RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000413312.5

SPAG16-204, Transcript of sperm associated antigen 16, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SPAG16, Length 2,258 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG16-204ENST00000413312 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.57■■■■■ 4.09
SPAG16-204ENST00000413312 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.62■■■■□ 3.13
SPAG16-204ENST00000413312 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.44■■■■□ 3.1
SPAG16-204ENST00000413312 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.09
SPAG16-204ENST00000413312 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.96■■■■□ 3.03
SPAG16-204ENST00000413312 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.63■■■□□ 2.97
SPAG16-204ENST00000413312 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.27■■■□□ 2.92
SPAG16-204ENST00000413312 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.04■■■□□ 2.88
SPAG16-204ENST00000413312 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.93■■■□□ 2.86
SPAG16-204ENST00000413312 ABCC9O60706 1549 aa32.38■■■□□ 2.77
SPAG16-204ENST00000413312 SCRIBQ14160 1630 aa32.32■■■□□ 2.77
SPAG16-204ENST00000413312 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.13■■■□□ 2.73
SPAG16-204ENST00000413312 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.07■■■□□ 2.73
SPAG16-204ENST00000413312 HRCP23327 699 aa32.03■■■□□ 2.72
SPAG16-204ENST00000413312 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.02■■■□□ 2.72
SPAG16-204ENST00000413312 NACADO15069 1562 aa31.86■■■□□ 2.69
SPAG16-204ENST00000413312 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.78■■■□□ 2.68
SPAG16-204ENST00000413312 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.67■■■□□ 2.66
SPAG16-204ENST00000413312 TRIM41Q8WV44 630 aa31.62■■■□□ 2.65
SPAG16-204ENST00000413312 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.56■■■□□ 2.64
SPAG16-204ENST00000413312 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
SPAG16-204ENST00000413312 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
SPAG16-204ENST00000413312 WIZO95785 1651 aa31.39■■■□□ 2.61
SPAG16-204ENST00000413312 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.37■■■□□ 2.61
SPAG16-204ENST00000413312 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.17■■■□□ 2.58
SPAG16-204ENST00000413312 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.11■■■□□ 2.57
SPAG16-204ENST00000413312 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.97■■■□□ 2.55
SPAG16-204ENST00000413312 SMARCA4P51532 1647 aa30.89■■■□□ 2.53
SPAG16-204ENST00000413312 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.88■■■□□ 2.53
SPAG16-204ENST00000413312 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.87■■■□□ 2.53
SPAG16-204ENST00000413312 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.77■■■□□ 2.52
SPAG16-204ENST00000413312 SMARCA2P51531 1590 aa30.72■■■□□ 2.51
SPAG16-204ENST00000413312 ABCC8Q09428 1581 aa30.7■■■□□ 2.5
SPAG16-204ENST00000413312 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
SPAG16-204ENST00000413312 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.57■■■□□ 2.48
SPAG16-204ENST00000413312 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.52■■■□□ 2.48
SPAG16-204ENST00000413312 SOGA1O94964 1423 aa30.43■■■□□ 2.46
SPAG16-204ENST00000413312 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.29■■■□□ 2.44
SPAG16-204ENST00000413312 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.28■■■□□ 2.44
SPAG16-204ENST00000413312 CEP162Q5TB80 1403 aa30.27■■■□□ 2.44
SPAG16-204ENST00000413312 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.24■■■□□ 2.43
SPAG16-204ENST00000413312 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.24■■■□□ 2.43
SPAG16-204ENST00000413312 EEA1Q15075 1411 aa30.23■■■□□ 2.43
SPAG16-204ENST00000413312 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.22■■■□□ 2.43
SPAG16-204ENST00000413312 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
SPAG16-204ENST00000413312 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.11■■■□□ 2.41
SPAG16-204ENST00000413312 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
SPAG16-204ENST00000413312 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.1■■■□□ 2.41
SPAG16-204ENST00000413312 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
SPAG16-204ENST00000413312 GOLGA3Q08378 1498 aa30.04■■■□□ 2.4
SPAG16-204ENST00000413312 SYNJ1O43426 1573 aa30.03■■■□□ 2.4
SPAG16-204ENST00000413312 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SPAG16-204ENST00000413312 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.87■■■□□ 2.37
SPAG16-204ENST00000413312 KIF21BO75037 1637 aa29.83■■■□□ 2.37
SPAG16-204ENST00000413312 CLIP1P30622 1438 aa29.71■■■□□ 2.35
SPAG16-204ENST00000413312 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.67■■■□□ 2.34
SPAG16-204ENST00000413312 TOP2BQ02880 1626 aa29.64■■■□□ 2.34
SPAG16-204ENST00000413312 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.58■■■□□ 2.33
SPAG16-204ENST00000413312 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SPAG16-204ENST00000413312 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.53■■■□□ 2.32
SPAG16-204ENST00000413312 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
SPAG16-204ENST00000413312 NCAPD3P42695 1498 aa29.5■■■□□ 2.31
SPAG16-204ENST00000413312 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
SPAG16-204ENST00000413312 HMGXB3Q12766 1538 aa29.48■■■□□ 2.31
SPAG16-204ENST00000413312 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
SPAG16-204ENST00000413312 APLP2Q06481 763 aa29.42■■■□□ 2.3
SPAG16-204ENST00000413312 PRXQ9BXM0 1461 aa29.38■■■□□ 2.29
SPAG16-204ENST00000413312 CUX1P39880 1505 aa29.37■■■□□ 2.29
SPAG16-204ENST00000413312 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.35■■■□□ 2.29
SPAG16-204ENST00000413312 CFTRP13569 1480 aa29.28■■■□□ 2.28
SPAG16-204ENST00000413312 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
SPAG16-204ENST00000413312 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
SPAG16-204ENST00000413312 ARAP1Q96P48 1450 aa29.24■■■□□ 2.27
SPAG16-204ENST00000413312 NEUROD1Q13562 356 aa29.22■■■□□ 2.27
SPAG16-204ENST00000413312 KIF27Q86VH2 1401 aa29.22■■■□□ 2.27
SPAG16-204ENST00000413312 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.11■■■□□ 2.25
SPAG16-204ENST00000413312 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
SPAG16-204ENST00000413312 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.99■■■□□ 2.23
SPAG16-204ENST00000413312 PRDM2Q13029 1718 aa28.99■■■□□ 2.23
SPAG16-204ENST00000413312 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.95■■■□□ 2.23
SPAG16-204ENST00000413312 CUX2O14529 1486 aa28.95■■■□□ 2.23
SPAG16-204ENST00000413312 IGF1RP08069 1367 aa28.94■■■□□ 2.22
SPAG16-204ENST00000413312 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa28.91■■■□□ 2.22
SPAG16-204ENST00000413312 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
SPAG16-204ENST00000413312 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
SPAG16-204ENST00000413312 MIER1Q8N108 512 aa28.87■■■□□ 2.21
SPAG16-204ENST00000413312 CLSPNQ9HAW4 1339 aa28.84■■■□□ 2.21
SPAG16-204ENST00000413312 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.84■■■□□ 2.21
SPAG16-204ENST00000413312 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
SPAG16-204ENST00000413312 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.8■■■□□ 2.2
SPAG16-204ENST00000413312 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
SPAG16-204ENST00000413312 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.77■■■□□ 2.2
SPAG16-204ENST00000413312 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.74■■■□□ 2.19
SPAG16-204ENST00000413312 ITGAEP38570 1179 aa28.68■■■□□ 2.18
SPAG16-204ENST00000413312 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.67■■■□□ 2.18
SPAG16-204ENST00000413312 TIAM1Q13009 1591 aa28.66■■■□□ 2.18
SPAG16-204ENST00000413312 MAP3K1Q13233 1512 aa28.62■■■□□ 2.17
SPAG16-204ENST00000413312 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.56■■■□□ 2.16
SPAG16-204ENST00000413312 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.56■■■□□ 2.16
SPAG16-204ENST00000413312 P3H3Q8IVL6 736 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms