RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443720.6

MKRN1-202, Transcript of makorin ring finger protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene MKRN1, Length 1,601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN1-202ENST00000443720 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.21■■■■■ 7.23
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MKRN1-202ENST00000443720 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.63■■■■■ 5.54
MKRN1-202ENST00000443720 NACADO15069 1562 aa49.58■■■■■ 5.53
MKRN1-202ENST00000443720 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.38■■■■■ 5.5
MKRN1-202ENST00000443720 SCRIBQ14160 1630 aa48.51■■■■■ 5.36
MKRN1-202ENST00000443720 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.32■■■■■ 5.33
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MKRN1-202ENST00000443720 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.44■■■■■ 5.03
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MKRN1-202ENST00000443720 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.99■■■■■ 4.95
MKRN1-202ENST00000443720 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.96■■■■■ 4.95
MKRN1-202ENST00000443720 SMARCA2P51531 1590 aa45.94■■■■■ 4.95
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MKRN1-202ENST00000443720 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.5■■■■■ 4.71
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MKRN1-202ENST00000443720 NESP48681 1621 aa44.34■■■■■ 4.69
MKRN1-202ENST00000443720 PRDM2Q13029 1718 aa44.16■■■■■ 4.66
MKRN1-202ENST00000443720 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.05■■■■■ 4.64
MKRN1-202ENST00000443720 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.99■■■■■ 4.63
MKRN1-202ENST00000443720 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.83■■■■■ 4.61
MKRN1-202ENST00000443720 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.82■■■■■ 4.61
MKRN1-202ENST00000443720 ERCC6Q03468 1493 aa43.76■■■■■ 4.6
MKRN1-202ENST00000443720 ABCC8Q09428 1581 aa43.74■■■■■ 4.59
MKRN1-202ENST00000443720 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.64■■■■■ 4.58
MKRN1-202ENST00000443720 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.59■■■■■ 4.57
MKRN1-202ENST00000443720 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.53■■■■■ 4.56
MKRN1-202ENST00000443720 CUX1P39880 1505 aa43.5■■■■■ 4.55
MKRN1-202ENST00000443720 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.48■■■■■ 4.55
MKRN1-202ENST00000443720 SYNJ1O43426 1573 aa43.46■■■■■ 4.55
MKRN1-202ENST00000443720 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.44■■■■■ 4.54
MKRN1-202ENST00000443720 TRIM41Q8WV44 630 aa43.41■■■■■ 4.54
MKRN1-202ENST00000443720 TOPBP1Q92547 1522 aa43.41■■■■■ 4.54
MKRN1-202ENST00000443720 TOP2BQ02880 1626 aa43.4■■■■■ 4.54
MKRN1-202ENST00000443720 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.39■■■■■ 4.54
MKRN1-202ENST00000443720 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.38■■■■■ 4.53
MKRN1-202ENST00000443720 WDR62O43379 1518 aa43.33■■■■■ 4.53
MKRN1-202ENST00000443720 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.18■■■■■ 4.5
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MKRN1-202ENST00000443720 CUX2O14529 1486 aa42.95■■■■■ 4.47
MKRN1-202ENST00000443720 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.93■■■■■ 4.46
MKRN1-202ENST00000443720 IFT140Q96RY7 1462 aa42.86■■■■■ 4.45
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MKRN1-202ENST00000443720 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.8■■■■■ 4.44
MKRN1-202ENST00000443720 WDR97A6NE52 1622 aa42.73■■■■■ 4.43
MKRN1-202ENST00000443720 KIF27Q86VH2 1401 aa42.65■■■■■ 4.42
MKRN1-202ENST00000443720 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42.61■■■■■ 4.41
MKRN1-202ENST00000443720 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
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MKRN1-202ENST00000443720 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.52■■■■■ 4.4
MKRN1-202ENST00000443720 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
MKRN1-202ENST00000443720 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.5■■■■■ 4.392e-7■□□□□ 10.5
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MKRN1-202ENST00000443720 PBRM1Q86U86 1689 aa42.3■■■■■ 4.36
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MKRN1-202ENST00000443720 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.12■■■■■ 4.33
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MKRN1-202ENST00000443720 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.98■■■■■ 4.31
MKRN1-202ENST00000443720 SYNJ2O15056 1496 aa41.91■■■■■ 4.3
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MKRN1-202ENST00000443720 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.84■■■■■ 4.29
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MKRN1-202ENST00000443720 GRIN2AQ12879 1464 aa41.79■■■■■ 4.28
MKRN1-202ENST00000443720 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
MKRN1-202ENST00000443720 CHD1O14646 1710 aa41.69■■■■■ 4.26
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MKRN1-202ENST00000443720 NUP160Q12769 1436 aa41.54■■■■■ 4.24
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