Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 MBD1-221ENST00000589867 673 ntTSL 318.34■□□□□ 0.532e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-213ENST00000586118 1012 ntTSL 318.28■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.472e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.412e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-227ENST00000592060 1952 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.372e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.372e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.32e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.292e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.292e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-219ENST00000589733 767 ntTSL 216.27■□□□□ 0.22e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.352e-6■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 CDC45-211ENST00000491520 723 ntTSL 519.62■□□□□ 0.733e-7■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 CDC45-209ENST00000483431 712 ntTSL 518.59■□□□□ 0.573e-7■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 CDC45-210ENST00000487669 736 ntTSL 317.14■□□□□ 0.333e-7■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 HSPA9-204ENST00000504902 887 ntTSL 515.46■□□□□ 0.073e-7■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 CDC45-207ENST00000455750 568 ntTSL 213.51□□□□□ -0.253e-7■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 CDC45-206ENST00000438587 552 ntTSL 47.47□□□□□ -1.213e-7■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-208ENST00000526686 740 ntTSL 1 (best)3.96□□□□□ -1.782e-23■■□□□ 12
UTP18Q9Y5J1 TRRAP-203ENST00000417523 550 ntTSL 416.76■□□□□ 0.272e-51■■□□□ 11.9
UTP18Q9Y5J1 TRRAP-201ENST00000355540 12590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.132e-51■■□□□ 11.9
UTP18Q9Y5J1 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-51■■□□□ 11.9
UTP18Q9Y5J1 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.172e-51■■□□□ 11.9
UTP18Q9Y5J1 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.352e-51■■□□□ 11.9
UTP18Q9Y5J1 RPL4-204ENST00000563473 475 ntTSL 35.81□□□□□ -1.483e-15■■□□□ 11.9
UTP18Q9Y5J1 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.643e-15■■□□□ 11.9
UTP18Q9Y5J1 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.583e-7■■□□□ 11.9
UTP18Q9Y5J1 HSPA9-202ENST00000501917 275 ntTSL 33.25□□□□□ -1.893e-7■■□□□ 11.9
UTP18Q9Y5J1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.21e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.721e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.85□□□□□ -1.952e-17■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.422e-10■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.642e-10■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-10■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.051e-23■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.641e-23■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-23■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.21e-23■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)13.36□□□□□ -0.271e-23■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-201ENST00000227378 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.281e-23■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-207ENST00000526110 1924 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.321e-23■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-215ENST00000532091 2301 ntTSL 512.92□□□□□ -0.341e-23■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.541e-23■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 RPSA-207ENST00000478027 1227 ntTSL 212.26□□□□□ -0.453e-17■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 211.68□□□□□ -0.543e-17■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 RPSA-209ENST00000495394 2058 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.643e-17■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.733e-17■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.153e-17■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.15□□□□□ -1.753e-17■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.217e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.537e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.45■□□□□ 0.387e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.127e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.097e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 TPI1-202ENST00000396705 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.47e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 TPI1-208ENST00000495834 820 ntTSL 212.28□□□□□ -0.447e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 TPI1-207ENST00000493987 839 ntTSL 311.78□□□□□ -0.527e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 TPI1-203ENST00000462761 374 ntTSL 311.74□□□□□ -0.537e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 TPI1-209ENST00000535434 1587 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.577e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 59.62□□□□□ -0.877e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 56.8□□□□□ -1.327e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 53.66□□□□□ -1.827e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 53.61□□□□□ -1.837e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.167e-6■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SLC25A39-205ENST00000585636 561 ntTSL 224.09■■□□□ 1.458e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SLC25A39-206ENST00000585695 1121 ntTSL 224.09■■□□□ 1.458e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.458e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.328e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.148e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SLC25A39-210ENST00000588315 1409 ntTSL 221.89■■□□□ 1.098e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.058e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.918e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 CNPY2-207ENST00000551276 556 ntTSL 520.65■□□□□ 0.98e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 AC073896.1-203ENST00000548360 512 ntTSL 420.65■□□□□ 0.98e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 CNPY2-210ENST00000551720 586 ntTSL 320.65■□□□□ 0.98e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SEMA3B-208ENST00000456210 2065 ntTSL 220.64■□□□□ 0.898e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SLC25A39-209ENST00000588049 839 ntTSL 520.54■□□□□ 0.888e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.888e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.848e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.798e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SEMA3B-201ENST00000416295 1088 ntTSL 519.19■□□□□ 0.668e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.668e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.638e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 CNPY2-206ENST00000548013 817 ntTSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.598e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 AC073896.1-202ENST00000547423 566 ntTSL 418.59■□□□□ 0.578e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.568e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 CNPY2-208ENST00000551286 484 ntTSL 518.4■□□□□ 0.548e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 SEMA3B-207ENST00000441915 2710 ntTSL 1 (best)18.2■□□□□ 0.58e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 CNPY2-202ENST00000546388 670 ntTSL 1 (best)17.9■□□□□ 0.468e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 FRAS1-204ENST00000508909 2297 ntTSL 217.63■□□□□ 0.418e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 CNPY2-211ENST00000553164 666 ntTSL 517.52■□□□□ 0.48e-7■■□□□ 11.8
UTP18Q9Y5J1 RPTOR-209ENST00000575542 5536 ntTSL 1 (best)17.28■□□□□ 0.368e-7■■□□□ 11.8
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