RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564858.1

APRT-205, Transcript of adenine phosphoribosyltransferase, humanhuman

TSL 2

Gene APRT, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APRT-205ENST00000564858 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.56■■■■■ 6.16
APRT-205ENST00000564858 ABCC9O60706 1549 aa48.02■■■■■ 5.28
APRT-205ENST00000564858 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.99■■■■■ 5.27
APRT-205ENST00000564858 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.67■■■■■ 4.9
APRT-205ENST00000564858 NACADO15069 1562 aa45.37■■■■■ 4.85
APRT-205ENST00000564858 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.26■■■■■ 4.84
APRT-205ENST00000564858 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45■■■■■ 4.79
APRT-205ENST00000564858 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.75■■■■■ 4.75
APRT-205ENST00000564858 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.73■■■■■ 4.75
APRT-205ENST00000564858 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.67■■■■■ 4.74
APRT-205ENST00000564858 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
APRT-205ENST00000564858 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.37■■■■■ 4.69
APRT-205ENST00000564858 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.19■■■■■ 4.67
APRT-205ENST00000564858 SCRIBQ14160 1630 aa43.81■■■■■ 4.6
APRT-205ENST00000564858 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.7■■■■■ 4.59
APRT-205ENST00000564858 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.35■■■■■ 4.53
APRT-205ENST00000564858 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
APRT-205ENST00000564858 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.22■■■■■ 4.51
APRT-205ENST00000564858 NCAPD3P42695 1498 aa41.89■■■■■ 4.3
APRT-205ENST00000564858 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.8■■■■■ 4.28
APRT-205ENST00000564858 SMARCA4P51532 1647 aa41.77■■■■■ 4.28
APRT-205ENST00000564858 SMARCA2P51531 1590 aa41.66■■■■■ 4.26
APRT-205ENST00000564858 HMGXB3Q12766 1538 aa41.58■■■■■ 4.25
APRT-205ENST00000564858 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.55■■■■■ 4.24
APRT-205ENST00000564858 ERCC6Q03468 1493 aa41.43■■■■■ 4.22
APRT-205ENST00000564858 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
APRT-205ENST00000564858 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.33■■■■■ 4.21
APRT-205ENST00000564858 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.3■■■■■ 4.2
APRT-205ENST00000564858 CUX2O14529 1486 aa41.29■■■■■ 4.2
APRT-205ENST00000564858 NESP48681 1621 aa41.28■■■■■ 4.2
APRT-205ENST00000564858 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.22■■■■■ 4.19
APRT-205ENST00000564858 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.93■■■■■ 4.14
APRT-205ENST00000564858 WIZO95785 1651 aa40.82■■■■■ 4.12
APRT-205ENST00000564858 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
APRT-205ENST00000564858 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.72■■■■■ 4.11
APRT-205ENST00000564858 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.7■■■■■ 4.11
APRT-205ENST00000564858 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.64■■■■■ 4.1
APRT-205ENST00000564858 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.47■■■■■ 4.07
APRT-205ENST00000564858 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.37■■■■■ 4.05
APRT-205ENST00000564858 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.27■■■■■ 4.04
APRT-205ENST00000564858 WDR62O43379 1518 aa40.25■■■■■ 4.03
APRT-205ENST00000564858 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.22■■■■■ 4.03
APRT-205ENST00000564858 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.19■■■■■ 4.03
APRT-205ENST00000564858 CFTRP13569 1480 aa40.19■■■■■ 4.02
APRT-205ENST00000564858 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
APRT-205ENST00000564858 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.84■■■■□ 3.97
APRT-205ENST00000564858 PRDM2Q13029 1718 aa39.77■■■■□ 3.96
APRT-205ENST00000564858 TRIM41Q8WV44 630 aa39.51■■■■□ 3.92
APRT-205ENST00000564858 OSCARQ8IYS5 282 aa39.45■■■■□ 3.91
APRT-205ENST00000564858 TOPBP1Q92547 1522 aa39.44■■■■□ 3.9
APRT-205ENST00000564858 IFT140Q96RY7 1462 aa39.4■■■■□ 3.9
APRT-205ENST00000564858 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.38■■■■□ 3.89
APRT-205ENST00000564858 ABCC8Q09428 1581 aa39.31■■■■□ 3.88
APRT-205ENST00000564858 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.29■■■■□ 3.88
APRT-205ENST00000564858 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.13■■■■□ 3.85
APRT-205ENST00000564858 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.85
APRT-205ENST00000564858 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.05■■■■□ 3.84
APRT-205ENST00000564858 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.03■■■■□ 3.846e-7■■■■■ 28
APRT-205ENST00000564858 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.94■■■■□ 3.82
APRT-205ENST00000564858 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.94■■■■□ 3.82
APRT-205ENST00000564858 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.94■■■■□ 3.82
APRT-205ENST00000564858 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.93■■■■□ 3.82
APRT-205ENST00000564858 SOGA1O94964 1423 aa38.87■■■■□ 3.81
APRT-205ENST00000564858 CHD1O14646 1710 aa38.84■■■■□ 3.81
APRT-205ENST00000564858 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.82■■■■□ 3.81
APRT-205ENST00000564858 ARHGEF11O15085 1522 aa38.82■■■■□ 3.8
APRT-205ENST00000564858 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.81■■■■□ 3.8
APRT-205ENST00000564858 CUX1P39880 1505 aa38.8■■■■□ 3.8
APRT-205ENST00000564858 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.78■■■■□ 3.8
APRT-205ENST00000564858 FBLN2P98095 1184 aa38.78■■■■□ 3.8
APRT-205ENST00000564858 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.63■■■■□ 3.77
APRT-205ENST00000564858 WDR97A6NE52 1622 aa38.63■■■■□ 3.77
APRT-205ENST00000564858 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.57■■■■□ 3.76
APRT-205ENST00000564858 GRIN2BQ13224 1484 aa38.51■■■■□ 3.76
APRT-205ENST00000564858 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.49■■■■□ 3.75
APRT-205ENST00000564858 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
APRT-205ENST00000564858 ARAP1Q96P48 1450 aa38.46■■■■□ 3.75
APRT-205ENST00000564858 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.4■■■■□ 3.74
APRT-205ENST00000564858 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.38■■■■□ 3.74
APRT-205ENST00000564858 PBRM1Q86U86 1689 aa38.37■■■■□ 3.73
APRT-205ENST00000564858 SYNJ2O15056 1496 aa38.37■■■■□ 3.73
APRT-205ENST00000564858 SYNJ1O43426 1573 aa38.36■■■■□ 3.73
APRT-205ENST00000564858 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.35■■■■□ 3.73
APRT-205ENST00000564858 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.3■■■■□ 3.72
APRT-205ENST00000564858 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.21■■■■□ 3.71
APRT-205ENST00000564858 TOP2BQ02880 1626 aa38.16■■■■□ 3.7
APRT-205ENST00000564858 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.16■■■■□ 3.7
APRT-205ENST00000564858 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
APRT-205ENST00000564858 GRIN2AQ12879 1464 aa38.03■■■■□ 3.68
APRT-205ENST00000564858 ADAMTS12P58397 1594 aa38.02■■■■□ 3.68
APRT-205ENST00000564858 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.9■■■■□ 3.66
APRT-205ENST00000564858 CEP170Q5SW79 1584 aa37.89■■■■□ 3.66
APRT-205ENST00000564858 NUP160Q12769 1436 aa37.88■■■■□ 3.66
APRT-205ENST00000564858 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.87■■■■□ 3.65
APRT-205ENST00000564858 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.84■■■■□ 3.65
APRT-205ENST00000564858 SHROOM2Q13796 1616 aa37.69■■■■□ 3.62
APRT-205ENST00000564858 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
APRT-205ENST00000564858 JPH4Q96JJ6 628 aa37.52■■■■□ 3.6
APRT-205ENST00000564858 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.47■■■■□ 3.59
APRT-205ENST00000564858 KIF27Q86VH2 1401 aa37.44■■■■□ 3.58
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