Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.032e-11■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.892e-11■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.892e-11■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.812e-11■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-6■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.298e-16■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.158e-16■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.559e-15■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 CACUL1-207ENST00000544392 1060 ntTSL 210.24□□□□□ -0.774e-6■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 GNG5-203ENST00000487806 557 ntTSL 37.77□□□□□ -1.172e-29■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.185e-9■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.741e-6■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.62e-7■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-7■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 COPB1-201ENST00000249923 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.631e-9■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 COPB1-202ENST00000439561 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.831e-9■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.169e-7■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 KRT18-203ENST00000546656 521 ntTSL 216.99■□□□□ 0.314e-12■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 MDH2-202ENST00000424167 681 ntTSL 215.35■□□□□ 0.054e-34■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 PRPF8-206ENST00000572723 959 ntTSL 214.31□□□□□ -0.121e-8■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.973e-7■■□□□ 12.2
PABPC4Q13310 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.361e-7■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.076e-7■■□□□ 12.2
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PABPC4Q13310 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.069e-11■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.829e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.79e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 SLC9A3R2-207ENST00000565855 759 ntTSL 219.28■□□□□ 0.689e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 GAMT-204ENST00000640164 520 ntTSL 218.95■□□□□ 0.623e-6■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.49e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 SLC9A3R2-203ENST00000561844 738 ntTSL 317.17■□□□□ 0.349e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.239e-11■■□□□ 12.1
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PABPC4Q13310 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.159e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 NR2F2-203ENST00000421109 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.229e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 DIABLO-205ENST00000439489 634 ntTSL 312.99□□□□□ -0.339e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CKLF-CMTM1-205ENST00000615332 395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.349e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 IST1-206ENST00000456820 2031 ntTSL 512.79□□□□□ -0.369e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 MCCC2-201ENST00000340941 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.389e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 IST1-201ENST00000329908 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.419e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CKLF-CMTM1-201ENST00000527729 585 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.479e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 IST1-202ENST00000378798 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.489e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 NR2F2-202ENST00000394171 3501 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.639e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CKLF-208ENST00000563092 365 ntTSL 310.36□□□□□ -0.759e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.879e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.969e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 CKLF-CMTM1-203ENST00000529718 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 28.92□□□□□ -0.989e-11■■□□□ 12.1
PABPC4Q13310 OSGIN2-201ENST00000297438 4209 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.049e-11■■□□□ 12.1
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