RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533166.5

BANF1-208, Transcript of barrier to autointegration factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene BANF1, Length 1,135 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1-208ENST00000533166 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.76■■■■■ 7.48
BANF1-208ENST00000533166 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa55.05■■■■■ 6.4
BANF1-208ENST00000533166 ABCC9O60706 1549 aa54.44■■■■■ 6.3
BANF1-208ENST00000533166 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa52.06■■■■■ 5.92
BANF1-208ENST00000533166 NACADO15069 1562 aa51.87■■■■■ 5.89
BANF1-208ENST00000533166 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.87■■■■■ 5.89
BANF1-208ENST00000533166 MYO15BQ96JP2 1530 aa51.37■■■■■ 5.81
BANF1-208ENST00000533166 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.36■■■■■ 5.81
BANF1-208ENST00000533166 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa51■■■■■ 5.75
BANF1-208ENST00000533166 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.92■■■■■ 5.74
BANF1-208ENST00000533166 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.82■■■■■ 5.73
BANF1-208ENST00000533166 BICRAQ9NZM4 1560 aa50.56■■■■■ 5.68
BANF1-208ENST00000533166 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.4■■■■■ 5.66
BANF1-208ENST00000533166 SCRIBQ14160 1630 aa50.32■■■■■ 5.65
BANF1-208ENST00000533166 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.85■■■■■ 5.57
BANF1-208ENST00000533166 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP49.25■■■■■ 5.47
BANF1-208ENST00000533166 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa49.17■■■■■ 5.46
BANF1-208ENST00000533166 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.92■■■■■ 5.42
BANF1-208ENST00000533166 SMARCA4P51532 1647 aa48.03■■■■■ 5.28
BANF1-208ENST00000533166 NCAPD3P42695 1498 aa47.89■■■■■ 5.26
BANF1-208ENST00000533166 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa47.89■■■■■ 5.26
BANF1-208ENST00000533166 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.88■■■■■ 5.25
BANF1-208ENST00000533166 SMARCA2P51531 1590 aa47.75■■■■■ 5.24
BANF1-208ENST00000533166 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.65■■■■■ 5.22
BANF1-208ENST00000533166 HMGXB3Q12766 1538 aa47.61■■■■■ 5.21
BANF1-208ENST00000533166 PEG3Q9GZU2 1588 aa47.51■■■■■ 5.2
BANF1-208ENST00000533166 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
BANF1-208ENST00000533166 WIZO95785 1651 aa47.11■■■■■ 5.13
BANF1-208ENST00000533166 NESP48681 1621 aa46.99■■■■■ 5.11
BANF1-208ENST00000533166 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP46.91■■■■■ 5.1
BANF1-208ENST00000533166 ERCC6Q03468 1493 aa46.9■■■■■ 5.1
BANF1-208ENST00000533166 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa46.69■■■■■ 5.06
BANF1-208ENST00000533166 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
BANF1-208ENST00000533166 CUX2O14529 1486 aa46.51■■■■■ 5.04
BANF1-208ENST00000533166 CADPSQ9ULU8 1353 aa46.48■■■■■ 5.03
BANF1-208ENST00000533166 PDS5BQ9NTI5 1447 aa46.39■■■■■ 5.02
BANF1-208ENST00000533166 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa46.37■■■■■ 5.01
BANF1-208ENST00000533166 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
BANF1-208ENST00000533166 CFTRP13569 1480 aa46.12■■■■■ 4.97
BANF1-208ENST00000533166 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.02■■■■■ 4.96
BANF1-208ENST00000533166 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.99■■■■■ 4.95
BANF1-208ENST00000533166 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.99■■■■■ 4.95
BANF1-208ENST00000533166 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.95■■■■■ 4.95
BANF1-208ENST00000533166 WDR62O43379 1518 aa45.84■■■■■ 4.93
BANF1-208ENST00000533166 PRDM2Q13029 1718 aa45.69■■■■■ 4.9
BANF1-208ENST00000533166 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.66■■■■■ 4.9
BANF1-208ENST00000533166 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP45.58■■■■■ 4.89
BANF1-208ENST00000533166 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.45■■■■■ 4.87
BANF1-208ENST00000533166 TOPBP1Q92547 1522 aa45.2■■■■■ 4.83
BANF1-208ENST00000533166 DNMBPQ6XZF7 1577 aa45.08■■■■■ 4.81
BANF1-208ENST00000533166 ABCC8Q09428 1581 aa45.07■■■■■ 4.81
BANF1-208ENST00000533166 IFT140Q96RY7 1462 aa44.99■■■■■ 4.79
BANF1-208ENST00000533166 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
BANF1-208ENST00000533166 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.78■■■■■ 4.76
BANF1-208ENST00000533166 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
BANF1-208ENST00000533166 CUX1P39880 1505 aa44.72■■■■■ 4.75
BANF1-208ENST00000533166 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP44.68■■■■■ 4.74
BANF1-208ENST00000533166 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa44.65■■■■■ 4.74
BANF1-208ENST00000533166 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.63■■■■■ 4.73
BANF1-208ENST00000533166 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP44.59■■■■■ 4.733e-6■■■■□ 19.4
BANF1-208ENST00000533166 SOGA1O94964 1423 aa44.58■■■■■ 4.73
BANF1-208ENST00000533166 OSCARQ8IYS5 282 aa44.53■■■■■ 4.72
BANF1-208ENST00000533166 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP44.44■■■■■ 4.71
BANF1-208ENST00000533166 WDR97A6NE52 1622 aa44.25■■■■■ 4.67
BANF1-208ENST00000533166 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.24■■■■■ 4.67
BANF1-208ENST00000533166 CHD1O14646 1710 aa44.2■■■■■ 4.67
BANF1-208ENST00000533166 SYNJ1O43426 1573 aa44.19■■■■■ 4.66
BANF1-208ENST00000533166 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa44.16■■■■■ 4.66
BANF1-208ENST00000533166 TOP2BQ02880 1626 aa44.16■■■■■ 4.66
BANF1-208ENST00000533166 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.16■■■■■ 4.66
BANF1-208ENST00000533166 FBLN2P98095 1184 aa44.15■■■■■ 4.66
BANF1-208ENST00000533166 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa44.13■■■■■ 4.65
BANF1-208ENST00000533166 GRIN2BQ13224 1484 aa44.1■■■■■ 4.65
BANF1-208ENST00000533166 GAPVD1Q14C86 1478 aa44.06■■■■■ 4.64
BANF1-208ENST00000533166 TRIM41Q8WV44 630 aa44.05■■■■■ 4.64
BANF1-208ENST00000533166 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP44.02■■■■■ 4.64
BANF1-208ENST00000533166 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa44.01■■■■■ 4.64
BANF1-208ENST00000533166 PBRM1Q86U86 1689 aa44■■■■■ 4.63
BANF1-208ENST00000533166 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.91■■■■■ 4.62
BANF1-208ENST00000533166 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.91■■■■■ 4.62
BANF1-208ENST00000533166 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.91■■■■■ 4.62
BANF1-208ENST00000533166 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.91■■■■■ 4.62
BANF1-208ENST00000533166 SYNJ2O15056 1496 aa43.87■■■■■ 4.61
BANF1-208ENST00000533166 ARHGEF11O15085 1522 aa43.85■■■■■ 4.61
BANF1-208ENST00000533166 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.7■■■■■ 4.59
BANF1-208ENST00000533166 ADAMTS12P58397 1594 aa43.64■■■■■ 4.58
BANF1-208ENST00000533166 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.58■■■■■ 4.57
BANF1-208ENST00000533166 GRIN2AQ12879 1464 aa43.56■■■■■ 4.56
BANF1-208ENST00000533166 FHAD1B1AJZ9 1412 aa43.52■■■■■ 4.56
BANF1-208ENST00000533166 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.49■■■■■ 4.55
BANF1-208ENST00000533166 ARAP1Q96P48 1450 aa43.49■■■■■ 4.55
BANF1-208ENST00000533166 CEP170Q5SW79 1584 aa43.39■■■■■ 4.54
BANF1-208ENST00000533166 NUP160Q12769 1436 aa43.37■■■■■ 4.53
BANF1-208ENST00000533166 KIF27Q86VH2 1401 aa43.32■■■■■ 4.53
BANF1-208ENST00000533166 IGF1RP08069 1367 aa43.22■■■■■ 4.51
BANF1-208ENST00000533166 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.14■■■■■ 4.5
BANF1-208ENST00000533166 CUL7Q14999 1698 aa43.09■■■■■ 4.49
BANF1-208ENST00000533166 SHROOM2Q13796 1616 aa43.08■■■■■ 4.49
BANF1-208ENST00000533166 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.01■■■■■ 4.48
BANF1-208ENST00000533166 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa42.95■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms