RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588315.5

SLC25A39-210, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 2

Gene SLC25A39, Length 1,409 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-210ENST00000588315 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.14■■■■■ 5.46
SLC25A39-210ENST00000588315 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.7■■■■■ 4.59
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCC9O60706 1549 aa43.08■■■■■ 4.49
SLC25A39-210ENST00000588315 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa41.25■■■■■ 4.19
SLC25A39-210ENST00000588315 NACADO15069 1562 aa41.16■■■■■ 4.18
SLC25A39-210ENST00000588315 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.11■■■■■ 4.17
SLC25A39-210ENST00000588315 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
SLC25A39-210ENST00000588315 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.86■■■■■ 4.13
SLC25A39-210ENST00000588315 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.74■■■■■ 4.11
SLC25A39-210ENST00000588315 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40.36■■■■■ 4.05
SLC25A39-210ENST00000588315 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP40.25■■■■■ 4.031e-6■■□□□ 13.7
SLC25A39-210ENST00000588315 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.13■■■■■ 4.02
SLC25A39-210ENST00000588315 SCRIBQ14160 1630 aa39.92■■■■□ 3.98
SLC25A39-210ENST00000588315 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.89■■■■□ 3.98
SLC25A39-210ENST00000588315 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.55■■■■□ 3.92
SLC25A39-210ENST00000588315 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
SLC25A39-210ENST00000588315 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.93■■■■□ 3.82
SLC25A39-210ENST00000588315 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.71■■■■□ 3.79
SLC25A39-210ENST00000588315 SMARCA4P51532 1647 aa38.16■■■■□ 3.7
SLC25A39-210ENST00000588315 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.05■■■■□ 3.68
SLC25A39-210ENST00000588315 NCAPD3P42695 1498 aa38.04■■■■□ 3.68
SLC25A39-210ENST00000588315 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.04■■■■□ 3.68
SLC25A39-210ENST00000588315 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.91■■■■□ 3.66
SLC25A39-210ENST00000588315 SMARCA2P51531 1590 aa37.9■■■■□ 3.66
SLC25A39-210ENST00000588315 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.79■■■■□ 3.64
SLC25A39-210ENST00000588315 HMGXB3Q12766 1538 aa37.79■■■■□ 3.64
SLC25A39-210ENST00000588315 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
SLC25A39-210ENST00000588315 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
SLC25A39-210ENST00000588315 WIZO95785 1651 aa37.45■■■■□ 3.59
SLC25A39-210ENST00000588315 NESP48681 1621 aa37.26■■■■□ 3.55
SLC25A39-210ENST00000588315 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
SLC25A39-210ENST00000588315 ERCC6Q03468 1493 aa37.07■■■■□ 3.52
SLC25A39-210ENST00000588315 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.01■■■■□ 3.52
SLC25A39-210ENST00000588315 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.92■■■■□ 3.5
SLC25A39-210ENST00000588315 CUX2O14529 1486 aa36.78■■■■□ 3.48
SLC25A39-210ENST00000588315 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.77■■■■□ 3.48
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.73■■■■□ 3.47
SLC25A39-210ENST00000588315 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
SLC25A39-210ENST00000588315 CFTRP13569 1480 aa36.66■■■■□ 3.46
SLC25A39-210ENST00000588315 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
SLC25A39-210ENST00000588315 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.62■■■■□ 3.45
SLC25A39-210ENST00000588315 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC25A39-210ENST00000588315 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.44■■■■□ 3.42
SLC25A39-210ENST00000588315 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.43■■■■□ 3.42
SLC25A39-210ENST00000588315 WDR62O43379 1518 aa36.35■■■■□ 3.41
SLC25A39-210ENST00000588315 PRDM2Q13029 1718 aa36.24■■■■□ 3.39
SLC25A39-210ENST00000588315 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
SLC25A39-210ENST00000588315 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36■■■■□ 3.35
SLC25A39-210ENST00000588315 TOPBP1Q92547 1522 aa35.88■■■■□ 3.34
SLC25A39-210ENST00000588315 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.79■■■■□ 3.32
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCC8Q09428 1581 aa35.77■■■■□ 3.32
SLC25A39-210ENST00000588315 IFT140Q96RY7 1462 aa35.69■■■■□ 3.3
SLC25A39-210ENST00000588315 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.63■■■■□ 3.29
SLC25A39-210ENST00000588315 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.58■■■■□ 3.29
SLC25A39-210ENST00000588315 CUX1P39880 1505 aa35.56■■■■□ 3.28
SLC25A39-210ENST00000588315 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.52■■■■□ 3.28
SLC25A39-210ENST00000588315 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa35.46■■■■□ 3.27
SLC25A39-210ENST00000588315 FGD5Q6ZNL6 1462 aa35.45■■■■□ 3.27
SLC25A39-210ENST00000588315 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
SLC25A39-210ENST00000588315 SOGA1O94964 1423 aa35.4■■■■□ 3.26
SLC25A39-210ENST00000588315 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP35.38■■■■□ 3.252e-7■■■■■ 32.9
SLC25A39-210ENST00000588315 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.35■■■■□ 3.25
SLC25A39-210ENST00000588315 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
SLC25A39-210ENST00000588315 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.28■■■■□ 3.24
SLC25A39-210ENST00000588315 TOP2BQ02880 1626 aa35.27■■■■□ 3.24
SLC25A39-210ENST00000588315 SYNJ1O43426 1573 aa35.24■■■■□ 3.23
SLC25A39-210ENST00000588315 OSCARQ8IYS5 282 aa35.23■■■■□ 3.23
SLC25A39-210ENST00000588315 WDR97A6NE52 1622 aa35.15■■■■□ 3.22
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.09■■■■□ 3.21
SLC25A39-210ENST00000588315 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.02■■■■□ 3.2
SLC25A39-210ENST00000588315 GRIN2BQ13224 1484 aa35■■■■□ 3.19
SLC25A39-210ENST00000588315 CHD1O14646 1710 aa34.98■■■■□ 3.19
SLC25A39-210ENST00000588315 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.98■■■■□ 3.19
SLC25A39-210ENST00000588315 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.96■■■■□ 3.19
SLC25A39-210ENST00000588315 FBLN2P98095 1184 aa34.93■■■■□ 3.18
SLC25A39-210ENST00000588315 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.92■■■■□ 3.18
SLC25A39-210ENST00000588315 PBRM1Q86U86 1689 aa34.88■■■■□ 3.17
SLC25A39-210ENST00000588315 SYNJ2O15056 1496 aa34.8■■■■□ 3.16
SLC25A39-210ENST00000588315 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.8■■■■□ 3.16
SLC25A39-210ENST00000588315 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.72■■■■□ 3.15
SLC25A39-210ENST00000588315 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.72■■■■□ 3.15
SLC25A39-210ENST00000588315 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.72■■■■□ 3.15
SLC25A39-210ENST00000588315 ARHGEF11O15085 1522 aa34.69■■■■□ 3.14
SLC25A39-210ENST00000588315 TRIM41Q8WV44 630 aa34.68■■■■□ 3.14
SLC25A39-210ENST00000588315 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.66■■■■□ 3.14
SLC25A39-210ENST00000588315 ADAMTS12P58397 1594 aa34.64■■■■□ 3.14
SLC25A39-210ENST00000588315 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.63■■■■□ 3.13
SLC25A39-210ENST00000588315 KIF27Q86VH2 1401 aa34.59■■■■□ 3.13
SLC25A39-210ENST00000588315 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.57■■■■□ 3.12
SLC25A39-210ENST00000588315 GRIN2AQ12879 1464 aa34.56■■■■□ 3.12
SLC25A39-210ENST00000588315 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.47■■■■□ 3.11
SLC25A39-210ENST00000588315 NUP160Q12769 1436 aa34.46■■■■□ 3.11
SLC25A39-210ENST00000588315 CEP170Q5SW79 1584 aa34.43■■■■□ 3.1
SLC25A39-210ENST00000588315 ARAP1Q96P48 1450 aa34.43■■■■□ 3.1
SLC25A39-210ENST00000588315 IGF1RP08069 1367 aa34.42■■■■□ 3.1
SLC25A39-210ENST00000588315 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.38■■■■□ 3.09
SLC25A39-210ENST00000588315 CUL7Q14999 1698 aa34.34■■■■□ 3.09
SLC25A39-210ENST00000588315 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.29■■■■□ 3.08
SLC25A39-210ENST00000588315 EEA1Q15075 1411 aa34.22■■■■□ 3.07
SLC25A39-210ENST00000588315 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.22■■■■□ 3.07
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