Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.312e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-231ENST00000492170 241 ntTSL 516.96■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.37e-9■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.284e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RFX2-204ENST00000586302 569 ntTSL 416.83■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 CBX7-205ENST00000477827 526 ntTSL 516.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NEPRO-203ENST00000460410 947 ntTSL 316.65■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NEPRO-220ENST00000494164 741 ntTSL 416.65■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RFX2-217ENST00000590822 310 ntTSL 316.64■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DFFB-208ENST00000475969 2731 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 EVL-209ENST00000554031 819 ntTSL 516.1■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 BRD9-215ENST00000518250 689 ntTSL 315.55■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 EIF4B-210ENST00000550704 1476 ntTSL 515.55■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NAGK-220ENST00000493102 559 ntTSL 415.49■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RFX2-205ENST00000586806 537 ntTSL 315.49■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.064e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-232ENST00000495434 224 ntTSL 515.37■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 EVL-215ENST00000555606 656 ntTSL 315.36■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NAGK-227ENST00000531934 584 ntTSL 515.33■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RFX2-218ENST00000592172 573 ntTSL 415.29■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 AC116353.4-202ENST00000513766 558 ntTSL 515.26■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DFFB-204ENST00000378206 2842 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 PAFAH1B1-203ENST00000570400 661 ntTSL 315.21■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ZNF33B-203ENST00000465206 707 ntTSL 315.15■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 STK24-205ENST00000444574 1590 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SFXN2-203ENST00000480358 2315 ntTSL 514.9□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SYTL4-206ENST00000491602 2076 ntTSL 214.88□□□□□ -0.031e-12■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 PHF20-206ENST00000452270 832 ntTSL 514.84□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-224ENST00000464148 636 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SFXN2-202ENST00000459894 2324 ntTSL 214.76□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NEPRO-219ENST00000491121 578 ntTSL 414.64□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 HDAC3-213ENST00000492506 830 ntTSL 214.52□□□□□ -0.085e-8■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RFX2-208ENST00000587321 337 ntTSL 314.46□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 EIF4B-205ENST00000549481 1097 ntTSL 514.39□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.124e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 LINC02340-202ENST00000620494 573 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RFX2-206ENST00000586940 787 ntTSL 313.95□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DFFB-209ENST00000477548 2923 ntTSL 1 (best)13.94□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 LETMD1-222ENST00000550274 809 ntTSL 213.93□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 LETMD1-231ENST00000551931 705 ntTSL 313.93□□□□□ -0.182e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RBM28-204ENST00000478061 932 ntTSL 313.84□□□□□ -0.198e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 PHF20-201ENST00000339089 1997 ntTSL 213.82□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NAGK-202ENST00000418807 2343 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.214e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DFFB-207ENST00000468793 2986 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 STK24-201ENST00000376547 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 PHF20-211ENST00000481202 1635 ntTSL 1 (best)13.55□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 PLD3-213ENST00000488311 750 ntTSL 213.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-229ENST00000483159 790 ntTSL 513.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-233ENST00000495899 790 ntTSL 213.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RFX2-221ENST00000592473 577 ntTSL 413.46□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SYTL4-201ENST00000263033 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.271e-12■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 CDC14B-211ENST00000481149 689 ntTSL 313.33□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DLEU2-202ENST00000421758 692 ntTSL 1 (best)13.33□□□□□ -0.281e-12■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MVK-202ENST00000392727 1770 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DFFB-201ENST00000338895 3105 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 PAFAH1B1-204ENST00000571289 589 ntTSL 213.17□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.312e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-203ENST00000346141 1490 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.314e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 AMBRA1-207ENST00000529553 586 ntTSL 313□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-205ENST00000394239 1680 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.344e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RFX2-215ENST00000589742 565 ntTSL 412.89□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DFFB-202ENST00000339350 3005 ntTSL 1 (best)12.8□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 PHF20-202ENST00000374000 1814 ntTSL 1 (best)12.69□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RAPGEF5-204ENST00000420196 660 ntTSL 512.65□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 RAPGEF5-209ENST00000475788 728 ntTSL 312.65□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MVK-213ENST00000625889 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 SPRY4-201ENST00000344120 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 AP1B1-211ENST00000482818 3560 ntTSL 1 (best)12.52□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MPP3-203ENST00000466083 328 ntTSL 312.47□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-221ENST00000430433 864 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MRPL55-203ENST00000336520 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NAGK-212ENST00000472519 2857 ntTSL 212.35□□□□□ -0.434e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-216ENST00000613721 2184 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.444e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 DFFB-210ENST00000481945 636 ntTSL 312.19□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 MACF1-209ENST00000462103 627 ntTSL 312.08□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-211ENST00000591548 1577 ntTSL 1 (best)11.99□□□□□ -0.494e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 TUBD1-201ENST00000325752 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.514e-6■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NEPRO-224ENST00000496340 520 ntTSL 411.87□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 NEPRO-221ENST00000494575 556 ntTSL 411.87□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 129.2
SF3B1O75533 GALNT6-202ENST00000543196 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.517e-9■■■■■ 129.2
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1426.6 ms