RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590194.5

SLC25A39-212, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-212ENST00000590194 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.17■■■■■ 5.46
SLC25A39-212ENST00000590194 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.45■■■■■ 4.55
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCC9O60706 1549 aa42.28■■■■■ 4.36
SLC25A39-212ENST00000590194 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.13■■■■■ 4.17
SLC25A39-212ENST00000590194 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
SLC25A39-212ENST00000590194 NACADO15069 1562 aa40.78■■■■■ 4.12
SLC25A39-212ENST00000590194 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.75■■■■■ 4.11
SLC25A39-212ENST00000590194 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.62■■■■■ 4.09
SLC25A39-212ENST00000590194 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.61■■■■■ 4.09
SLC25A39-212ENST00000590194 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.84■■■■□ 3.97
SLC25A39-212ENST00000590194 SCRIBQ14160 1630 aa39.82■■■■□ 3.96
SLC25A39-212ENST00000590194 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.64■■■■□ 3.949e-7■■■□□ 16.1
SLC25A39-212ENST00000590194 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.51■■■■□ 3.92
SLC25A39-212ENST00000590194 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.28■■■■□ 3.88
SLC25A39-212ENST00000590194 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.94■■■■□ 3.82
SLC25A39-212ENST00000590194 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.45■■■■□ 3.75
SLC25A39-212ENST00000590194 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.32■■■■□ 3.72
SLC25A39-212ENST00000590194 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.2■■■■□ 3.71
SLC25A39-212ENST00000590194 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.07■■■■□ 3.69
SLC25A39-212ENST00000590194 SMARCA4P51532 1647 aa38.06■■■■□ 3.68
SLC25A39-212ENST00000590194 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.94■■■■□ 3.66
SLC25A39-212ENST00000590194 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.76■■■■□ 3.64
SLC25A39-212ENST00000590194 SMARCA2P51531 1590 aa37.71■■■■□ 3.63
SLC25A39-212ENST00000590194 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.65■■■■□ 3.62
SLC25A39-212ENST00000590194 NCAPD3P42695 1498 aa37.64■■■■□ 3.62
SLC25A39-212ENST00000590194 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.62■■■■□ 3.61
SLC25A39-212ENST00000590194 WIZO95785 1651 aa37.57■■■■□ 3.6
SLC25A39-212ENST00000590194 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
SLC25A39-212ENST00000590194 HMGXB3Q12766 1538 aa37.47■■■■□ 3.59
SLC25A39-212ENST00000590194 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
SLC25A39-212ENST00000590194 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
SLC25A39-212ENST00000590194 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.75■■■■□ 3.47
SLC25A39-212ENST00000590194 NESP48681 1621 aa36.71■■■■□ 3.47
SLC25A39-212ENST00000590194 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.61■■■■□ 3.45
SLC25A39-212ENST00000590194 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.58■■■■□ 3.45
SLC25A39-212ENST00000590194 CFTRP13569 1480 aa36.46■■■■□ 3.43
SLC25A39-212ENST00000590194 ERCC6Q03468 1493 aa36.4■■■■□ 3.42
SLC25A39-212ENST00000590194 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.36■■■■□ 3.41
SLC25A39-212ENST00000590194 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.24■■■■□ 3.39
SLC25A39-212ENST00000590194 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.21■■■■□ 3.39
SLC25A39-212ENST00000590194 PRDM2Q13029 1718 aa36.16■■■■□ 3.38
SLC25A39-212ENST00000590194 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.11■■■■□ 3.37
SLC25A39-212ENST00000590194 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
SLC25A39-212ENST00000590194 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.95■■■■□ 3.35
SLC25A39-212ENST00000590194 CUX2O14529 1486 aa35.88■■■■□ 3.33
SLC25A39-212ENST00000590194 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
SLC25A39-212ENST00000590194 WDR62O43379 1518 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC25A39-212ENST00000590194 TOPBP1Q92547 1522 aa35.66■■■■□ 3.3
SLC25A39-212ENST00000590194 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.63■■■■□ 3.3
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCC8Q09428 1581 aa35.63■■■■□ 3.29
SLC25A39-212ENST00000590194 CUX1P39880 1505 aa35.56■■■■□ 3.28
SLC25A39-212ENST00000590194 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.5■■■■□ 3.27
SLC25A39-212ENST00000590194 SYNJ1O43426 1573 aa35.39■■■■□ 3.26
SLC25A39-212ENST00000590194 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
SLC25A39-212ENST00000590194 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.38■■■■□ 3.25
SLC25A39-212ENST00000590194 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.35■■■■□ 3.25
SLC25A39-212ENST00000590194 TOP2BQ02880 1626 aa35.33■■■■□ 3.25
SLC25A39-212ENST00000590194 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.31■■■■□ 3.24
SLC25A39-212ENST00000590194 IFT140Q96RY7 1462 aa35.31■■■■□ 3.24
SLC25A39-212ENST00000590194 SOGA1O94964 1423 aa35.29■■■■□ 3.24
SLC25A39-212ENST00000590194 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.28■■■■□ 3.24
SLC25A39-212ENST00000590194 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
SLC25A39-212ENST00000590194 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.18■■■■□ 3.22
SLC25A39-212ENST00000590194 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
SLC25A39-212ENST00000590194 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.05■■■■□ 3.22e-7■■■■■ 32.9
SLC25A39-212ENST00000590194 TRIM41Q8WV44 630 aa35.03■■■■□ 3.2
SLC25A39-212ENST00000590194 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.01■■■■□ 3.2
SLC25A39-212ENST00000590194 WDR97A6NE52 1622 aa35■■■■□ 3.19
SLC25A39-212ENST00000590194 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.86■■■■□ 3.17
SLC25A39-212ENST00000590194 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.86■■■■□ 3.17
SLC25A39-212ENST00000590194 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.83■■■■□ 3.17
SLC25A39-212ENST00000590194 GRIN2BQ13224 1484 aa34.78■■■■□ 3.16
SLC25A39-212ENST00000590194 PBRM1Q86U86 1689 aa34.74■■■■□ 3.15
SLC25A39-212ENST00000590194 KIF27Q86VH2 1401 aa34.72■■■■□ 3.15
SLC25A39-212ENST00000590194 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.71■■■■□ 3.15
SLC25A39-212ENST00000590194 FBLN2P98095 1184 aa34.63■■■■□ 3.13
SLC25A39-212ENST00000590194 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
SLC25A39-212ENST00000590194 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.6■■■■□ 3.13
SLC25A39-212ENST00000590194 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.59■■■■□ 3.13
SLC25A39-212ENST00000590194 IGF1RP08069 1367 aa34.54■■■■□ 3.12
SLC25A39-212ENST00000590194 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.54■■■■□ 3.12
SLC25A39-212ENST00000590194 SYNJ2O15056 1496 aa34.5■■■■□ 3.11
SLC25A39-212ENST00000590194 CHD1O14646 1710 aa34.5■■■■□ 3.11
SLC25A39-212ENST00000590194 ADAMTS12P58397 1594 aa34.48■■■■□ 3.11
SLC25A39-212ENST00000590194 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.46■■■■□ 3.11
SLC25A39-212ENST00000590194 OSCARQ8IYS5 282 aa34.45■■■■□ 3.11
SLC25A39-212ENST00000590194 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
SLC25A39-212ENST00000590194 CUL7Q14999 1698 aa34.36■■■■□ 3.09
SLC25A39-212ENST00000590194 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.35■■■■□ 3.09
SLC25A39-212ENST00000590194 GRIN2AQ12879 1464 aa34.34■■■■□ 3.09
SLC25A39-212ENST00000590194 EEA1Q15075 1411 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC25A39-212ENST00000590194 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.28■■■■□ 3.08
SLC25A39-212ENST00000590194 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.17■■■■□ 3.06
SLC25A39-212ENST00000590194 CEP170Q5SW79 1584 aa34.16■■■■□ 3.06
SLC25A39-212ENST00000590194 NUP160Q12769 1436 aa34.14■■■■□ 3.06
SLC25A39-212ENST00000590194 PRXQ9BXM0 1461 aa34.13■■■■□ 3.05
SLC25A39-212ENST00000590194 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.1■■■■□ 3.05
SLC25A39-212ENST00000590194 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.99■■■■□ 3.03
SLC25A39-212ENST00000590194 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.94■■■■□ 3.02
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