Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B0

UNK, RING finger protein unkempt homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UNKQ9C0B0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UNKQ9C0B0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
UNKQ9C0B0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UNKQ9C0B0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
UNKQ9C0B0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UNKQ9C0B0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UNKQ9C0B0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UNKQ9C0B0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UNKQ9C0B0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UNKQ9C0B0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms