Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.87□□□□□ -0.034e-20■■■■■ 931.7
UTP18Q9Y5J1 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt12.06□□□□□ -0.484e-20■■■■■ 931.7
UTP18Q9Y5J1 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt12.01□□□□□ -0.494e-20■■■■■ 931.7
UTP18Q9Y5J1 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.236e-10■■■■■ 709.4
UTP18Q9Y5J1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.935e-26■■■■■ 153.1
UTP18Q9Y5J1 PMF1-206ENST00000606952 1275 ntTSL 1 (best)17.98■□□□□ 0.475e-26■■■■■ 153.1
UTP18Q9Y5J1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.475e-26■■■■■ 153.1
UTP18Q9Y5J1 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.455e-26■■■■■ 153.1
UTP18Q9Y5J1 PMF1-205ENST00000497069 837 ntTSL 317.08■□□□□ 0.325e-26■■■■■ 153.1
UTP18Q9Y5J1 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.115e-26■■■■■ 153.1
UTP18Q9Y5J1 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.175e-26■■■■■ 153.1
UTP18Q9Y5J1 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.295e-26■■■■■ 153.1
UTP18Q9Y5J1 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.345e-26■■■■■ 153.1
UTP18Q9Y5J1 PMF1-204ENST00000466489 933 ntTSL 1 (best)10.68□□□□□ -0.75e-26■■■■■ 153.1
UTP18Q9Y5J1 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC14.67□□□□□ -0.064e-65■■■■■ 146
UTP18Q9Y5J1 SNORD3D-202ENST00000630092 217 ntBASIC12.06□□□□□ -0.484e-65■■■■■ 146
UTP18Q9Y5J1 SNORD3D-201ENST00000619178 218 ntBASIC12.01□□□□□ -0.494e-65■■■■■ 146
UTP18Q9Y5J1 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.236e-15■■■■■ 113.8
UTP18Q9Y5J1 SNORD3C-201ENST00000580533 581 ntBASIC12.74□□□□□ -0.374e-72■■■■■ 112.4
UTP18Q9Y5J1 SNORD3C-203ENST00000625845 217 nt12.06□□□□□ -0.484e-72■■■■■ 112.4
UTP18Q9Y5J1 SNORD3C-202ENST00000620446 218 nt12.01□□□□□ -0.494e-72■■■■■ 112.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-214ENST00000534206 834 ntTSL 529.48■■■□□ 2.316e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-204ENST00000525861 2058 ntTSL 225.56■■□□□ 1.686e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-211ENST00000531461 1292 ntTSL 224.88■■□□□ 1.576e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-207ENST00000530182 551 ntTSL 524.85■■□□□ 1.576e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-202ENST00000525194 846 ntTSL 1 (best)24.1■■□□□ 1.456e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-201ENST00000278544 3500 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.076e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.336e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-210ENST00000531352 2093 ntTSL 1 (best)12.49□□□□□ -0.416e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-212ENST00000532485 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.866e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-213ENST00000533873 929 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.256e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 ACER3-208ENST00000530334 931 ntTSL 25.92□□□□□ -1.466e-28■■■■■ 106.4
UTP18Q9Y5J1 MIR663AHG-223ENST00000601079 613 ntTSL 524.25■■□□□ 1.474e-77■■■■■ 78.4
UTP18Q9Y5J1 MIR663AHG-236ENST00000610014 475 ntTSL 520.69■□□□□ 0.94e-77■■■■■ 78.4
UTP18Q9Y5J1 MIR663AHG-221ENST00000600225 473 ntTSL 513.87□□□□□ -0.194e-77■■■■■ 78.4
UTP18Q9Y5J1 MIR663AHG-217ENST00000598150 751 ntTSL 516.73■□□□□ 0.277e-77■■■■■ 77.7
UTP18Q9Y5J1 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.093e-10■■■■■ 73.2
UTP18Q9Y5J1 STK3-202ENST00000424861 2065 ntTSL 215.59■□□□□ 0.093e-10■■■■■ 73.2
UTP18Q9Y5J1 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.013e-10■■■■■ 73.2
UTP18Q9Y5J1 STK3-211ENST00000521649 574 ntTSL 411.66□□□□□ -0.543e-10■■■■■ 73.2
UTP18Q9Y5J1 STK3-204ENST00000518165 817 ntTSL 1 (best)7.22□□□□□ -1.253e-10■■■■■ 73.2
UTP18Q9Y5J1 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.353e-10■■■■■ 73.2
UTP18Q9Y5J1 SNORD3A-203ENST00000625876 217 nt12.06□□□□□ -0.481e-323■■■■■ 70.7
UTP18Q9Y5J1 SNORD3A-202ENST00000620232 218 nt12.01□□□□□ -0.491e-323■■■■■ 70.7
UTP18Q9Y5J1 SNORD3A-201ENST00000584923 699 ntBASIC11.13□□□□□ -0.631e-323■■■■■ 70.7
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UTP18Q9Y5J1 MIR663AHG-226ENST00000601901 644 ntTSL 514.13□□□□□ -0.153e-7■■■■■ 66.7
UTP18Q9Y5J1 MIR663AHG-234ENST00000609687 697 ntTSL 513.48□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 66.7
UTP18Q9Y5J1 MIR663AHG-204ENST00000594130 628 ntTSL 513.36□□□□□ -0.273e-7■■■■■ 66.7
UTP18Q9Y5J1 MIR663AHG-208ENST00000596058 665 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 66.7
UTP18Q9Y5J1 MIR663AHG-213ENST00000596767 837 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 66.7
UTP18Q9Y5J1 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 212.06□□□□□ -0.482e-9■■■■■ 58
UTP18Q9Y5J1 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 38.29□□□□□ -1.082e-9■■■■■ 58
UTP18Q9Y5J1 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.12e-9■■■■■ 58
UTP18Q9Y5J1 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.242e-9■■■■■ 58
UTP18Q9Y5J1 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC2.07□□□□□ -2.082e-9■■■■■ 58
UTP18Q9Y5J1 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.6□□□□□ -1.676e-8■■■■■ 56.8
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UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.195e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 322.44■■□□□ 1.185e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.115e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.015e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.765e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-205ENST00000610414 1251 ntTSL 218.86■□□□□ 0.615e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.65e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.575e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-203ENST00000609188 225 ntTSL 518.22■□□□□ 0.515e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-209ENST00000612772 1375 ntTSL 318.14■□□□□ 0.495e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 216.44■□□□□ 0.225e-9■■■■■ 55.6
UTP18Q9Y5J1 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)23.69■■□□□ 1.381e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 220.84■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.81e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 219.94■□□□□ 0.781e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.41e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.61e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.75□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.75□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.81□□□□□ -11e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 55.55□□□□□ -1.521e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 55.22□□□□□ -1.571e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 44.88□□□□□ -1.631e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.16□□□□□ -2.061e-8■■■■■ 54.3
UTP18Q9Y5J1 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.823e-8■■■■■ 53.8
UTP18Q9Y5J1 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.55e-9■■■■■ 51.7
UTP18Q9Y5J1 CEP72-203ENST00000512038 656 ntTSL 217.82■□□□□ 0.445e-9■■■■■ 51.7
UTP18Q9Y5J1 THAP9-AS1-202ENST00000504520 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.263e-11■■■■■ 46.8
UTP18Q9Y5J1 SEC31A-218ENST00000506495 541 ntTSL 410.71□□□□□ -0.693e-11■■■■■ 46.8
UTP18Q9Y5J1 THAP9-AS1-208ENST00000508772 566 ntTSL 410.71□□□□□ -0.693e-11■■■■■ 46.8
UTP18Q9Y5J1 THAP9-AS1-204ENST00000504792 2577 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.83e-11■■■■■ 46.8
UTP18Q9Y5J1 SEC31A-220ENST00000507051 458 ntTSL 49.53□□□□□ -0.883e-11■■■■■ 46.8
UTP18Q9Y5J1 THAP9-AS1-210ENST00000511271 516 ntTSL 28.95□□□□□ -0.983e-11■■■■■ 46.8
UTP18Q9Y5J1 THAP9-AS1-211ENST00000512932 971 ntTSL 28.15□□□□□ -1.13e-11■■■■■ 46.8
UTP18Q9Y5J1 SEC31A-222ENST00000507676 551 ntTSL 48.02□□□□□ -1.133e-11■■■■■ 46.8
UTP18Q9Y5J1 SEC31A-211ENST00000503210 553 ntTSL 47.8□□□□□ -1.163e-11■■■■■ 46.8
UTP18Q9Y5J1 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.433e-11■■■■■ 46.8
UTP18Q9Y5J1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.284e-6■■■■■ 45.2
UTP18Q9Y5J1 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 517.47■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 45.2
UTP18Q9Y5J1 NKD1-203ENST00000566396 748 ntTSL 314.17□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 45.2
UTP18Q9Y5J1 RHOT2-225ENST00000570092 674 ntTSL 326.33■■□□□ 1.819e-8■■■■■ 44.4
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