52
SPAG16-208ENST00000440779 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.03■■■■□ 3.52
SPAG16-208ENST00000440779 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.94■■■■□ 3.5
SPAG16-208ENST00000440779 CFTRP13569 1480 aa36.83■■■■□ 3.49
SPAG16-208ENST00000440779 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.75■■■■□ 3.47
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SPAG16-208ENST00000440779 PRDM2Q13029 1718 aa36.62■■■■□ 3.45
SPAG16-208ENST00000440779 OSCARQ8IYS5 282 aa36.58■■■■□ 3.45
SPAG16-208ENST00000440779 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.31■■■■□ 3.4
SPAG16-208ENST00000440779 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.3■■■■□ 3.4
SPAG16-208ENST00000440779 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.3■■■■□ 3.4
SPAG16-208ENST00000440779 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.3■■■■□ 3.4
SPAG16-208ENST00000440779 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
SPAG16-208ENST00000440779 IFT140Q96RY7 1462 aa36.27■■■■□ 3.4
SPAG16-208ENST00000440779 TOPBP1Q92547 1522 aa36.22■■■■□ 3.39
SPAG16-208ENST00000440779 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
SPAG16-208ENST00000440779 ARHGEF11O15085 1522 aa36.1■■■■□ 3.37
SPAG16-208ENST00000440779 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.06■■■■□ 3.36
SPAG16-208ENST00000440779 ABCC8Q09428 1581 aa36.06■■■■□ 3.36
SPAG16-208ENST00000440779 CHD1O14646 1710 aa36■■■■□ 3.35
SPAG16-208ENST00000440779 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
SPAG16-208ENST00000440779 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.9■■■■□ 3.341e-8■■■□□ 15.8
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SPAG16-208ENST00000440779 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.79■■■■□ 3.32
SPAG16-208ENST00000440779 ARAP1Q96P48 1450 aa35.72■■■■□ 3.31
SPAG16-208ENST00000440779 FBLN2P98095 1184 aa35.71■■■■□ 3.31
SPAG16-208ENST00000440779 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.69■■■■□ 3.3
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SPAG16-208ENST00000440779 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.59■■■■□ 3.29
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SPAG16-208ENST00000440779 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.54■■■■□ 3.28
SPAG16-208ENST00000440779 WDR97A6NE52 1622 aa35.54■■■■□ 3.28
SPAG16-208ENST00000440779 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
SPAG16-208ENST00000440779 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.49■■■■□ 3.27
SPAG16-208ENST00000440779 CUX1P39880 1505 aa35.47■■■■□ 3.27
SPAG16-208ENST00000440779 SYNJ1O43426 1573 aa35.42■■■■□ 3.26
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SPAG16-208ENST00000440779 GRIN2BQ13224 1484 aa35.36■■■■□ 3.25
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SPAG16-208ENST00000440779 PBRM1Q86U86 1689 aa35.33■■■■□ 3.25
SPAG16-208ENST00000440779 SYNJ2O15056 1496 aa35.29■■■■□ 3.24
SPAG16-208ENST00000440779 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.19■■■■□ 3.22
SPAG16-208ENST00000440779 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.15■■■■□ 3.22
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SPAG16-208ENST00000440779 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.95■■■■□ 3.18
SPAG16-208ENST00000440779 GRIN2AQ12879 1464 aa34.92■■■■□ 3.18
SPAG16-208ENST00000440779 ADAMTS12P58397 1594 aa34.91■■■■□ 3.18
SPAG16-208ENST00000440779 CEP170Q5SW79 1584 aa34.87■■■■□ 3.17
SPAG16-208ENST00000440779 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.84■■■■□ 3.17
SPAG16-208ENST00000440779 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.83■■■■□ 3.17
SPAG16-208ENST00000440779 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
SPAG16-208ENST00000440779 NUP160Q12769 1436 aa34.8■■■■□ 3.16
SPAG16-208ENST00000440779 TOP2BQ02880 1626 aa34.79■■■■□ 3.16
SPAG16-208ENST00000440779 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
SPAG16-208ENST00000440779 SHROOM2Q13796 1616 aa34.77■■■■□ 3.16
SPAG16-208ENST00000440779 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.71■■■■□ 3.15
SPAG16-208ENST00000440779 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.65■■■■□ 3.14
SPAG16-208ENST00000440779 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.6■■■■□ 3.13
SPAG16-208ENST00000440779 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP34.49■■■■□ 3.11
SPAG16-208ENST00000440779 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.44■■■■□ 3.1
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