RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 NISCHQ9Y2I1 1504 aa52.49■■■■■ 5.99
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.56■■■■■ 5.04
SLC25A39-201ENST00000225308 ABCC9O60706 1549 aa45.21■■■■■ 4.83
SLC25A39-201ENST00000225308 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
SLC25A39-201ENST00000225308 NACADO15069 1562 aa43.65■■■■■ 4.58
SLC25A39-201ENST00000225308 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.63■■■■■ 4.57
SLC25A39-201ENST00000225308 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.62■■■■■ 4.57
SLC25A39-201ENST00000225308 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.51■■■■■ 4.56
SLC25A39-201ENST00000225308 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.45■■■■■ 4.55
SLC25A39-201ENST00000225308 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.77■■■■■ 4.44
SLC25A39-201ENST00000225308 SCRIBQ14160 1630 aa42.49■■■■■ 4.39
SLC25A39-201ENST00000225308 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.37■■■■■ 4.37
SLC25A39-201ENST00000225308 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.26■■■■■ 4.369e-7■■■□□ 16.1
SLC25A39-201ENST00000225308 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.88■■■■■ 4.29
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.22■■■■■ 4.19
SLC25A39-201ENST00000225308 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
SLC25A39-201ENST00000225308 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.94■■■■■ 4.14
SLC25A39-201ENST00000225308 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.86■■■■■ 4.13
SLC25A39-201ENST00000225308 SMARCA4P51532 1647 aa40.69■■■■■ 4.1
SLC25A39-201ENST00000225308 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
SLC25A39-201ENST00000225308 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.47■■■■■ 4.07
SLC25A39-201ENST00000225308 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.35■■■■■ 4.05
SLC25A39-201ENST00000225308 SMARCA2P51531 1590 aa40.32■■■■■ 4.05
SLC25A39-201ENST00000225308 PEG3Q9GZU2 1588 aa40.29■■■■■ 4.04
SLC25A39-201ENST00000225308 NCAPD3P42695 1498 aa40.27■■■■■ 4.04
SLC25A39-201ENST00000225308 HMGXB3Q12766 1538 aa40.14■■■■■ 4.02
SLC25A39-201ENST00000225308 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.1■■■■■ 4.01
SLC25A39-201ENST00000225308 WIZO95785 1651 aa40.07■■■■■ 4
SLC25A39-201ENST00000225308 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP40.03■■■■■ 4
SLC25A39-201ENST00000225308 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.63■■■■□ 3.94
SLC25A39-201ENST00000225308 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
SLC25A39-201ENST00000225308 NESP48681 1621 aa39.25■■■■□ 3.87
SLC25A39-201ENST00000225308 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.18■■■■□ 3.86
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.15■■■■□ 3.86
SLC25A39-201ENST00000225308 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.1■■■■□ 3.85
SLC25A39-201ENST00000225308 CFTRP13569 1480 aa38.96■■■■□ 3.83
SLC25A39-201ENST00000225308 ERCC6Q03468 1493 aa38.92■■■■□ 3.82
SLC25A39-201ENST00000225308 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.85■■■■□ 3.81
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.84■■■■□ 3.81
SLC25A39-201ENST00000225308 PRDM2Q13029 1718 aa38.77■■■■□ 3.8
SLC25A39-201ENST00000225308 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.67■■■■□ 3.78
SLC25A39-201ENST00000225308 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.61■■■■□ 3.77
SLC25A39-201ENST00000225308 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.59■■■■□ 3.77
SLC25A39-201ENST00000225308 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.47■■■■□ 3.75
SLC25A39-201ENST00000225308 CUX2O14529 1486 aa38.4■■■■□ 3.74
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR62O43379 1518 aa38.37■■■■□ 3.73
SLC25A39-201ENST00000225308 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.29■■■■□ 3.72
SLC25A39-201ENST00000225308 TOPBP1Q92547 1522 aa38.11■■■■□ 3.69
SLC25A39-201ENST00000225308 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.09■■■■□ 3.69
SLC25A39-201ENST00000225308 ABCC8Q09428 1581 aa38.07■■■■□ 3.68
SLC25A39-201ENST00000225308 CUX1P39880 1505 aa37.95■■■■□ 3.67
SLC25A39-201ENST00000225308 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
SLC25A39-201ENST00000225308 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.78■■■■□ 3.64
SLC25A39-201ENST00000225308 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.75■■■■□ 3.63
SLC25A39-201ENST00000225308 IFT140Q96RY7 1462 aa37.75■■■■□ 3.63
SLC25A39-201ENST00000225308 SYNJ1O43426 1573 aa37.73■■■■□ 3.63
SLC25A39-201ENST00000225308 TOP2BQ02880 1626 aa37.71■■■■□ 3.63
SLC25A39-201ENST00000225308 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.71■■■■□ 3.63
SLC25A39-201ENST00000225308 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
SLC25A39-201ENST00000225308 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.63■■■■□ 3.61
SLC25A39-201ENST00000225308 SOGA1O94964 1423 aa37.61■■■■□ 3.61
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.59■■■■□ 3.61
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR97A6NE52 1622 aa37.5■■■■□ 3.59
SLC25A39-201ENST00000225308 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.49■■■■□ 3.59
SLC25A39-201ENST00000225308 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa37.4■■■■□ 3.58
SLC25A39-201ENST00000225308 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.4■■■■□ 3.582e-7■■■■■ 32.9
SLC25A39-201ENST00000225308 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
SLC25A39-201ENST00000225308 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.26■■■■□ 3.56
SLC25A39-201ENST00000225308 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.2■■■■□ 3.55
SLC25A39-201ENST00000225308 PBRM1Q86U86 1689 aa37.17■■■■□ 3.54
SLC25A39-201ENST00000225308 GRIN2BQ13224 1484 aa37.15■■■■□ 3.54
SLC25A39-201ENST00000225308 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.07■■■■□ 3.53
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM41Q8WV44 630 aa37.04■■■■□ 3.52
SLC25A39-201ENST00000225308 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.03■■■■□ 3.52
SLC25A39-201ENST00000225308 CHD1O14646 1710 aa36.98■■■■□ 3.51
SLC25A39-201ENST00000225308 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.96■■■■□ 3.51
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF27Q86VH2 1401 aa36.95■■■■□ 3.51
SLC25A39-201ENST00000225308 SYNJ2O15056 1496 aa36.88■■■■□ 3.49
SLC25A39-201ENST00000225308 ADAMTS12P58397 1594 aa36.87■■■■□ 3.49
SLC25A39-201ENST00000225308 CHIC1Q5VXU3 224 aa36.84■■■■□ 3.49
SLC25A39-201ENST00000225308 FBLN2P98095 1184 aa36.83■■■■□ 3.49
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.83■■■■□ 3.49
SLC25A39-201ENST00000225308 OSCARQ8IYS5 282 aa36.81■■■■□ 3.48
SLC25A39-201ENST00000225308 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
SLC25A39-201ENST00000225308 IGF1RP08069 1367 aa36.77■■■■□ 3.48
SLC25A39-201ENST00000225308 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.77■■■■□ 3.48
SLC25A39-201ENST00000225308 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.76■■■■□ 3.48
SLC25A39-201ENST00000225308 GRIN2AQ12879 1464 aa36.7■■■■□ 3.47
SLC25A39-201ENST00000225308 CUL7Q14999 1698 aa36.69■■■■□ 3.46
SLC25A39-201ENST00000225308 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.55■■■■□ 3.44
SLC25A39-201ENST00000225308 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa36.55■■■■□ 3.44
SLC25A39-201ENST00000225308 CEP170Q5SW79 1584 aa36.53■■■■□ 3.44
SLC25A39-201ENST00000225308 NUP160Q12769 1436 aa36.52■■■■□ 3.44
SLC25A39-201ENST00000225308 EEA1Q15075 1411 aa36.44■■■■□ 3.42
SLC25A39-201ENST00000225308 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa36.38■■■■□ 3.41
SLC25A39-201ENST00000225308 PRXQ9BXM0 1461 aa36.36■■■■□ 3.41
SLC25A39-201ENST00000225308 CSRNP3Q8WYN3 585 aa36.33■■■■□ 3.41
SLC25A39-201ENST00000225308 ARHGEF11O15085 1522 aa36.32■■■■□ 3.4
SLC25A39-201ENST00000225308 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.29■■■■□ 3.4
SLC25A39-201ENST00000225308 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.29■■■■□ 3.4
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