RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491602.1

SYTL4-206, Transcript of synaptotagmin like 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYTL4, Length 2,076 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4-206ENST00000491602 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.09■■■□□ 2.57
SYTL4-206ENST00000491602 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.89■■□□□ 1.89
SYTL4-206ENST00000491602 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SYTL4-206ENST00000491602 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.72■■□□□ 1.71
SYTL4-206ENST00000491602 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.68■■□□□ 1.7
SYTL4-206ENST00000491602 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.58■■□□□ 1.69
SYTL4-206ENST00000491602 ABCC9O60706 1549 aa25.43■■□□□ 1.66
SYTL4-206ENST00000491602 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.16■■□□□ 1.62
SYTL4-206ENST00000491602 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SYTL4-206ENST00000491602 NACADO15069 1562 aa24.99■■□□□ 1.59
SYTL4-206ENST00000491602 SCRIBQ14160 1630 aa24.95■■□□□ 1.59
SYTL4-206ENST00000491602 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.73■■□□□ 1.55
SYTL4-206ENST00000491602 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.5■■□□□ 1.51
SYTL4-206ENST00000491602 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.44■■□□□ 1.5
SYTL4-206ENST00000491602 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.28■■□□□ 1.48
SYTL4-206ENST00000491602 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
SYTL4-206ENST00000491602 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.17■■□□□ 1.46
SYTL4-206ENST00000491602 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.13■■□□□ 1.45
SYTL4-206ENST00000491602 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
SYTL4-206ENST00000491602 WIZO95785 1651 aa23.95■■□□□ 1.42
SYTL4-206ENST00000491602 HRCP23327 699 aa23.95■■□□□ 1.42
SYTL4-206ENST00000491602 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
SYTL4-206ENST00000491602 SMARCA4P51532 1647 aa23.86■■□□□ 1.41
SYTL4-206ENST00000491602 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.8■■□□□ 1.4
SYTL4-206ENST00000491602 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.73■■□□□ 1.39
SYTL4-206ENST00000491602 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SYTL4-206ENST00000491602 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.5■■□□□ 1.35
SYTL4-206ENST00000491602 SMARCA2P51531 1590 aa23.44■■□□□ 1.34
SYTL4-206ENST00000491602 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.42■■□□□ 1.34
SYTL4-206ENST00000491602 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.42■■□□□ 1.34
SYTL4-206ENST00000491602 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SYTL4-206ENST00000491602 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SYTL4-206ENST00000491602 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SYTL4-206ENST00000491602 TRIM41Q8WV44 630 aa23.37■■□□□ 1.33
SYTL4-206ENST00000491602 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
SYTL4-206ENST00000491602 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SYTL4-206ENST00000491602 NCAPD3P42695 1498 aa23.12■■□□□ 1.29
SYTL4-206ENST00000491602 ABCC8Q09428 1581 aa23.09■■□□□ 1.29
SYTL4-206ENST00000491602 HMGXB3Q12766 1538 aa23.08■■□□□ 1.29
SYTL4-206ENST00000491602 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.98■■□□□ 1.27
SYTL4-206ENST00000491602 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SYTL4-206ENST00000491602 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.88■■□□□ 1.25
SYTL4-206ENST00000491602 SYNJ1O43426 1573 aa22.77■■□□□ 1.24
SYTL4-206ENST00000491602 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
SYTL4-206ENST00000491602 CFTRP13569 1480 aa22.7■■□□□ 1.22
SYTL4-206ENST00000491602 SOGA1O94964 1423 aa22.69■■□□□ 1.22
SYTL4-206ENST00000491602 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.65■■□□□ 1.22
SYTL4-206ENST00000491602 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.61■■□□□ 1.21
SYTL4-206ENST00000491602 TOP2BQ02880 1626 aa22.56■■□□□ 1.2
SYTL4-206ENST00000491602 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.56■■□□□ 1.2
SYTL4-206ENST00000491602 PRDM2Q13029 1718 aa22.55■■□□□ 1.2
SYTL4-206ENST00000491602 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL4-206ENST00000491602 CUX1P39880 1505 aa22.52■■□□□ 1.2
SYTL4-206ENST00000491602 NESP48681 1621 aa22.46■■□□□ 1.19
SYTL4-206ENST00000491602 CEP162Q5TB80 1403 aa22.45■■□□□ 1.18
SYTL4-206ENST00000491602 EEA1Q15075 1411 aa22.45■■□□□ 1.18
SYTL4-206ENST00000491602 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.43■■□□□ 1.18
SYTL4-206ENST00000491602 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.4■■□□□ 1.18
SYTL4-206ENST00000491602 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SYTL4-206ENST00000491602 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.34■■□□□ 1.17
SYTL4-206ENST00000491602 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SYTL4-206ENST00000491602 GOLGA3Q08378 1498 aa22.29■■□□□ 1.16
SYTL4-206ENST00000491602 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.25■■□□□ 1.15
SYTL4-206ENST00000491602 KIF21BO75037 1637 aa22.23■■□□□ 1.15
SYTL4-206ENST00000491602 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
SYTL4-206ENST00000491602 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.2■■□□□ 1.14
SYTL4-206ENST00000491602 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SYTL4-206ENST00000491602 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.19■■□□□ 1.14
SYTL4-206ENST00000491602 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.18■■□□□ 1.14
SYTL4-206ENST00000491602 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.15■■□□□ 1.14
SYTL4-206ENST00000491602 TOPBP1Q92547 1522 aa22.14■■□□□ 1.14
SYTL4-206ENST00000491602 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.12■■□□□ 1.13
SYTL4-206ENST00000491602 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYTL4-206ENST00000491602 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYTL4-206ENST00000491602 KIF27Q86VH2 1401 aa22.11■■□□□ 1.13
SYTL4-206ENST00000491602 PRXQ9BXM0 1461 aa22.1■■□□□ 1.13
SYTL4-206ENST00000491602 CUX2O14529 1486 aa22.09■■□□□ 1.13
SYTL4-206ENST00000491602 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SYTL4-206ENST00000491602 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.07■■□□□ 1.12
SYTL4-206ENST00000491602 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.06■■□□□ 1.12
SYTL4-206ENST00000491602 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22■■□□□ 1.11
SYTL4-206ENST00000491602 CLIP1P30622 1438 aa22■■□□□ 1.11
SYTL4-206ENST00000491602 IGF1RP08069 1367 aa21.99■■□□□ 1.11
SYTL4-206ENST00000491602 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SYTL4-206ENST00000491602 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.96■■□□□ 1.11
SYTL4-206ENST00000491602 VPS8Q8N3P4 1428 aa21.95■■□□□ 1.1
SYTL4-206ENST00000491602 WDR97A6NE52 1622 aa21.92■■□□□ 1.1
SYTL4-206ENST00000491602 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
SYTL4-206ENST00000491602 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
SYTL4-206ENST00000491602 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.84■■□□□ 1.09
SYTL4-206ENST00000491602 NEUROD1Q13562 356 aa21.83■■□□□ 1.09
SYTL4-206ENST00000491602 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.82■■□□□ 1.08
SYTL4-206ENST00000491602 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SYTL4-206ENST00000491602 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SYTL4-206ENST00000491602 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
SYTL4-206ENST00000491602 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
SYTL4-206ENST00000491602 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.8■■□□□ 1.08
SYTL4-206ENST00000491602 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
SYTL4-206ENST00000491602 APLP2Q06481 763 aa21.76■■□□□ 1.07
SYTL4-206ENST00000491602 ARAP1Q96P48 1450 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms