RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495434.1

MRPL55-232, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L55, humanhuman

TSL 5

Gene MRPL55, Length 224 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL55-232ENST00000495434 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.5■■■■□ 3.11
MRPL55-232ENST00000495434 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.8■■■□□ 2.52
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MRPL55-232ENST00000495434 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.09■■■□□ 2.25
MRPL55-232ENST00000495434 NACADO15069 1562 aa29.03■■■□□ 2.24
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MRPL55-232ENST00000495434 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.83■■■□□ 2.21
MRPL55-232ENST00000495434 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
MRPL55-232ENST00000495434 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.59■■■□□ 2.17
MRPL55-232ENST00000495434 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.41■■■□□ 2.14
MRPL55-232ENST00000495434 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.11
MRPL55-232ENST00000495434 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.2■■■□□ 2.11
MRPL55-232ENST00000495434 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.03■■■□□ 2.08
MRPL55-232ENST00000495434 SCRIBQ14160 1630 aa28■■■□□ 2.07
MRPL55-232ENST00000495434 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.97■■■□□ 2.07
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MRPL55-232ENST00000495434 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.42■■□□□ 1.98
MRPL55-232ENST00000495434 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.27■■□□□ 1.96
MRPL55-232ENST00000495434 SMARCA4P51532 1647 aa26.81■■□□□ 1.88
MRPL55-232ENST00000495434 NCAPD3P42695 1498 aa26.79■■□□□ 1.88
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MRPL55-232ENST00000495434 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.74■■□□□ 1.87
MRPL55-232ENST00000495434 SMARCA2P51531 1590 aa26.71■■□□□ 1.87
MRPL55-232ENST00000495434 HMGXB3Q12766 1538 aa26.63■■□□□ 1.85
MRPL55-232ENST00000495434 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.59■■□□□ 1.85
MRPL55-232ENST00000495434 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.55■■□□□ 1.84
MRPL55-232ENST00000495434 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
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MRPL55-232ENST00000495434 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
MRPL55-232ENST00000495434 ERCC6Q03468 1493 aa26.15■■□□□ 1.78
MRPL55-232ENST00000495434 NESP48681 1621 aa26.14■■□□□ 1.77
MRPL55-232ENST00000495434 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.12■■□□□ 1.77
MRPL55-232ENST00000495434 CUX2O14529 1486 aa26.02■■□□□ 1.76
MRPL55-232ENST00000495434 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.98■■□□□ 1.75
MRPL55-232ENST00000495434 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
MRPL55-232ENST00000495434 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.95■■□□□ 1.74
MRPL55-232ENST00000495434 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.83■■□□□ 1.73
MRPL55-232ENST00000495434 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
MRPL55-232ENST00000495434 CFTRP13569 1480 aa25.78■■□□□ 1.72
MRPL55-232ENST00000495434 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.67■■□□□ 1.7
MRPL55-232ENST00000495434 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.66■■□□□ 1.7
MRPL55-232ENST00000495434 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.66■■□□□ 1.7
MRPL55-232ENST00000495434 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.65■■□□□ 1.7
MRPL55-232ENST00000495434 WDR62O43379 1518 aa25.59■■□□□ 1.69
MRPL55-232ENST00000495434 PRDM2Q13029 1718 aa25.56■■□□□ 1.68
MRPL55-232ENST00000495434 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.49■■□□□ 1.67
MRPL55-232ENST00000495434 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
MRPL55-232ENST00000495434 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
MRPL55-232ENST00000495434 ABCC8Q09428 1581 aa25.27■■□□□ 1.64
MRPL55-232ENST00000495434 TOPBP1Q92547 1522 aa25.22■■□□□ 1.63
MRPL55-232ENST00000495434 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.18■■□□□ 1.62
MRPL55-232ENST00000495434 IFT140Q96RY7 1462 aa25.15■■□□□ 1.62
MRPL55-232ENST00000495434 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
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MRPL55-232ENST00000495434 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
MRPL55-232ENST00000495434 CUX1P39880 1505 aa24.93■■□□□ 1.58
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MRPL55-232ENST00000495434 SOGA1O94964 1423 aa24.89■■□□□ 1.58
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MRPL55-232ENST00000495434 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.88■■□□□ 1.57
MRPL55-232ENST00000495434 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.85■■□□□ 1.57
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MRPL55-232ENST00000495434 WDR97A6NE52 1622 aa24.82■■□□□ 1.56
MRPL55-232ENST00000495434 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
MRPL55-232ENST00000495434 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.69■■□□□ 1.54
MRPL55-232ENST00000495434 TOP2BQ02880 1626 aa24.68■■□□□ 1.54
MRPL55-232ENST00000495434 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.68■■□□□ 1.54
MRPL55-232ENST00000495434 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.67■■□□□ 1.54
MRPL55-232ENST00000495434 GRIN2BQ13224 1484 aa24.64■■□□□ 1.53
MRPL55-232ENST00000495434 CHD1O14646 1710 aa24.63■■□□□ 1.53
MRPL55-232ENST00000495434 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
MRPL55-232ENST00000495434 SYNJ1O43426 1573 aa24.61■■□□□ 1.53
MRPL55-232ENST00000495434 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.6■■□□□ 1.53
MRPL55-232ENST00000495434 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.6■■□□□ 1.53
MRPL55-232ENST00000495434 FBLN2P98095 1184 aa24.57■■□□□ 1.52
MRPL55-232ENST00000495434 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.57■■□□□ 1.52
MRPL55-232ENST00000495434 PBRM1Q86U86 1689 aa24.54■■□□□ 1.52
MRPL55-232ENST00000495434 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
MRPL55-232ENST00000495434 SYNJ2O15056 1496 aa24.51■■□□□ 1.51
MRPL55-232ENST00000495434 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.47■■□□□ 1.51
MRPL55-232ENST00000495434 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.47■■□□□ 1.51
MRPL55-232ENST00000495434 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.47■■□□□ 1.51
MRPL55-232ENST00000495434 TRIM41Q8WV44 630 aa24.45■■□□□ 1.5
MRPL55-232ENST00000495434 ARHGEF11O15085 1522 aa24.45■■□□□ 1.5
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MRPL55-232ENST00000495434 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.38■■□□□ 1.49
MRPL55-232ENST00000495434 ADAMTS12P58397 1594 aa24.33■■□□□ 1.49
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MRPL55-232ENST00000495434 NUP160Q12769 1436 aa24.23■■□□□ 1.47
MRPL55-232ENST00000495434 ARAP1Q96P48 1450 aa24.23■■□□□ 1.47
MRPL55-232ENST00000495434 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.22■■□□□ 1.47
MRPL55-232ENST00000495434 KIF27Q86VH2 1401 aa24.2■■□□□ 1.46
MRPL55-232ENST00000495434 CEP170Q5SW79 1584 aa24.18■■□□□ 1.46
MRPL55-232ENST00000495434 IGF1RP08069 1367 aa24.15■■□□□ 1.46
MRPL55-232ENST00000495434 CUL7Q14999 1698 aa24.1■■□□□ 1.45
MRPL55-232ENST00000495434 SHROOM2Q13796 1616 aa24.07■■□□□ 1.44
MRPL55-232ENST00000495434 JPH4Q96JJ6 628 aa23.99■■□□□ 1.43
MRPL55-232ENST00000495434 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.99■■□□□ 1.43
MRPL55-232ENST00000495434 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.98■■□□□ 1.43
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