RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488752.5

TMUB1-206, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMUB1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB1-206ENST00000488752 NISCHQ9Y2I1 1504 aa54.66■■■■■ 6.34
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TMUB1-206ENST00000488752 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.71■■■■■ 4.91
TMUB1-206ENST00000488752 NACADO15069 1562 aa45.68■■■■■ 4.9
TMUB1-206ENST00000488752 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.66■■■■■ 4.9
TMUB1-206ENST00000488752 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.54■■■■■ 4.88
TMUB1-206ENST00000488752 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.43■■■■■ 4.86
TMUB1-206ENST00000488752 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.26■■■■■ 4.84
TMUB1-206ENST00000488752 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.64■■■■■ 4.74
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TMUB1-206ENST00000488752 SCRIBQ14160 1630 aa44.3■■■■■ 4.68
TMUB1-206ENST00000488752 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.29■■■■■ 4.68
TMUB1-206ENST00000488752 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.89■■■■■ 4.62
TMUB1-206ENST00000488752 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.49■■■■■ 4.55
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TMUB1-206ENST00000488752 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.65■■■■■ 4.42
TMUB1-206ENST00000488752 SMARCA4P51532 1647 aa42.4■■■■■ 4.38
TMUB1-206ENST00000488752 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.38■■■■■ 4.37
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TMUB1-206ENST00000488752 NCAPD3P42695 1498 aa42.14■■■■■ 4.34
TMUB1-206ENST00000488752 SMARCA2P51531 1590 aa42.14■■■■■ 4.34
TMUB1-206ENST00000488752 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.1■■■■■ 4.33
TMUB1-206ENST00000488752 PEG3Q9GZU2 1588 aa42■■■■■ 4.31
TMUB1-206ENST00000488752 HMGXB3Q12766 1538 aa41.93■■■■■ 4.3
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TMUB1-206ENST00000488752 NESP48681 1621 aa41.07■■■■■ 4.16
TMUB1-206ENST00000488752 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.03■■■■■ 4.16
TMUB1-206ENST00000488752 ERCC6Q03468 1493 aa40.93■■■■■ 4.14
TMUB1-206ENST00000488752 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.92■■■■■ 4.14
TMUB1-206ENST00000488752 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.76■■■■■ 4.12
TMUB1-206ENST00000488752 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.75■■■■■ 4.11
TMUB1-206ENST00000488752 CFTRP13569 1480 aa40.68■■■■■ 4.1
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TMUB1-206ENST00000488752 CUX2O14529 1486 aa40.48■■■■■ 4.07
TMUB1-206ENST00000488752 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
TMUB1-206ENST00000488752 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.44■■■■■ 4.06
TMUB1-206ENST00000488752 PRDM2Q13029 1718 aa40.39■■■■■ 4.06
TMUB1-206ENST00000488752 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.39■■■■■ 4.06
TMUB1-206ENST00000488752 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.32■■■■■ 4.04
TMUB1-206ENST00000488752 WDR62O43379 1518 aa40.17■■■■■ 4.02
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TMUB1-206ENST00000488752 TOPBP1Q92547 1522 aa39.79■■■■□ 3.96
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TMUB1-206ENST00000488752 IFT140Q96RY7 1462 aa39.55■■■■□ 3.92
TMUB1-206ENST00000488752 CUX1P39880 1505 aa39.5■■■■□ 3.91
TMUB1-206ENST00000488752 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.46■■■■□ 3.91
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TMUB1-206ENST00000488752 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
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TMUB1-206ENST00000488752 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.29■■■■□ 3.88
TMUB1-206ENST00000488752 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.27■■■■□ 3.88
TMUB1-206ENST00000488752 TOP2BQ02880 1626 aa39.2■■■■□ 3.87
TMUB1-206ENST00000488752 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.19■■■■□ 3.86
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TMUB1-206ENST00000488752 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa39.17■■■■□ 3.86
TMUB1-206ENST00000488752 SYNJ1O43426 1573 aa39.16■■■■□ 3.86
TMUB1-206ENST00000488752 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.12■■■■□ 3.851e-14■■■■□ 22.2
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TMUB1-206ENST00000488752 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
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TMUB1-206ENST00000488752 GRIN2BQ13224 1484 aa38.86■■■■□ 3.81
TMUB1-206ENST00000488752 OSCARQ8IYS5 282 aa38.84■■■■□ 3.81
TMUB1-206ENST00000488752 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.83■■■■□ 3.81
TMUB1-206ENST00000488752 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.76■■■■□ 3.8
TMUB1-206ENST00000488752 PBRM1Q86U86 1689 aa38.76■■■■□ 3.8
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TMUB1-206ENST00000488752 FBLN2P98095 1184 aa38.67■■■■□ 3.78
TMUB1-206ENST00000488752 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
TMUB1-206ENST00000488752 SYNJ2O15056 1496 aa38.59■■■■□ 3.77
TMUB1-206ENST00000488752 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.55■■■■□ 3.76
TMUB1-206ENST00000488752 KIF27Q86VH2 1401 aa38.48■■■■□ 3.75
TMUB1-206ENST00000488752 ADAMTS12P58397 1594 aa38.45■■■■□ 3.75
TMUB1-206ENST00000488752 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.42■■■■□ 3.74
TMUB1-206ENST00000488752 TRIM41Q8WV44 630 aa38.42■■■■□ 3.74
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TMUB1-206ENST00000488752 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.16■■■■□ 3.7
TMUB1-206ENST00000488752 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.16■■■■□ 3.7
TMUB1-206ENST00000488752 CEP170Q5SW79 1584 aa38.13■■■■□ 3.69
TMUB1-206ENST00000488752 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.1■■■■□ 3.69
TMUB1-206ENST00000488752 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.09■■■■□ 3.69
TMUB1-206ENST00000488752 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.97■■■■□ 3.67
TMUB1-206ENST00000488752 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.87■■■■□ 3.65
TMUB1-206ENST00000488752 SHROOM2Q13796 1616 aa37.87■■■■□ 3.65
TMUB1-206ENST00000488752 ARAP1Q96P48 1450 aa37.85■■■■□ 3.65
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