RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377095.9

SLC25A39-202, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,565 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-202ENST00000377095 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.27■■■■■ 5
SLC25A39-202ENST00000377095 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.01■■■■■ 4.15
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCC9O60706 1549 aa39.88■■■■□ 3.98
SLC25A39-202ENST00000377095 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.59■■■■□ 3.77
SLC25A39-202ENST00000377095 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.51■■■■□ 3.76
SLC25A39-202ENST00000377095 NACADO15069 1562 aa38.49■■■■□ 3.75
SLC25A39-202ENST00000377095 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.46■■■■□ 3.75
SLC25A39-202ENST00000377095 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.36■■■■□ 3.73
SLC25A39-202ENST00000377095 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.29■■■■□ 3.72
SLC25A39-202ENST00000377095 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.69■■■■□ 3.62
SLC25A39-202ENST00000377095 SCRIBQ14160 1630 aa37.44■■■■□ 3.58
SLC25A39-202ENST00000377095 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.36■■■■□ 3.57
SLC25A39-202ENST00000377095 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.33■■■■□ 3.579e-7■■■□□ 16.1
SLC25A39-202ENST00000377095 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.91■■■■□ 3.5
SLC25A39-202ENST00000377095 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.46■■■■□ 3.43
SLC25A39-202ENST00000377095 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
SLC25A39-202ENST00000377095 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.11■■■■□ 3.37
SLC25A39-202ENST00000377095 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.04■■■■□ 3.36
SLC25A39-202ENST00000377095 SMARCA4P51532 1647 aa35.85■■■■□ 3.33
SLC25A39-202ENST00000377095 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.82■■■■□ 3.32
SLC25A39-202ENST00000377095 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.68■■■■□ 3.3
SLC25A39-202ENST00000377095 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.6■■■■□ 3.29
SLC25A39-202ENST00000377095 NCAPD3P42695 1498 aa35.53■■■■□ 3.28
SLC25A39-202ENST00000377095 SMARCA2P51531 1590 aa35.53■■■■□ 3.28
SLC25A39-202ENST00000377095 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.51■■■■□ 3.27
SLC25A39-202ENST00000377095 HMGXB3Q12766 1538 aa35.36■■■■□ 3.25
SLC25A39-202ENST00000377095 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.36■■■■□ 3.25
SLC25A39-202ENST00000377095 WIZO95785 1651 aa35.31■■■■□ 3.24
SLC25A39-202ENST00000377095 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
SLC25A39-202ENST00000377095 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.91■■■■□ 3.18
SLC25A39-202ENST00000377095 NESP48681 1621 aa34.62■■■■□ 3.13
SLC25A39-202ENST00000377095 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
SLC25A39-202ENST00000377095 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.54■■■■□ 3.12
SLC25A39-202ENST00000377095 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.53■■■■□ 3.12
SLC25A39-202ENST00000377095 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.51■■■■□ 3.11
SLC25A39-202ENST00000377095 CFTRP13569 1480 aa34.36■■■■□ 3.09
SLC25A39-202ENST00000377095 ERCC6Q03468 1493 aa34.31■■■■□ 3.08
SLC25A39-202ENST00000377095 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC25A39-202ENST00000377095 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.22■■■■□ 3.07
SLC25A39-202ENST00000377095 PRDM2Q13029 1718 aa34.14■■■■□ 3.06
SLC25A39-202ENST00000377095 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.09■■■■□ 3.05
SLC25A39-202ENST00000377095 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
SLC25A39-202ENST00000377095 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.01■■■■□ 3.03
SLC25A39-202ENST00000377095 MRC2Q9UBG0 1479 aa33.92■■■■□ 3.02
SLC25A39-202ENST00000377095 CUX2O14529 1486 aa33.89■■■■□ 3.02
SLC25A39-202ENST00000377095 WDR62O43379 1518 aa33.82■■■■□ 3
SLC25A39-202ENST00000377095 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
SLC25A39-202ENST00000377095 TOPBP1Q92547 1522 aa33.59■■■□□ 2.97
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCC8Q09428 1581 aa33.57■■■□□ 2.96
SLC25A39-202ENST00000377095 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.56■■■□□ 2.96
SLC25A39-202ENST00000377095 CUX1P39880 1505 aa33.45■■■□□ 2.95
SLC25A39-202ENST00000377095 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.33■■■□□ 2.93
SLC25A39-202ENST00000377095 IFT140Q96RY7 1462 aa33.29■■■□□ 2.92
SLC25A39-202ENST00000377095 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.29■■■□□ 2.92
SLC25A39-202ENST00000377095 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.27■■■□□ 2.92
SLC25A39-202ENST00000377095 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.23■■■□□ 2.91
SLC25A39-202ENST00000377095 SYNJ1O43426 1573 aa33.23■■■□□ 2.91
SLC25A39-202ENST00000377095 TOP2BQ02880 1626 aa33.22■■■□□ 2.91
SLC25A39-202ENST00000377095 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.22■■■□□ 2.91
SLC25A39-202ENST00000377095 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.19■■■□□ 2.9
SLC25A39-202ENST00000377095 SOGA1O94964 1423 aa33.18■■■□□ 2.9
SLC25A39-202ENST00000377095 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
SLC25A39-202ENST00000377095 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
SLC25A39-202ENST00000377095 WDR97A6NE52 1622 aa33.01■■■□□ 2.87
SLC25A39-202ENST00000377095 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.01■■■□□ 2.872e-7■■■■■ 32.9
SLC25A39-202ENST00000377095 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.97■■■□□ 2.87
SLC25A39-202ENST00000377095 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.83■■■□□ 2.85
SLC25A39-202ENST00000377095 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.8■■■□□ 2.84
SLC25A39-202ENST00000377095 GRIN2BQ13224 1484 aa32.75■■■□□ 2.83
SLC25A39-202ENST00000377095 PBRM1Q86U86 1689 aa32.73■■■□□ 2.83
SLC25A39-202ENST00000377095 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.68■■■□□ 2.82
SLC25A39-202ENST00000377095 TRIM41Q8WV44 630 aa32.67■■■□□ 2.82
SLC25A39-202ENST00000377095 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.64■■■□□ 2.82
SLC25A39-202ENST00000377095 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.6■■■□□ 2.81
SLC25A39-202ENST00000377095 CHD1O14646 1710 aa32.58■■■□□ 2.81
SLC25A39-202ENST00000377095 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.58■■■□□ 2.81
SLC25A39-202ENST00000377095 KIF27Q86VH2 1401 aa32.57■■■□□ 2.8
SLC25A39-202ENST00000377095 OSCARQ8IYS5 282 aa32.54■■■□□ 2.8
SLC25A39-202ENST00000377095 SYNJ2O15056 1496 aa32.52■■■□□ 2.8
SLC25A39-202ENST00000377095 FBLN2P98095 1184 aa32.5■■■□□ 2.79
SLC25A39-202ENST00000377095 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.49■■■□□ 2.79
SLC25A39-202ENST00000377095 ADAMTS12P58397 1594 aa32.48■■■□□ 2.79
SLC25A39-202ENST00000377095 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.47■■■□□ 2.79
SLC25A39-202ENST00000377095 IGF1RP08069 1367 aa32.46■■■□□ 2.79
SLC25A39-202ENST00000377095 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.43■■■□□ 2.78
SLC25A39-202ENST00000377095 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.42■■■□□ 2.78
SLC25A39-202ENST00000377095 GRIN2AQ12879 1464 aa32.34■■■□□ 2.77
SLC25A39-202ENST00000377095 CUL7Q14999 1698 aa32.31■■■□□ 2.76
SLC25A39-202ENST00000377095 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.25■■■□□ 2.75
SLC25A39-202ENST00000377095 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.23■■■□□ 2.75
SLC25A39-202ENST00000377095 NUP160Q12769 1436 aa32.21■■■□□ 2.75
SLC25A39-202ENST00000377095 CEP170Q5SW79 1584 aa32.19■■■□□ 2.74
SLC25A39-202ENST00000377095 EEA1Q15075 1411 aa32.09■■■□□ 2.73
SLC25A39-202ENST00000377095 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.07■■■□□ 2.72
SLC25A39-202ENST00000377095 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.06■■■□□ 2.72
SLC25A39-202ENST00000377095 PRXQ9BXM0 1461 aa32.05■■■□□ 2.72
SLC25A39-202ENST00000377095 ARHGEF11O15085 1522 aa32.02■■■□□ 2.72
SLC25A39-202ENST00000377095 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.01■■■□□ 2.72
SLC25A39-202ENST00000377095 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.01■■■□□ 2.72
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