Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 33.5
EXOSC5Q9NQT4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 33.5
EXOSC5Q9NQT4 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.281e-6■■■■■ 33.5
EXOSC5Q9NQT4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 33.5
EXOSC5Q9NQT4 TUSC3-212ENST00000511783 1203 ntTSL 55.69□□□□□ -1.51e-6■■■■■ 33.5
EXOSC5Q9NQT4 TUSC3-207ENST00000508446 457 ntTSL 32.98□□□□□ -1.931e-6■■■■■ 33.5
EXOSC5Q9NQT4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.491e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 AC106798.1-201ENST00000510621 585 ntTSL 44.21□□□□□ -1.741e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.386e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 KDM1B-203ENST00000546309 496 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.356e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 SAMD4A-207ENST00000555112 2287 ntTSL 1 (best)18.93■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.14e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 33.4
EXOSC5Q9NQT4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.113e-7■■■■■ 33.3
EXOSC5Q9NQT4 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 33.3
EXOSC5Q9NQT4 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 33.3
EXOSC5Q9NQT4 TNRC18-207ENST00000440081 757 ntTSL 39.03□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 33.3
EXOSC5Q9NQT4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.246e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.326e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS18A-203ENST00000427312 803 ntTSL 1 (best)13.01□□□□□ -0.336e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.336e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.346e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 LRRC8B-204ENST00000449440 763 ntTSL 319.7■□□□□ 0.741e-6■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 LRRC8B-202ENST00000358200 1957 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 LRRC8B-205ENST00000639264 7736 ntAPPRIS P1 TSL 55.89□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.61e-6■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-8■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 ZBTB20-209ENST00000470311 587 ntTSL 411.08□□□□□ -0.643e-8■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 ZBTB20-212ENST00000474710 2757 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.733e-8■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 ZBTB20-202ENST00000393785 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.043e-8■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 ZBTB20-203ENST00000462705 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 ZBTB20-213ENST00000479879 565 ntTSL 53.97□□□□□ -1.773e-8■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.93e-8■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS28-204ENST00000519120 403 ntTSL 212.23□□□□□ -0.456e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS28-209ENST00000522987 487 ntTSL 312.2□□□□□ -0.466e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.716e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS28-202ENST00000518271 487 ntTSL 59.55□□□□□ -0.886e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS28-206ENST00000520946 411 ntTSL 59.53□□□□□ -0.886e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS28-208ENST00000521605 437 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.926e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS28-207ENST00000521434 585 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.216e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 MRPS28-205ENST00000519386 555 ntTSL 26.26□□□□□ -1.416e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.476e-9■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 VPS13A-204ENST00000376634 10269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.557e-7■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.667e-7■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.017e-7■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.337e-7■■■■■ 33.2
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-215ENST00000470759 762 ntTSL 515.06■□□□□ 09e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.763e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)18.05■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-209ENST00000597813 630 ntTSL 216.45■□□□□ 0.223e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.123e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-206ENST00000596984 664 ntTSL 514.56□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.123e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 HNRNPM-215ENST00000601645 832 ntTSL 311.97□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 PTPRF-213ENST00000481019 459 ntTSL 39.99□□□□□ -0.813e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 PTPRF-214ENST00000496043 415 ntTSL 59.85□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 FHIT-204ENST00000468189 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 FHIT-206ENST00000488467 601 ntTSL 38.86□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.625e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 ZNF124-201ENST00000340684 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 ZNF124-205ENST00000491848 701 ntTSL 39.68□□□□□ -0.865e-7■■■■■ 33.1
EXOSC5Q9NQT4 RAD51B-224ENST00000557045 528 ntTSL 35.5□□□□□ -1.536e-7■■■■■ 33
EXOSC5Q9NQT4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 33
EXOSC5Q9NQT4 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.079e-7■■■■■ 33
EXOSC5Q9NQT4 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.079e-7■■■■■ 33
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-203ENST00000546537 599 ntTSL 59.27□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-215ENST00000552374 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.051e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-213ENST00000550831 1446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-209ENST00000550020 572 ntTSL 47.89□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-207ENST00000549425 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.86□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-205ENST00000547878 1716 ntTSL 27.64□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-217ENST00000552801 1397 ntTSL 57.07□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-214ENST00000551297 660 ntTSL 36.84□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-206ENST00000548283 3640 ntTSL 56.57□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-201ENST00000355445 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-208ENST00000549537 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-212ENST00000550800 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 34.84□□□□□ -1.631e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 TMEM116-210ENST00000550037 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 33.72□□□□□ -1.811e-6■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 AIG1-204ENST00000367601 727 ntTSL 510.74□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 AIG1-205ENST00000447498 444 ntTSL 59.56□□□□□ -0.883e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 AIG1-202ENST00000357847 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 AIG1-201ENST00000275235 1202 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.193e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.53e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 AIG1-206ENST00000458219 593 ntTSL 25.51□□□□□ -1.533e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.693e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 AIG1-207ENST00000470265 572 ntTSL 24.15□□□□□ -1.753e-7■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.283e-8■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 NPM1-208ENST00000521672 597 ntTSL 56.75□□□□□ -1.333e-8■■■■■ 32.9
EXOSC5Q9NQT4 NPM1-204ENST00000517671 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.363e-8■■■■■ 32.9
Retrieved 100 of 8,799 protein–RNA pairs in 45.5 ms