RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416295.1

SEMA3B-201, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-201ENST00000416295 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.65■■■■■ 4.58
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.81■■■■□ 3.8
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SEMA3B-201ENST00000416295 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.53■■■■□ 3.44
SEMA3B-201ENST00000416295 NACADO15069 1562 aa36.49■■■■□ 3.43
SEMA3B-201ENST00000416295 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.43■■■■□ 3.42
SEMA3B-201ENST00000416295 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.37■■■■□ 3.41
SEMA3B-201ENST00000416295 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.31■■■■□ 3.4
SEMA3B-201ENST00000416295 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.14■■■■□ 3.38
SEMA3B-201ENST00000416295 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.6■■■■□ 3.29
SEMA3B-201ENST00000416295 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.53■■■■□ 3.286e-8■■■□□ 19.2
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SEMA3B-201ENST00000416295 SCRIBQ14160 1630 aa35.37■■■■□ 3.25
SEMA3B-201ENST00000416295 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.36■■■■□ 3.25
SEMA3B-201ENST00000416295 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.1■■■■□ 3.21
SEMA3B-201ENST00000416295 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.52■■■■□ 3.12
SEMA3B-201ENST00000416295 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.51■■■■□ 3.11
SEMA3B-201ENST00000416295 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.39■■■■□ 3.1
SEMA3B-201ENST00000416295 SMARCA4P51532 1647 aa33.86■■■■□ 3.01
SEMA3B-201ENST00000416295 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
SEMA3B-201ENST00000416295 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.68■■■□□ 2.98
SEMA3B-201ENST00000416295 NCAPD3P42695 1498 aa33.67■■■□□ 2.98
SEMA3B-201ENST00000416295 SMARCA2P51531 1590 aa33.67■■■□□ 2.98
SEMA3B-201ENST00000416295 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.61■■■□□ 2.97
SEMA3B-201ENST00000416295 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.55■■■□□ 2.96
SEMA3B-201ENST00000416295 HMGXB3Q12766 1538 aa33.52■■■□□ 2.96
SEMA3B-201ENST00000416295 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.42■■■□□ 2.94
SEMA3B-201ENST00000416295 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.91
SEMA3B-201ENST00000416295 WIZO95785 1651 aa33.23■■■□□ 2.91
SEMA3B-201ENST00000416295 ERCC6Q03468 1493 aa33■■■□□ 2.87
SEMA3B-201ENST00000416295 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
SEMA3B-201ENST00000416295 CUX2O14529 1486 aa32.88■■■□□ 2.85
SEMA3B-201ENST00000416295 NESP48681 1621 aa32.82■■■□□ 2.84
SEMA3B-201ENST00000416295 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.78■■■□□ 2.84
SEMA3B-201ENST00000416295 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.69■■■□□ 2.82
SEMA3B-201ENST00000416295 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.57■■■□□ 2.8
SEMA3B-201ENST00000416295 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.53■■■□□ 2.8
SEMA3B-201ENST00000416295 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.52■■■□□ 2.8
SEMA3B-201ENST00000416295 CFTRP13569 1480 aa32.5■■■□□ 2.79
SEMA3B-201ENST00000416295 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.44■■■□□ 2.78
SEMA3B-201ENST00000416295 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
SEMA3B-201ENST00000416295 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.31■■■□□ 2.76
SEMA3B-201ENST00000416295 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.28■■■□□ 2.76
SEMA3B-201ENST00000416295 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.23■■■□□ 2.75
SEMA3B-201ENST00000416295 PRDM2Q13029 1718 aa32.21■■■□□ 2.75
SEMA3B-201ENST00000416295 WDR62O43379 1518 aa32.15■■■□□ 2.74
SEMA3B-201ENST00000416295 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.95■■■□□ 2.71
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCC8Q09428 1581 aa31.83■■■□□ 2.69
SEMA3B-201ENST00000416295 TOPBP1Q92547 1522 aa31.79■■■□□ 2.68
SEMA3B-201ENST00000416295 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.76■■■□□ 2.67
SEMA3B-201ENST00000416295 IFT140Q96RY7 1462 aa31.6■■■□□ 2.65
SEMA3B-201ENST00000416295 CUX1P39880 1505 aa31.54■■■□□ 2.64
SEMA3B-201ENST00000416295 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
SEMA3B-201ENST00000416295 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.45■■■□□ 2.62
SEMA3B-201ENST00000416295 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
SEMA3B-201ENST00000416295 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
SEMA3B-201ENST00000416295 SOGA1O94964 1423 aa31.4■■■□□ 2.62
SEMA3B-201ENST00000416295 OSCARQ8IYS5 282 aa31.39■■■□□ 2.62
SEMA3B-201ENST00000416295 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.38■■■□□ 2.61
SEMA3B-201ENST00000416295 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.35■■■□□ 2.61
SEMA3B-201ENST00000416295 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.3■■■□□ 2.6
SEMA3B-201ENST00000416295 TOP2BQ02880 1626 aa31.29■■■□□ 2.6
SEMA3B-201ENST00000416295 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.27■■■□□ 2.6
SEMA3B-201ENST00000416295 SYNJ1O43426 1573 aa31.26■■■□□ 2.59
SEMA3B-201ENST00000416295 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.24■■■□□ 2.591e-7■■■■□ 23.3
SEMA3B-201ENST00000416295 WDR97A6NE52 1622 aa31.24■■■□□ 2.59
SEMA3B-201ENST00000416295 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.16■■■□□ 2.58
SEMA3B-201ENST00000416295 TRIM41Q8WV44 630 aa31.15■■■□□ 2.58
SEMA3B-201ENST00000416295 GRIN2BQ13224 1484 aa31.04■■■□□ 2.56
SEMA3B-201ENST00000416295 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.04■■■□□ 2.56
SEMA3B-201ENST00000416295 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.02■■■□□ 2.56
SEMA3B-201ENST00000416295 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.97■■■□□ 2.55
SEMA3B-201ENST00000416295 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.97■■■□□ 2.55
SEMA3B-201ENST00000416295 CHD1O14646 1710 aa30.95■■■□□ 2.54
SEMA3B-201ENST00000416295 PBRM1Q86U86 1689 aa30.93■■■□□ 2.54
SEMA3B-201ENST00000416295 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.92■■■□□ 2.54
SEMA3B-201ENST00000416295 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.92■■■□□ 2.54
SEMA3B-201ENST00000416295 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.92■■■□□ 2.54
SEMA3B-201ENST00000416295 FBLN2P98095 1184 aa30.88■■■□□ 2.53
SEMA3B-201ENST00000416295 ARHGEF11O15085 1522 aa30.87■■■□□ 2.53
SEMA3B-201ENST00000416295 SYNJ2O15056 1496 aa30.84■■■□□ 2.53
SEMA3B-201ENST00000416295 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
SEMA3B-201ENST00000416295 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.79■■■□□ 2.52
SEMA3B-201ENST00000416295 KIF27Q86VH2 1401 aa30.74■■■□□ 2.51
SEMA3B-201ENST00000416295 ADAMTS12P58397 1594 aa30.72■■■□□ 2.51
SEMA3B-201ENST00000416295 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.69■■■□□ 2.5
SEMA3B-201ENST00000416295 GRIN2AQ12879 1464 aa30.63■■■□□ 2.49
SEMA3B-201ENST00000416295 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.63■■■□□ 2.49
SEMA3B-201ENST00000416295 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.59■■■□□ 2.49
SEMA3B-201ENST00000416295 IGF1RP08069 1367 aa30.57■■■□□ 2.48
SEMA3B-201ENST00000416295 ARAP1Q96P48 1450 aa30.56■■■□□ 2.48
SEMA3B-201ENST00000416295 CUL7Q14999 1698 aa30.52■■■□□ 2.48
SEMA3B-201ENST00000416295 NUP160Q12769 1436 aa30.49■■■□□ 2.47
SEMA3B-201ENST00000416295 CEP170Q5SW79 1584 aa30.45■■■□□ 2.47
SEMA3B-201ENST00000416295 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.41■■■□□ 2.46
SEMA3B-201ENST00000416295 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.38■■■□□ 2.45
SEMA3B-201ENST00000416295 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.26■■■□□ 2.43
SEMA3B-201ENST00000416295 SHROOM2Q13796 1616 aa30.25■■■□□ 2.43
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